高血压易感基因组的鉴定制造技术

本申请涉及高血压易感基因组的鉴定。本发明专利技术提供包含能够用于判定高血压发病的风险的SNP的遗传标记、能够作为用于检测该遗传标记的引物或探针使用的多核苷酸、使用该SNP的高血压发病风险判定方法、用于该SNP的分型的微阵列及用于该高血压发病风险判定方法的试剂盒。

【技术实现步骤摘要】
本申请是申请日为2009年2月20日、申请号为200980114066.0、专利技术名称为“高血压易感基因组的鉴定”的申请的分案申请。 
本专利技术涉及包含能够用于判定高血压发病风险的SNP的遗传标记、能够作为用于检测该遗传标记的引物或探针使用的高血压发病风险判定用多核苷酸、使用该SNP的高血压发病风险判定方法、用于该SNP的分型的高血压发病风险判定用微阵列、及用于该高血压发病风险判定方法的试剂盒等。 本申请要求2008年2月21日在日本申请的日本特愿2008-040208号的优先权，并将其内容援引于此。 
技术介绍
高血压是例如冠状动脉疾病、脑中风、慢性肾病等的主要发病原因，高血压的预防在社会和公共卫生上是很重要的。高血压是通过很多原因而诱发发病的多因素疾病，将这些诱发高血压的原因称作危险因素（风险因素，risk factor）。高血压的危险因素主要大致分为环境因素和遗传因素，认为它们的相互作用发挥着重要的作用。 危险因素中，作为环境因素，例如可列举出年龄的增长、肥胖、压力、过量摄取盐分等。另一方面，作为遗传因素，已知有各种高血压易感基因。这里，“高血压易感基因”是指，由于具有所述基因而引发高血压的危险率上升的基因。也就是说，可判断的是，具有高血压易感基因的人与不具有高血压易感基 因的人相比，更容易罹患高血压。并且认为，在高血压那样的多因素疾病中，其易感基因很多是表现为单核苷酸多态性（SNP）等多态性的等位基因（等位基因）。 迄今为止，作为含有基因多态性的高血压易感基因，报告有血管紧张素原、α-内收蛋白、β2肾上腺素受体、糖蛋白Ia（GPIa）、趋化因子受体2（CCR2）、载脂蛋白C（ApoC-III）、G-蛋白β3亚基（GPβ3）、肿瘤坏死因子α（TNFα）、胰岛素受体底物1（IRS-1）、糖蛋白Ibα（GPIbα）、C-型利钠肽（CNP）、血红素氧合酶1（HMOX-1）、SCNN1A等各种基因（例如参照专利文献1～4。）。此外，近年来，报告了CYP17基因（rs6162）多态性、EXOSC3基因（rs7158）多态性、ACCN1基因（rs28933）多态性、KCNMB4基因（rs710652）多态性、KCNIP2基因（rs755381）多态性、ATP2A3基因（rs887387）多态性、RAC2基因（rs929023）多态性、CD3EAP基因（rs967591）多态性、CALCR基因（rs1042138）多态性、ATP10D基因（rs1058793）多态性、GNA14基因（rs1801258）多态性、PTHR1基因（rs1869872）多态性、ATP2B1基因（rs2070759）多态性、HLA-DMB基因（rs2071556）多态性、SLC13A1基因（rs2140516）多态性、SLC2A11基因（rs2236620）多态性、GNAI2基因（rs2236943）多态性、CACNA2D2基因（rs2236957）多态性、PRKWNK1基因（rs2255390）多态性、SLC22A7基因（rs2270860）多态性、KCNN1基因（rs2278993）多态性、SLC21A6基因（rs2291075）多态性、CACNA1E基因（rs2293990）多态性、SLC26A8基因（rs2295852）多态性、ERCC1基因（rs2298881）多态性、DLGAP2基因（rs2301963）多态性、COL4A1基因（rs2305080）多态性、GUCA1C基因（rs2715709）多态性、ATP10C基因（rs3736186）多态性、HCN4基因（rs3743496）多 态性、PTPRT基因（rs3746539）多态性、FGF2基因（rs3747676）多态性、CHGA基因（rs3759717）多态性、PPP1R1B基因（rs3764352）多态性、ADORA1基因（rs3766554）多态性、RGS19IP1基因（rs3815715）多态性、RGS20基因（rs3816772）多态性有望作为高血压易感基因多态性（例如参照专利文献5。）。 高血压的治疗是为了防止由高血压诱发的冠状动脉疾病等的发病而以降低血压为目的。治疗方法主要大致分为通过改善饮食生活等生活习惯来减轻高血压的危险因素、和降压治疗剂的给药疗法。通常，判断各患者的风险，根据该判定结果和实际的血压，决定降压目标和治疗方法。例如，首先，将收缩期血压/舒张期血压为140～159/90～99mmHg分类为轻症高血压，将160～179/100～109mmHg分类为中症高血压，将≧180/≧110mmHg分类为重症高血压后，考虑除血压以外的危险因素而判断风险。例如，将为轻症高血压且不具有其他危险因素的患者判断为低风险组，将为轻症高血压且具有一些危险因素的患者判断为中等风险组，将为轻症高血压但具有糖尿病等危险性高的危险因素的患者判断为高风险组。通常，为低风险组和中等风险组时，首先，进行一定时期的生活习惯的改正，其后在血压没有充分降低的情况下进行给药疗法，但对于高风险组的患者，与一定时期的生活习惯的改正同时进行给药疗法。即，即使血压为相同程度，也未必是相同的治疗方法，根据各患者的风险而适当选择治疗方法。因此，正确评价高血压发病的风险是非常重要的。 大部分的危险因素各自单独未必是高血压发病的诱因。特别是作为遗传因素的高血压易感基因的情况下，认为是所具有的多个高血压易感基因相互影响，结果诱发了高血压。因此， 在高血压发病的风险评价中，所具有的高血压易感基因的数量越多，则判断为越高风险组。因此认为，通过调查尽可能多的高血压易感基因的有无，从而能够更准确地评价高血压发病的风险，但已报告有很多高血压易感基因，对它们全部进行检查从评价的迅速性及经济性的观点出发并不优选。另外，该基因存在与否和高血压发病的相关性因高血压易感基因的不同而不同，因此，以相关性比较低的高血压易感基因作为风险评价的判断资料时，无法得到可靠性高的评价。 专利文献1：日本特开2004-222503号公报 专利文献2：日本特开2004-113094号公报 专利文献3：日本特开2004-33051号公报 专利文献4：日本特开2004-24125号公报 专利文献5：日本特开2007-143504号公报 
技术实现思路
专利技术要解决的问题即，为了准确地评价高血压发病的风险，优选使用与高血压易感基因高血压发病的相关性高的有用的高血压易感基因作为遗传标记，更优选组合使用现实中临床上能够测定的范围内的数个有用的高血压易感基因作为遗传标记。然而，对于迄今为止报告的高血压易感基因，虽然观察到了存在与否和高血压发病具有相关性，但相关的程度不充分，另外，几乎不存在能够进一步提高风险评价的可靠性的高血压易感基因的组合。 本专利技术的目的在于提供：包含存在与否和高血压发病的相关性充分高且能够用于高血压发病的风险判定的SNP的遗传标记、能够作为用于检测该SNP的引物或探针使用的高血压发病 风险判定用多核苷酸、使用该SNP的高血压发病风险判定方法、用于该SNP的分型的高血压发病风险判定用微阵列、本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于检测遗传标记的引物或探针在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其中所述遗传标记为由人个体采集的核酸的SNP遗传标记rs2681472，所述用途具有以下工序：（a）对由人个体采集的核酸的SNP遗传标记rs2681472进行分型的工序，（b）根据通过所述工序（a）得到的分型结果来判定所述人个体的高血压发病风险的工序，和所述试剂盒包含：选自由以下组成的组的用于检测所述SNP遗传标记rs2681472的引物或探针：(ⅰ)序列号12所示的碱基序列、或作为序列号12所示的碱基序列的包含所述SNP遗传标记rs2681472的部分序列的碱基序列；(ⅱ)与所述（ⅰ）的碱基序列互补的碱基序列；(ⅲ)序列号13所示的碱基序列、或作为序列号13所示的碱基序列的包含所述SNP遗传标记rs2681472的部分序列的碱基序列；(ⅳ)与所述（ⅲ）的碱基序列互补的碱基序列。

