用于诊断和治疗实体癌的基于微小RNA的方法和组合物技术

本发明专利技术提供了用于诊断和治疗实体癌的新的方法和组合物。本发明专利技术也提供了鉴定肿瘤发生抑制剂的方法。

【技术实现步骤摘要】
用于诊断和治疗实体癌的基于微小RNA的方法和组合物本申请是申请号为200780005821.2、申请日为2007年1月3日、专利技术名称为“用于诊断和治疗实体癌的基于微小RNA的方法和组合物”的中国专利技术专利申请的分案申请。专利技术人:CarloM.Croce, George A.Calin 和 Stefano Volinia政府资助本专利技术全部或部分由来自国立癌症研究所的项目基金P01CA76259，P01CA81534和P30CA56036资助。政府具有本专利技术的某些权利。专利技术背景癌症(恶性细胞的不受控生长)是现代医学纪元的一个主要健康问题，也是发达国家主导死因之一。在美国，四分之一的死亡由癌症造成(Jemal, A.等人，CA CancerJ.Clin.52:23-47(2002))。在癌症中，称作实体癌的源自器官和实体组织的癌症(例如结肠癌，肺癌，乳腺癌，胃癌，前列腺癌，胰腺癌)属于最常鉴定的人癌症。例如，前列腺癌是工业化国家男性中最常诊断出的非皮肤恶性肿瘤，在美国，八名男性中有一名会在他的生命中发 生前列腺癌(Simard, J.等人，Endocrinologyl43 (6):2029-40(2002))。在最近的数十年中，前列腺癌的发病率已经急剧增加，前列腺癌现在是美国和西欧的主导死因(Peschel, R.E.J.ff.Colberg, Lancet4:233-41 (2003) ; Nelson, ff.G.等人，N.Engl.J.Med.349(4):366-81 (2003))。具有前列腺癌的男性的寿命预期平均减少了40%。如果在转移和局部扩散超过包膜之前早期检测到，前列腺癌经常可以治愈(例如使用手术)。但是，如果在从前列腺扩散和转移后诊断出来，前列腺癌通常是具有低治愈率的致命疾病。尽管基于前列腺特异性抗原(PSA)的筛选已经辅助前列腺癌的早期诊断，它既不是高灵敏度的，也不是特异性的(Punglia等人，N.Engl.J.Med.349(4): 335-42 (2003))。这意味着，该测试伴随着高百分比的假阴性和假阳性诊断。结果是许多情况下癌症被漏诊和对没有癌症的那些人的不必要的随访活检。乳腺癌仍然是妇女中癌症相关性死亡的第二大病因，在美国其每年影响着超过180，000名妇女。对于北美的妇女，一生中患乳腺癌的概率现在为八分之一。尽管BRCA1和BRCA2的发现在鉴定参与乳腺癌的关键遗传因素中是非常重要的步骤，但已逐渐清楚BRCA1和BRCA2的突变只解释部分对乳腺癌的遗传易感性(Nathanson，K.L.,等人，Human Mol.Gen.10 (7): 715-720 (2001) ; Anglican Breast Cancer StudyGroup.Br.J.Cancer83 (10): 1301-08 (2000);和 Syr jakoski, K.，等人，J.Natl.CancerInst.92:1529-31 (2000))。尽管对乳腺癌的治疗进行了大量研究，但乳腺癌仍然难以有效地诊断和治疗，并且在乳腺癌患者中观察到的高死亡率表明该疾病的诊断、治疗和预防需要改进。除外皮肤癌，结肠直肠癌是在美国和加拿大第三最常诊断出的癌症(在女性中，位于肺癌和乳腺癌之后，在男性中，位于肺癌和前列腺癌之后)。美国癌症学会估计，在2005年美国将有约145，000例新诊断出的的结肠直肠癌病例(Cancer Facts andFigures2005.Atlanta, GA:American Cancer Society,2005.可从 www.cancer, org/docroot/STT/stt_0.asp获得，2005年12月19日访问)。结肠直肠癌是美国和加拿大男性和女性癌症死亡的第二大原因(次于肺癌)。2004年美国胰腺癌的年发病率几乎等同于年死亡率，分别估计为31，860和31, 270(Cancer Facts and Figures2004.Atlanta,GA:American Cancer Society,2004.可从 www.cancer, org/docroot/ STT/stt_0_2004.asp 获得,2005 年 8 月 21 日访问)。具有局部进展和转移性胰腺癌的患者具有较差的预后，诊断通常对于治疗性手术或放疗而言发生得太迟(Burr，Η.A.，等人，The OncologistlO (3): 183—190, (2005))。化疗可以为有些晚期胰腺癌患者提供症状的缓解，但是迄今为止它对存活率的影响不大。在美国，每年有超过20，000人被诊断出胃癌。美国癌症学会估计，在2004年美国将有22，710例新诊断出的的胃癌病例(Cancer Facts and Figures2004.Atlanta,GA: American Cancer Society, 2004.可从www.cancer.0rg/docroot/STT/stt_0_2004.asp获得，2005年8月21日访问)。因为胃癌可以无症状地发生，到诊断作出时其可能已经是晚期。那时治疗旨在使患者更舒服和提高生命质量。在世界范围内，肺癌造成比任何其它形式的癌症更多的死亡(Goodman，G.E.，Thorax57:994-999 (2002))。在美国，肺癌是男性和女性癌症死亡的主要原因。在2002年，肺癌死亡率估计是134，900例，超过乳腺癌、前列腺癌和结肠癌的总和。相同出处。肺癌也是所有欧洲国家癌症死亡的主要原因，肺癌-相关死亡的数目在发展中国家也快速增加。无论在诊断时的疾病阶段，所有肺癌患者的五年生存率仅是约13%。这与在该疾病仍然在局部时检测出的病例的46%的五年生存率形成对比。但是，在该疾病已经扩散之前，仅16%的肺癌被发现。早期检测是困难的，因为在该疾病已经达到晚期之前经常观察不到临床症状。尽管对该癌症和其它癌症的治疗进行了研究，肺癌仍然难以有效地诊断和治疗。显然，负责对特定形式的实体癌(例如前列腺癌，乳腺癌，肺癌，胃癌，结肠癌，胰腺癌)的易感性的标记和基因的`鉴定，是今天肿瘤学面临的主要挑战之一。需要鉴定早期检测具有对癌症的遗传易感性的个体的方法，以便可以为癌症的早期检测和治疗制定更有力的筛选和干预方案。癌基因也可以揭示可以被操纵的关键分子途径(例如使用小或大分子量药物)，且可以导致更有效的治疗，无论在首次诊断出特定癌症时的癌症阶段。微小RNA是通过与信使RNA(mRNA)靶杂交并引发对它的翻译抑制或较不常见地引起其降解来控制基因表达的一类小的非编码RNA。miRNA的发现和研究已揭示在生物发育和各种细胞过程例如细胞分化、细胞生长和细胞死亡中发挥重要作用的miRNA介导的基因调控机制(Cheng，Α.Μ.，等人，Nucleic Acids Res.33:1290-1297 (2005))。近年来的研究表明，特定miRNA的异常表达可参与人的疾病,例如神经障碍(Ishizuka, A.，等A, Genes Dev.16:2497-2508 (2002))和癌症。具体地，已在人慢性淋巴细胞性白血病中发现 miR-16-l 和 / 或 miR-15a 的不当表达(Calin, G.A.,等本文档来自技高网...

