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一种等位基因特异性甲基化中筛选杂合子的方法技术

技术编号:9701716 阅读:188 留言:0更新日期:2014-02-21 22:34
本发明专利技术公开了一种等位基因特异性甲基化中筛选杂合子的方法。首先在TIMP3基因启动子区和第一外显子区寻找全部CCGG序列和SNP位点,然后结合等位基因特异性PCR技术和甲基化敏感性限制性酶切—PCR法,对TIMP3的一对等位基因启动子区CpG岛的甲基化状态进行特异性检测,在DNA水平应用AS-PCR技术在组织标本中筛选该位点杂合子;在DNA水平应用AS-PCR技术在细胞系中筛选该位点杂合子;如果两个pcr反应均有产物,则该样本为SNP杂合子。本发明专利技术的有益效果是,可以有效阻碍转录因子与启动子结合,导致转录失活,合成成熟功能蛋白受阻而导致细胞增殖失控。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种生化的检测方法,具体来说,是指。
技术介绍
DNA甲基化(DNA methylation)是最重要的表观遗传学修饰方式之一,与肿瘤发生密切相关。抑癌基因启动区甲基化可以阻碍转录因子与启动子结合,导致基因转录失活,合成成熟功能蛋白受阻进而导致细胞增殖失控。有关抑癌基因甲基化失活的研究在临床肿瘤早期诊断,治疗以及预后判断方面具有重要指导意义,是目前的一个研究热点。我们前期曾对辽南高发区胃癌的多位点甲基化情况进行了检测,结果发现此地区臂、癌患、考P16、hMLHl、TIMP3、DKK3、RASSF1A以及等特定基因启动子区DNA甲基化频率和程度都明显增高[I],但同时我们发现基因启动子区异常高甲基化与基因表达沉默并非完全相关,国外也有越来越多的研究者发现并提出了这个问题。
技术实现思路
为克服上述技术问题,我们提出了以下技术方案: ,首先在TIMP3基因启动子区和第一外显子区寻找全部CCGG序列和SNP位点,然后结合等位基因特异性PCR技术和甲基化敏感性限制性酶切一PCR法,对TIMP3的一对等位基因启动子区CpG岛的甲基化状态进行特异性检测,在DNA水平应用AS- PCR技术在组织标本中筛选该位点杂合子。本专利技术中,在DNA水平应用AS-PCR技术在细胞系中筛选该位点杂合子。本专利技术中,如果两个per反应均有产物,则该样本为SNP杂合子。本专利技术的有益效果是,可以有效阻碍转录因子与启动子结合,导致转录失活,合成成熟功能蛋白受阻而导致细胞增殖失控。【具体实施方式】。首先在TIMP3基因启动子区和第一外显子区寻找全部CCGG序列和SNP位点,然后结合等位基因特异性PCR技术和甲基化敏感性限制性酶切一PCR法,对TIMP3的一对等位基因启动子区CpG岛的甲基化状态进行特异性检测,在DNA水平应用AS-PCR技术在组织标本中筛选该位点杂合子;在DNA水平应用AS-PCR技术在细胞系中筛选该位点杂合子;如果两个per反应均有产物,则该样本为SNP杂合子。以上所述,仅为本专利技术较佳的【具体实施方式】,但本专利技术的保护范围并不局限于此,任何熟悉本
的技术人员在本专利技术披露的技术范围内,根据本专利技术的技术方案及其专利技术构思加以等同替换或改变,都应涵盖在本专利技术的保护范围之内。本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种等位基因特异性甲基化中筛选杂合子的方法,其特征在于,首先在TIMP3基因启动子区和第一外显子区寻找全部CCGG序列和SNP位点,然后结合等位基因特异性PCR技术和甲基化敏感性限制性酶切—PCR法,对TIMP3的一对等位基因启动子区CpG岛的甲基化状态进行特异性检测,在DNA水平应用AS?PCR技术在组织标本中筛选该位点杂合子。

【技术特征摘要】
1.一种等位基因特异性甲基化中筛选杂合子的方法,其特征在于,首先在TIMP3基因启动子区和第一外显子区寻找全部CCGG序列和SNP位点,然后结合等位基因特异性PCR技术和甲基化敏感性限制性酶切一PCR法,对TIMP3的一对等位基因启动子区CpG岛的甲基化状态进行特异性检测,在DNA水平应用AS...

【专利技术属性】
技术研发人员:王景文
申请(专利权)人:王景文
类型:发明
国别省市:

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