TOP2A基因表达量荧光定量PCR检测试剂盒及其应用制造技术

技术编号:12746879 阅读:74 留言:0更新日期:2016-01-21 14:40
本发明专利技术涉及一种检测人TOP2A基因突变的荧光定量PCR试剂盒,主要包括特异性引物和PCR反应试剂;所述特异性引物序列如下:上游引物:5’-GGGAGAGTGATGACTTCCATATGGA-3’下游引物:5’-AACACCTTCCCCAAACTAAATTCAG-3’;本发明专利技术的有益效果主要体现在:本发明专利技术试剂盒用于检测人TOP2A基因表达量,特异性好,灵敏度高,具有较好应用前景。

【技术实现步骤摘要】
【专利说明】T0P2A基因表达量黄光定量PCR检测试剂盒及其应用 (-)
本专利技术设及一种人拓扑异构IIαΟ?Ρ2Α)基因巧光定量PCR检测试剂盒及其应 用。 (二)
技术介绍
拓扑异构酶(Topoisomerase,TOP)是存在于细胞核内的一类酶,能够催化DNA链 的断裂和结合,从而抑制DNA的拓扑状态。哺乳动物主要存在两种拓扑异构酶,拓扑异构酶 I通过形成短暂的单链裂解结合环,催化DNA复制的拓扑异构状态的变化。相反拓扑异构酶 II引起瞬间双链酶桥的断裂,然后开通和再封闭,W改变DNA的拓扑状态。拓扑异构酶II 又包括TOPIIa和TOPΙΙβ两种同工酶。TOPIIa的编码基因为T0P2A,位于17ql2.21。 T0P2A在快速增殖细胞中含量最高,其表达仅限于S期到G2/M期的细胞周期。TOPIIa在 分化差的肿瘤组织中的表达明显高于分化良好的肿瘤组织,在正常组织中则很少表达,运 使得它可能成为抗肿瘤治疗的有效祀点。 临床上的拓扑异构酶II抑制剂就是针对该祀点的抗肿瘤药物。拓扑异构酶II抑 制剂根据作用方式不同分为嵌入型和非嵌入型两类。嵌入型抑制剂系通过其分子中类似嚷 岭碱或喀晚碱的多环结构嵌入到拓扑异构酶II与DNA结合部位的双链之间,从而干扰了酶 将DNA断端重新接合的正常功能,并进一步造成DNA链断裂损伤,导致细胞死亡。运一类药 物主要有:叮晚类(m-AMSA),蔥环类(阿霉素、柔红霉素等),蔥二酬类(米托蔥酿、蔥双咪 腺)。非嵌入性抑制剂的作用模式尚不清楚。 研究表明,T0P2A基因异常对蔥环类药物化疗的疗效有预测作用。有淋己结转移的 乳泉癌患者被随机分成CEF化疗组和CNM化疗组,分析T0P2A和化疗疗效的关系。结果显 示,T0P2A基因变异(扩增或缺失)的乳腺癌患者,接受CEF化疗者的RFS(皿=0. 3,P= 0. 005)和0S化R= 0. 33,P= 0. 008)明显优于CMF组;相反T0P2A基因无变异的患者,CEF 和CMF的疗效之间并无无明显的差别。在一项分析5000例乳腺癌者肥R-2和T0P2A基因 改变与化疗疗效关系的试验中,发现单纯使用AC方案化疗,肥R-2和T0P2A基因同时高表 达的患者生存明显优于仅有肥R-2基因高表达组(P= 0. 004),因此,认为T0P2A基因扩增 可预测乳腺癌含蔥环类化疗药物的疗效。对278例乳腺癌患者的研究表明,T0P2A基因表 达的乳腺癌患者中pCR率要明显高于T0P2A未表达的患者(P<0. 0001)。ΜΕΤΑ分析也同样 证明,Τ0Ρ2Α基因扩增可作为乳腺癌含葱环类化疗疗效的预测因子。运些研究结果均提示 我们在乳腺癌患者中,TOP2Α基因变异与葱环类辅助化疗的作用有一定的关联,可作为药 物选择的参考。 (Ξ)
技术实现思路
阳0化]本专利技术目的是提供一种人T0P2A基因巧光定量PCR检测试剂盒,用于检测人T0P2A基因的表达,特异性好,灵敏度高。 本专利技术采用的技术方案是: 一种检测人T0P2A基因突变的巧光定量PCR试剂盒,主要包括特异性引物和PCR 反应试剂;所述特异性引物序列如下: 上游引物:5,-GGGAGAGTGATGACTTCCATATGGA-3 ' 下游引物:5 ' -AACACCTTCCCCAAACTAAATTCAG-3,。 所述PCR反应试剂为本领域常规试剂,主要包括:dNTP、反转录缓冲液、PCR缓冲 液、Mg2\双蒸水、逆转录酶、Tag酶等,也可直接采用市售PCRMix成品。 