一种筛选时间点芯片差异基因的方法技术

技术编号:6865706 阅读:297 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术设计了一种筛选差异基因的方法,适用于时间点基因芯片的数据分析中。该方法尽可能真实、准确地筛选出差异表达基因,它包括几步主要步骤:步骤1、对芯片数据进行预处理;步骤2、设置差异基因筛选参数;步骤3、应用步骤2中参数对基因芯片数据进行筛选;步骤4、差异基因的统计。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
1.本专利技术专利所述的一种筛选时间点芯片差异基因的方法,它对如下几个名词进行了定义:(1)、P-call:基因芯片中某一个基因的表达信号值,可以代表该基因的的表达量。(2)、P(A、M):根据芯片中基因表达信号值的强弱可以对信号值进行分类,信号值高的记做P,即有效检测基因;信号值低的记做A,即无效检测基因;少量居于中间的记为M。(3)、Fold change:在某个特定时间点,样本芯片的表达信号与对照芯片的表达信号的比值。用于判断该时间点时,基因表达是否有差异。该方法包括如下几步主要步骤:步骤1、对芯片数据进行预处理步骤2、设置差异基因筛选参数步骤3、应用步骤2中参数对基因芯片数据进行筛选步...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:曾华宗
申请(专利权)人:上海聚类生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:31

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