【技术特征摘要】
2008.02.21 JP 2008-0402081.用于检测遗传标记的引物或探针在制备判定高血压发
病风险的试剂盒中的用途，其中所述遗传标记为由人个体采集
的核酸的SNP遗传标记rs2681472，所述用途具有以下工序：
（a）对由人个体采集的核酸的SNP遗传标记rs2681472进行
分型的工序，
（b）根据通过所述工序（a）得到的分型结果来判定所述
人个体的高血压发病风险的工序，和
所述试剂盒包含：
选自由以下组成的组的用于检测所述SNP遗传标记
rs2681472的引物或探针：
(ⅰ)序列号12所示的碱基序列、或作为序列号12所示的碱
基序列的包含所述SNP遗传标记rs2681472的部分序列的碱基
序列；
(ⅱ)与所述（ⅰ）的碱基序列互补的碱基序列；
(ⅲ)序列号13所示的碱基序列、或作为序列号13所示的碱
基序列的包含所述SNP遗传标记rs2681472的部分序列的碱基
序列；
(ⅳ)与所述（ⅲ）的碱基序列互补的碱基序列。
2.根据权利要求1所述的用于检测遗传标记的引物或探针
在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其特征在于，
所述工序（a）是进一步对由SNP遗传标记rs1799998和SNP遗传
标记rs699组成的组中的至少一种SNP遗传标记进行分型的工
序，所述SNP遗传标记rs1799998为CYP11B2基因的SNP，所述
SNP遗传标记rs699为AGT基因的SNP，和
所述试剂盒还包含：
用于检测所述SNP遗传标记rs1799998的引物或探针，和/
或用于检测所述SNP遗传标记rs699的引物或探针，
所述用于检测所述SNP遗传标记rs1799998的引物或探针
选自由以下组成的组：
(ⅰ)序列号26所示的碱基序列、或作为序列号26所示的碱
基序列的包含所述SNP遗传标记rs1799998的部分序列的碱基
序列；
(ⅱ)与所述（ⅰ）的碱基序列互补的碱基序列；
(ⅲ)序列号27所示的碱基序列、或作为序列号27所示的碱
基序列的包含所述SNP遗传标记rs1799998的部分序列的碱基
序列；
(ⅳ)与所述（ⅲ）的碱基序列互补的碱基序列；和
所述用于检测所述SNP遗传标记rs699的引物或探针选自
由以下组成的组：
(ⅰ)序列号33所示的碱基序列、或作为序列号33所示的碱
基序列的包含所述SNP遗传标记rs699的部分序列的碱基序列；
(ⅱ)与所述（ⅰ）的碱基序列互补的碱基序列；
(ⅲ)序列号34所示的碱基序列、或作为序列号34所示的碱
基序列的包含所述SNP遗传标记rs699的部分序列的碱基序列；
(ⅳ)与所述（ⅲ）的碱基序列互补的碱基序列。
3.根据权利要求1所述的用于检测遗传标记的引物或探针
在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其特征在于，
所述工序（b）中，按照SNP遗传标记rs2681472为AA型、AG型、
GG型的顺序判定风险由高到低。
4.根据权利要求1所述的用于检测遗传标记的引物或探针
在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其特征在于，
所述工序（b）中，SNP遗传标记rs2681472为GG型或AG型时，
判定为低风险组；为AA型时，判定为高风险组。
5.根据权利要求2所述的用于检测遗传标记的引物或探针