【技术保护点】
诊断受试者是否患有实体癌或处于发生实体癌的风险中的方法，其包括，测量来自受试者的测试样品中至少一种miR基因产物的水平，其中与对照样品中相应的miR基因产物的水平相比，测试样品中所述miR基因产物的水平的改变，指示着受试者患有实体癌或处于发生实体癌的风险中。

【技术特征摘要】
2006.01.05 US 60/756,5851.诊断受试者是否患有实体癌或处于发生实体癌的风险中的方法，其包括，测量来自受试者的测试样品中至少一种miR基因产物的水平，其中与对照样品中相应的miR基因产物的水平相比，测试样品中所述miR基因产物的水平的改变，指示着受试者患有实体癌或处于发生实体癌的风险中。2.权利要求1的方法，其中所述至少一种miR基因产物选自:miR-21，miR-191,miR-17-5p和其组合。3.权利要求1的方法，其中所述至少一种miR基因产物选自:miR-21，miR-17-5p，miR-191, miR-29b-2, miR-223, miR_128b， miR-199a_l, miR-24-1， miR-24-2， miR-146,miR-155, miR-181b_l, miR_20a, miR-107, miR-32, miR-92-2, miR-214, miR_30c, miR-25,miR-221, miR-106a 和其组合。4.权利要求1的方法，其中所述实体癌选自:前列腺癌，胃癌，胰腺癌，肺癌，乳腺癌和结肠癌。5.权利要求1的方法，其中所述实体癌是乳腺癌或肺癌，且所述至少一种miR基因产物选自:miR-210，miR-213和其组合。6.权利要求1的方法，其中所述实体癌是结肠癌，胃癌，前列腺癌，或胰腺癌，且所述至少一种miR基因产物是miR-218-2。7.权利要求1的方法，其中所述实体癌是乳腺癌，且所述至少一种miR基因产物选自:miR-125b-l, miR125b_2，miR-145, miR-21 和其组合。8.权利要求1的方法，其中所述实体癌是胰腺癌，且所述至少一种miR基因产物选自:miR-103-l, miR-103-2，miR-155, miR-204 和其组合。9.权利要求1的方法，其中所述实体癌和所述至少一种miR基因产物选自:(i)所述实体癌是乳腺癌，且所述miR基因产物选自:miR-21，miR-29b_2，miR-146,miR-125b_2, miR-125b_l, miR-10b, miR-145, miR_181a, miR-140, miR-213, miR_29a prec,miR-181b_l, miR_199b, miR-29b_l, miR_130a, miR-155, let_7a_2， miR-205, miR_29c,miR-224, miR-100, miR-31，miR_30c，miR-17_5p，miR-210, miR_122a，miR-16-2 和其组合;(ii)所述实体癌是结肠癌，且所述miR基因产物选自:miR-24-l，miR-29b-2，miR-20a，miR-10a, miR-32, miR-203, miR_106a，miR-17_5p，miR_30c，miR-223, miR-126*，miR_128b,miR-21,miR-24-2,miR-99b prec,miR-155,miR-213,miR-150,miR-107,miR-191,miR-221,miR-9-3和其组合；(iii)所述实体癌是肺癌，且所述miR基因产物选自:miR-21,miR-205, miR_200b,miR-9-1, miR-210, miR-148, miR-141, miR-132, miR-215, miR_128b，let_7g，miR-16-2,miR-129-l/2prec, miR-126*, miR-142-as, miR_30d, miR-30a_5p, miR-7-2, miR-199a_l,miR-127, miR_34a prec, miR_34a, miR-136, miR-202, miR-196-2, miR-199a_2, let-7a_2,miR-1...

【专利技术属性】
技术研发人员：C·M·克罗斯，G·A·卡林，S·沃林尼亚，
申请(专利权)人：俄亥俄州立大学研究基金会，
类型：发明
国别省市：