【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于基因检测，具体涉及一种急性淋巴细胞白血病相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途。
技术介绍
1、all诊断采用micm(细胞形态学、免疫学、细胞遗传学和分子遗传学)诊断模式，最基本的检查应包括细胞形态学、免疫表型，免疫分型采用多参数流式细胞术，最低诊断分型可以参考egil标准。中国成人急性淋巴细胞白血病诊断与治疗指南(2021年版)建议开展二代测序技术(ngs)检测基因突变和基因拷贝数变异(如ikzf1和cdkn2a/b缺失等)，为患者诊断分型、预后判断、靶向治疗提供依据。
2、二代测序技术作为micm中分子生物学的一部分，灵敏度高，作为金标准的一代sanger测序对突变频率10％以下的位点不能准确检出，而二代测序仍然有较好的检出；通量大，通过探针杂交捕获的方式可以一次检测数百个基因甚至全基因组上的所有序列。此外，二代测序(ngs)对可测量残留病灶(mrd)的评估优于传统检测，ngs评估的早期mrd阴性与最佳生存率相关。
3、本专利技术在二代测序的基础上，探寻一种可以快速完成对急性淋巴细胞白血病相关基因的突变检测的检测方法和试剂盒。
技术实现思路
1、针对上述存在的问题，本专利技术的第一目的是提供一组捕获探针，用于达到有效快速捕获急性淋巴细胞白血病相关基因的目的。
2、本专利技术的第二目的是提供上述捕获探针的用途，用于制造一种检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒，缓解了现有技术中缺少一种能够有效快速捕获急性淋巴细胞
3、本专利技术的第三目的是提供检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒，用于达到快速建立急性淋巴细胞白血病相关基因的靶向文库的目的。
4、本专利技术的第四目的是提供一种文库构建方法，实现了对急性淋巴细胞白血病相关基因有效富集的目的，并且该方法以极低起始量的基因组dna为模板，大大降低了等待杂交反应的时间，提高了杂交效率。
5、本专利技术的第五目的是提供一种建库试剂盒的用途，达到了快速对急性淋巴细胞白血病相关基因精准分型的目的。
6、为了实现上述目的，本专利技术的技术方案如下：
7、一种捕获探针，所述捕获探针包括碱基序列seq id no:1～1000中的至少一种。
8、作为本专利技术的进一步优选，一种捕获探针的用途，所述捕获探针用于制造一种检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒。
9、一种检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒，包括至少一组捕获探针，所述捕获探针包括碱基序列seq id no:1～1000中的至少一种。
10、一种文库构建方法，使用上述捕获探针或建库试剂盒捕获急性淋巴细胞白血病相关基因。
11、作为本专利技术的进一步优选，所述急性淋巴细胞白血病相关基因包括：abl1、braf、ccnd3、cdkn1a、cdkn2a、cdkn2b、cnot3、crebbp、crlf2、ctcf、dnm2、dnmt3a、ebf1、ect2l、eed、ep300、erg、etv6、ezh2、fbxw7、flt3、g6pd、gata2、gata3、idh1、idh2、ikzf1、ikzf2、ikzf3、il7r、jak1、jak2、jak3、kdm6a、kit、kmt2a、kmt2d、kras、lef1、mtor、nf1、notch1、nras、nsd2、nt5c2、nudt15、pax5、phf6、prps1、pten、ptpn11、rb1、reln、rpl10、runx1、setd2、sh2b3、stat5b、suz12、tbl1xr1、tp53、tpmt、wt1、xpc、btg1、rpl5。
12、一种建库试剂盒的用途，至少包括下述中的一种：(1)检测急性淋巴细胞白血病相关基因；(2)检测急性淋巴细胞白血病相关基因中的变异情况；(3)遗急性淋巴细胞白血病相关基因筛查检测；(4)预测个体对急性淋巴细胞白血病易感倾向；(5)监测患者的微小病灶残留。
13、作为本专利技术的进一步优选，所述文库构建方法包括以下步骤：
14、(a)样品提取：收集待测样品并提取基因组dna；
15、(b)dna片段化：将dna打断形成dna片段；
16、(c)末端修复：对所述dna片段进行末端修复和添加a-tailing，然后进行纯化；
17、(d)接头并纯化；
18、(e)文库杂交并捕获。
19、一种文库构建方法在检测急性淋巴细胞白血病相关基因中的用途，文库构建方法得到的文库进行测序，将测序结果与数据库进行对比。
20、综上所述，本专利技术具有以下有益效果：
21、本专利技术设计的探针具有对文库进行杂交捕获和富集耗时短，效率高的优点。
22、本专利技术制造出的建库试剂盒，可利用杂交捕获法检测急性淋巴细胞白血病相关66种基因以及其变异情况；仅需微量基因组dna用于构建dna文库，模板起始量可低至20ng；将酶切打断、末端补平和加a尾在一个体系里完成，然后再利用探针对文库进行杂交捕获和富集，具有耗时短，效率高的优点。
23、本专利技术制造出的建库试剂盒中的快速杂交体系，杂交时间最短可至15min即可实现一般过夜杂交的效率，最终得到文库片段大小在300～450bp左右，能够兼容illumina各种测序平台进行测序。
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1.一组捕获探针，其特征在于，所述捕获探针包括碱基序列SEQ ID
2.如权利要求1所述的捕获探针的用途，其特征在于，所述捕获探针用于制造一种检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒。
3.一种检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒，其特征在于，包括至少一组捕获探针，所述捕获探针包括碱基序列SEQ ID NO:1～1000中的至少一种。
4.一种文库构建方法，其特征在于，使用如权利要求1所述的捕获探针或权利要求3所述的建库试剂盒捕获急性淋巴细胞白血病相关基因。
5.一种如权3所述建库试剂盒的用途，其特征在于，至少包括下述中的一种：
6.根据权利要求2～5任一所述的一种文库构建方法，其特征在于，所述急性淋巴细胞白血病相关基因包括：
【技术特征摘要】
1.一组捕获探针，其特征在于，所述捕获探针包括碱基序列seq id
2.如权利要求1所述的捕获探针的用途，其特征在于，所述捕获探针用于制造一种检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒。
3.一种检测急性淋巴细胞白血病多个基因型的建库试剂盒，其特征在于，包括至少一组捕获探针，所述捕获探针包括碱基序列seq id no:1～10...
【专利技术属性】
技术研发人员：孙怡彤，叶生鑫，周靖雯，陈文良，
申请(专利权)人：南京艾迪康医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：
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