\t在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其特征在于，
所述工序（b）中，SNP遗传标记rs1799998为CC型或CT型时，
判定为低风险组；为TT型时，判定为高风险组。
6.根据权利要求2所述的用于检测遗传标记的引物或探针
在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其特征在于，
所述工序（b）中，SNP遗传标记rs699为MM型或MT型时，判
定为低风险组；为TT型时，判定为高风险组；其中M为蛋氨酸，
T表示苏氨酸。
7.根据权利要求2所述的用于检测遗传标记的引物或探针
在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其特征在于，
所述工序（b）中，SNP遗传标记rs2681472为GG型或AG型，SNP
遗传标记rs1799998为CC型或CT型时，判定为低风险组，SNP
遗传标记rs2681472为AA型，SNP遗传标记rs1799998为TT型时，
判定为高风险组。
8.根据权利要求2所述的用于检测遗传标记的引物或探针
在制备判定高血压发病风险的试剂盒中的用途，其特征在于，
所述工序（b）中，SNP遗传标记rs2681472为GG型或AG型，SNP
遗传标记rs699为MM型或MT型时，判定为低风险组，SNP遗传
标记rs26...

【专利技术属性】
技术研发人员：三木哲郎，田原康玄，小原克彦，名仓润，梅村敏，平和伸仁，上岛弘嗣，喜多义邦，中村保幸，
申请(专利权)人：国立大学法人爱媛大学，国立大学法人滋贺医科大学，公立大学法人横滨市立大学，
类型：发明
国别省市：日本;JP