一种茶树抗寒性相关基因ERF1的SNP位点、CAPS分子标记及其应用制造技术

技术编号:40594210 阅读:22 留言:0更新日期:2024-03-12 21:56
本发明专利技术提供一种茶树抗寒性相关基因ERF1的SNP位点、CAPS分子标记及其应用。所述SNP位点位于茶树7号染色体第221281848位碱基,碱基多态性为C/T,所述SNP位点为Chr07:221281848_C/T;经SNP位点转化的CAPS分子标记的引物序列为正向引物5'‑TTAGAATCCAAGCTCCTCCTAGACT‑3';反向引物5'‑AGTACACCAATGAGTGTGGTGAAG‑3'。以茶树基因组DNA为模板进行PCR扩增,扩增产物经限制性内切酶TaqI酶切,通过琼脂糖凝胶电泳、酶切片段分析等过程,对不同茶树品种进行了纯合、杂合和野生型酶切分型,1条带纯合TT型抗寒性弱,3条带杂合CT型抗寒性中等,2条带野生CC型抗寒性强。本发明专利技术提供的CAPS分子标记带型稳定、准确率高且成本低,能很好地将低温敏感型茶树与低温耐受型茶树分开,可以为今后茶树品种的早期基因型鉴定与育种选择工作提供新途径。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子标记,一种茶树抗寒性相关基因erf1的snp位点、caps分子标记及其应用。


技术介绍

1、茶树 ( camellia sinensis) 是一种多年生常绿木本植物,主要生长在热带和亚热带地区,最适生长温度为20~25 ℃左右。近年来随着早生茶树品种的广泛种植和气候变化的不断加剧, 春季“倒春寒”天气也成为制约着茶产业可持续发展的不利因素。因此提高茶树抗寒性以及培育抗寒性强的茶树品种是本领域研究的重要目标。

2、随着分子生物学的发展,植物抗寒性分子机制研究取得很大进展,在不同植物品种中已筛选出一系列与抗寒相关的基因,并开发了与抗寒性相关基因紧密连锁的分子标记。caps分子标记是酶切扩增多态性序列标记方法,是将特异性扩增与限制性酶切相结合用以检测多态性的一种技术,具有共显性、位点特异性、成本低和操作简易等优点。该标记原理为,基因组片段上碱基的突变会引起限制性内切酶识别位点的改变,利用特异性引物扩增含突变位点的基因组片段,再用相应限制性内切酶消化扩增产物,结果会出现部分基因型扩增片本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种茶树抗寒性相关基因ERF1的SNP位点,其特征在于,所述SNP位点位于茶树7号染色体第221281848位碱基,碱基多态性为C/T,所述SNP位点为Chr07:221281848_C/T。

2.一种茶树抗寒性相关基因ERF1的CAPS分子标记,其特征在于,所述CAPS分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述核苷酸序列包含权利要求1所述的SNP位点。

3.扩增权利要求2所述的CAPS分子标记的引物,其特征在于,所述引物的序列如下:

4.一种使用权利要求2所述CAPS分子标记的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:</p>

5.根据...

【技术特征摘要】

1.一种茶树抗寒性相关基因erf1的snp位点,其特征在于,所述snp位点位于茶树7号染色体第221281848位碱基,碱基多态性为c/t,所述snp位点为chr07:221281848_c/t。

2.一种茶树抗寒性相关基因erf1的caps分子标记,其特征在于,所述caps分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示,所述核苷酸序列包含权利要求1所述的snp位点。

3.扩增权利要求2所述的caps分子标记的引物,其特征在于,所述引物的序列如下:

4.一种使用权利要求2所述caps分子标记的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,每份步骤(2)中所述pcr扩增的反应体系包括:正向引物1μl,反向引物1μl,模板dna 1μl, 2×rapid taq master mix 10μl,ddh2o 7μl。

6.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述pc...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘硕谦苏芹田娜胡梦迪刘仲华黄建安
申请(专利权)人:湖南农业大学
类型:发明
国别省市:

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