利用基因芯片结合Real time PCR筛选的烟草内参基因及其方法技术

技术编号:9791503 阅读:239 留言:0更新日期:2014-03-21 02:22
本发明专利技术公开了一种利用基因芯片结合Real?time?PCR筛选的烟草内参基因及其方法,应用本发明专利技术的方法,筛选得到烟草新的内参基因烟草磷酸核酮糖激酶基因和烟草双半乳糖二酰甘油合酶基因,其中磷酸核酮糖激酶基因的稳定性高于目前所有报道的烟草内参基因,而烟草双半乳糖二酰甘油合酶基因的稳定性仅次于目前报道烟草内参基因EF-1-a。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物
,尤其涉及的是利用基因芯片结合Real time PCR筛选烟草内参的方法及应用。
技术介绍
利用real time PCR分析基因表达水平是现在分子生物学中重要的研究手段,而此项技术实施的关键是选择合适的内参,因此内参的选择一直都是研究者关注的热点。传统的内参基因的确定都是先经过文献检索、预测,然后通过实验验证基因之间相对的稳定性,具有很大的局限性。因此,现有技术存在缺陷,需要改进。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是针对现有技术的不足提供一种利用基因芯片结合Real time PCR筛选烟草内参的方法及应用。本专利技术的技术方案如下:一种在全基因组水平上筛选内参基因的方法,该方法包括以下2个步骤:首先利用NimbleGen双通道基因芯片分析栽培品种K326的3个部位根、茎、叶,每个部位6个时期,以及花的3个时期,共21个样本的基因的表达量,利用geNorm (3.5)计算出每个基因在21个样本中的变异系数,表征其稳定性,变异系数小于目前应用的内参的基因作为内参的候选基因。利用Real time PCR验证芯片杂交的结果,即用Re本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种利用基因芯片结合Real?time?PCR筛选烟草内参基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:1)首先利用NimbleGen双通道基因芯片分析栽培品种K326的3个部位根、茎、叶,每个部位6个时期,以及花的3个时期,共21个样本的基因的表达量,利用geNorm(3.5)计算出每个基因在21个样本中的变异系数,表征其稳定性,变异系数小于目前应用的内参的基因作为内参的候选基因;2)利用Real?time?PCR验证芯片杂交的结果,即用Real?time?PCR验证烟草3个部位根、茎、叶,每个部位6个时期,以及花的3个时期,共21个样本的基因的表达量,利用geNorm(3.5)计算出每个基因在21...

【技术特征摘要】
1.一种利用基因芯片结合Real time PCR筛选烟草内参基因的方法,其特征在于,包括以下步骤: 1)首先利用NimbleGen双通道基因芯片分析栽培品种K326的3个部位根、茎、叶,每个部位6个时期,以及花的3个时期,共21个样本的基因的表达量,利用geNorm (3.5)计算出每个基因在21个样本中的变异系数,表征其稳定性,变异系数小于目前应用的内参的基因作为内参的候选基因; 2)利用Realtime PCR验证芯片杂交的结果,即用Real tim...

【专利技术属性】
技术研发人员:郭玉双任学良黎瑞源
申请(专利权)人:贵州省烟草科学研究院
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1