所述试剂盒还可包括人T0P2A基因检测标准品,所述标准品序列如下: 5'-AATGTGAGGCGATTATTTTAAGTAATTATCTTACCAAGCCCAAGACTGGTTTTAAAGTTACCTG AAGCTCTTAACTTCCTCCCCTCTGAATTTAGTTTGGGGAAGGTGTTTTTAGTACAAGACATCAAAGTGAAGTAAA GCCCAAGTGTTCTT-3>。 t不准品的制备:WGenebank中发布的人T0P2A的基因序列为柄;准,W健康体检 人的外周血mRNA为模板,反转录为cDNA。W该cDNA为模板,用上述引物扩增出特异性的 PCR片段,然后把该PCR片段插入到T载体中,利用大肠杆菌D册α菌株转化并提取质粒, nano化ορ2000测定浓度和纯度,W此质粒作为检测分析中的标准品。 本专利技术还设及所述的试剂盒在检测人Τ0Ρ2Α基因表达量中的应用。 具体的,所述应用方法如下: (1)采集待测样本,提取RNA;样本可W是血液、穿刺组织、石蜡组织、手术切除组 织等; (2)W样品RNA为模板,进行反转录反应,得到样品cDNA; 阳018] 反转录反应:RNA模板0.lug,反转录反应试剂(promega试剂盒),双蒸水;反转录 反应:25°C15min;50°CIhour;85°C5min;4°C,5min。 (3)w梯度浓度的人T0P2A基因检测标准品为模板,加入所述特异性引物和PCR反 应试剂,组成PCR反应体系,进行PCR扩增,绘制标准曲线; W20] (4)W样品cDNA为模板,加入所述特异性引物和PCR反应试剂,组成PCR反 应体系,进行PCR扩增,扩增结果对照标准曲线,获得T0P2A基因表达量。可W样 品cDNA为模板,加入内参 18s特异性引物(F:5' -AGAAACGGCTACCACATCCA-3';R: 5' -CACCAGACTTGCCCTCCA-3')和PCR反应试剂,组成PCR反应体系,进行PCR扩增,监控实 验体系的可行性。 阳02U 所述PCR反应条件如下:95°C预变性2min;95°C变性15s、60°C退火20s、72°C延伸 20s(此处收集巧光信号),40个循环。 本专利技术的有益效果主要体现在:本专利技术试剂盒用于检测人T0P2A基因表达量,特 异性好,灵敏度高,具有较好应用前景。 (四)【附图说明】 图1为标准曲线及3对(癌组织和癌旁组织)临床样本的检测结果; 图2为内参18s的扩增曲线。 (五)【具体实施方式】下面结合具体实施例对本专利技术进行进一步描述,但本专利技术的保护范围并不仅限于 此: 阳0%] 实施例1: (1)样品准备:取患者手术切除组织,提取RNA(浓度不小于l(K)ng,A260/280不小 于 1. 9)。 (2)样品处理:取lOOng的RNA,加入反转录试剂(promega试剂盒)5μ1,补双蒸 水到20μ1,按如下条件进行反转录反应:25°C15分钟;50°C1小时;85°C5分钟;4°C,5分 钟。 (3)巧光定量PCR反应: 利用(2)中反转录产物为模板进行:取上述反转录模板5μ1,加入0. 1ml的8联 排管中(含巧光定量PCR反应试剂15μ1)。同时在标 阳03U 准管中(含巧光定量PCR反应试剂15μ1)加入相应梯度浓度的标准品;在内参管 (含巧光定量PCR反应试剂15μ1,引物为内参18s特异性引物)中加入5μ1上述cDNA模 板。混匀。然后加入巧光定量反应引物,上机检测。在ABISt巧化ePlus仪器上,选择标 准曲线法和SYBR染料,进行PCR反应;巧光定量PCR反应试剂组成如下:总体积:15 μ 1 ;本文档来自技高网
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【技术保护点】
检测人TOP2A基因突变的荧光定量PCR试剂盒,主要包括特异性引物和PCR反应试剂;其特征在于所述特异性引物序列如下:上游引物:5’‑GGGAGAGTGATGACTTCCATATGGA‑3’下游引物:5’‑AACACCTTCCCCAAACTAAATTCAG‑3’。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘小龙张云杨福太高运臻李雨阳
申请(专利权)人:苏州贝斯麦医疗仪器有限公司
类型:发明
国别省市:江苏;32

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