The invention provides a SNaPshot kit to detect a variety of deafness gene polymorphism, deafness gene polymorphism detection including GJB2 gene loci rs80338943, rs111033204, 508_511dupAACG; SLC26A4, rs121908363, rs121908362 genes rs111033318, rs200455203, rs111033380, rs111033313; mitochondrial DNA rs267606617.
【技术实现步骤摘要】
检测10个位点耳聋基因多态性的SNaPshot试剂盒
本专利技术涉及分子生物学诊断领域和遗传病领域。具体地,本专利技术提供了一种检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂盒。
技术介绍
先天性耳聋是最常见的出生缺陷之一,也是最常见的人类感觉系统疾病,发病率为0.1%-0.3%。60%的耳聋与遗传因素相关。在这些遗传因素中,主要包括GJB2、SLC26A4、GJB3基因和线粒体DNAm.1555A>G和m.1494C>T位点。在中国新生儿耳聋基因突变筛查中,GJB2基因突变具有较高的携带率,约2.6%,SLC26A4基因突变携带率约为1.9%,新生儿线粒体DNAm.1555A>G均质突变占0.1%,GJB3基因突变仅在少数患者中发现。GJB2基因编码的Cx26表达于耳蜗,位于内耳血管纹、基底膜和螺旋缘,与先天性遗传性中重度耳聋相关,GJB2基因突变后,K+进入内淋巴液的循环受到影响,导致常显或常隐感音神经性耳聋(DFNB1或DFNA3)。GJB3基因编码的Cx31是缝隙连接蛋白的一员,在耳蜗和听神经内表达,突变可导致常显或常隐非综合性耳聋、周围神 ...
【技术保护点】
一种检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂盒,检测的耳聋基因多态性位点包括GJB2基因位点rs80338943、rs111033204、508_511dupAACG;SLC26A4基因rs111033318、rs121908362、rs121908363、rs200455203、rs111033380、rs111033313;线粒体DNArs267606617。
【技术特征摘要】
1.一种检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂盒,检测的耳聋基因多态性位点包括GJB2基因位点rs80338943、rs111033204、508_511dupAACG;SLC26A4基因rs111033318、rs121908362、rs121908363、rs200455203、rs111033380、rs111033313;线粒体DNArs267606617。2.权利要求1所述的试剂盒,其中包含检测这些多态性位点的扩增引物和测序引物。3.权利要求2所述的试剂盒,其中扩增引物分别为:测序引物分别为:4.权利要求3所述的试剂盒,扩增引物在进行扩增时,扩增试剂比例如下:其中,扩增引物的比例均为1:1。5.权利要求4所述的试剂盒,扩增产物在进行微测序时,测序试剂比例如下:试剂体积(μL)SNaPshotReadyMix1.25ddH2O4.255倍稀释的测序缓冲液1.5引物混合物2total9.06.权利要求3-5任一项所述的试剂盒,扩增产物在进行微测序时,测序引物浓度比例如下:引物名称终浓度(pmol)测序引物SNE1-DFN-235delC0.15测序引物SNE1-DFN-delAT0.2测序引物SNE1-DFN-dupAACG0.6测序引物SNE4-SLC26A4-5890.4测序引物SNE4-SLC26A4-919-22测序引物SNE3-SLC26A4-1707+50.5测序引物SNE3-SLC26A4-20270.2测序引物SNE3-SLC26A4-19750.4测序引物SNE3-SLC26A4-21680.2测序引物SNE3-SLC26A4-21620.67.权利要求1-6任一项所述的试剂盒,该试剂盒使用方法包括步骤:DNA提取;扩增产物纯化;延伸产物纯化;测序分析。8.一种利用Snapshot技术一次性检测多个耳聋基因多态性位点的非诊断科研方法,具体包括步骤:DNA提取:以人血的采集样本进行DNA提供,具体参考公司有关《血液基因组DNA提取标准操作流程》,提取完毕的DNA计算其浓度并稀释至5-10μg/mL;试剂准备:a)配置二倍的MasterMix,这其中包括dNTP、MgCl2、热启动超保真DNA聚合酶、缓冲液,室温融化后,短暂...
【专利技术属性】
技术研发人员:赵薇薇,胡昌明,徐艳艳,陈白雪,贺书香,刘晶星,于世辉,
申请(专利权)人:广州金域医学检验中心有限公司,
类型:发明
国别省市:广东,44
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