SATB2蛋白作为结肠直肠癌标记的应用制造技术

本发明专利技术通过识别作为结肠直肠癌类型的标记的ＳＡＴＢ２蛋白，提供了与这种癌症的检测、鉴定和预后有关的新方法、手段和应用。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及癌症诊断和预后领域。具体而言，它提供了一种通过鉴 别作为结肠直肠癌的标记的SATB2蛋白来用于检测和鉴定结肠直肠癌的 新方法。
技术介绍
"加编码富含AT的特殊序列结合蛋白2 (special AT-rich sequence-binding protein 2， SATB2)的基因是在1999年人类基因组测 序的浩大工程中4皮鉴别出的(Kikuno R ef (1999) DNA Res. 6: 197-205)。自此，SATB2基因被认为主要在神经组织中表达。SATB2是一个形成核基质各部分的转录因子，并且它通过与富含AT 的序列(也称为基质结合区(MARs))相互作用来调控高度有序的染色质 (high-order chromatin)结构从而进行组织特异性的基因表达 (Dickinson LA " a/ (1992) Cell 70， 631-45; FitzPatrick DR "" (2003) Hum. Mol. Genet. 12， 2491-501; Yasui D， (2002) Nature 419， 641-5; Bode, J (2000) Crit. Rev. Eukaryot. Gene. Expr. 10， 73-90)。对该基因及其蛋白产物SATB2蛋白的研究，指出它作为转录因子在神 经组织中参与基因表达的调控(Dobreva G W a/ (2003) Genes Dev. 17:3048-3061; Britanova 0 " a7 (2005) Eur. J. Neurosci. 21:658-668)。还有记载，SATB2基因在腭发育和腭裂中起作用 (FitzPatrick DR "" (2003) Human Mol. Genet. 12: 2491-2501'， van Buggenhout G " " (2005) Eur. J. Med. Genet. 48: 276-289)。Salahshor等人对一名腺瘤性结肠息肉病(APC)基因突变的患者进行 了研究(Salahshor " " (2005) BMC cancer 5:66)。 APC患者在年轻时 产生异常量的结肠腺瘤，如果不治疗，最终将发展成结肠直肠癌。总基因 表达谱揭示了一组包括SATB2在内的84个基因在腺瘤内的表W目比在正 常粘膜中有显著改变。SATB2被发现显著下调但未被选用于做进一步的分8析。Int J Cancer上关于结肠直肠癌表达图镨的新近研究同样指出SATB2 在mRM水平上的表达状态有所改变(Groene J W a7 (2006) Int J Cancer 119， 1829-1836)。PCT公布文本WO03/022126和WO2006/015742描述了关于癌细胞表达 图谱的其他相似研究。对包括SATB2的大量基因的表达进行分析并根据总 的表达模式得出结论。重要地是，上述研究并未提供关于SATB2蛋白作为特异的结肠直肠标 记的应用或SATB2作为结肠直肠癌预后工具的应用的暗示。疾症癌症是西方最常见的疾病和死亡原因之一。 一般而言，大多数的癌症 形式的发病率是随年龄增加的。因为人类总体健康状况提高所致的寿命的 继续增长，患癌症的个体会更多。尽管日益增加的知识指出环境因素(々大 食、烟草、紫外线等)及遗传因素("癌症基因，，如p53、 APC、 BRCA1、 XP等的种系突变)与癌症的发病风险之间有一种联系，但大多数常见类 型的癌症的病因一般来说还不清楚。尽管癌症本质上是一种细胞疾病并被定义为伴有净细胞增长和有害 群体行为的转化细胞群，但从细胞生物学角度来看，关于癌症的定义都不 能令人完全满意。恶性转化代表基于不可逆转的遗传改变的向恶性表型的 转变。尽管还没被正式地证明，恶性转化被认为发生在一个细胞内，由此 始发随后产生的肿瘤("癌症克隆形成能力"学说)。致癌作用是指产生 癌症并通常被认为包括多个最终导致恶性肿瘤生长的事件的过程。这个多 步过程包括数个速率限制步骤，如突变的增加，还可能包括外遗传 (epigenetic)事件，导致癌变前增殖阶段后的癌症形成。最常见类型的 癌症发生在体细胞，其中绝大多数起源于上皮組织(皮肤、前列腺、结肠 和肺)，然后;l^ok细胞生成镨系发生的癌症(白血病和淋巴瘤)和从间 充质细胞发生的癌症(肉瘤)。逐步的变化包括决定细胞分裂、自我行为 和细胞死亡的重要调控通路中的错误(突变)累积。每一种变化都提供相 对于周围环境细胞的达尔文选择生长优势，从而导致肿瘤细胞群的净生 长。需要强调的是恶性肺瘤不仅由转化的肿瘤细胞自身组成而且还包括作 为支持性间质的周围正常细胞。这种补充的癌症间质构成了结締组织、血9管和多种其他正常细胞，如炎性细胞，它们共同起到向转化的肿瘤细胞提 供胂瘤继续生长所必需的信号的作用。对取自肺瘤的组织切片进行显微评价仍然是确诊癌症的金标准。对基因组DM、转录基因和表达蛋白的分析在显^:镜检测到的组织学特征基础 上又增加了重要信息。今后的诊断、预后信息和治疗选择都可能基于对形 态学的整体评价和对核酸及蛋白质的分析。现在，基于人类基因组序列和 生物化学通路(包括组织中细胞内和细胞间信号传导)的不断进步的认知， 已经可以揭示肿瘤形成中不同阶段以及表型变化(这定义了不同的癌症类 型)的某些机制。尽管分子生物学已取得显著进步，癌症诊断仍然要依靠光学显孩i镜。 分子工具的发展对将癌症细胞与普通细胞区分开来起到了重要的作用，而 且这种重要性还在增加。除了组织切片的组织化学染色之外，最常用的方 法是免疫组织化学法。免疫组织化学法使得可以使用特定的抗体来检测组 织和细胞中的蛋白表达模式。免疫组织化学法在临床诊断上的应用不仅可 以分析组织结构和细胞形态学，还可以检测不同细胞群中的免疫活性。这 对于支持不同原发肿瘤的精确评级和分类，以及对不明起源的转移的诊断 已经变得非常重要。现在临床实践中，最常用的抗体包括抗细胞类型标记 (如PSA、 MelanA、甲状腺球蛋白)的抗体和识别中间丝、分化抗原蔟等 和潜在恶性标记(如Ki67、 p53和HER-2)的抗体。除了免疫组织化学法， 应用原位杂交来检测基因扩增和应用基因测序来分析突变是癌症诊断学 中正在发展的技术。结肠直肠癌是世界上最常见的人类癌症形式之一。Parkin等人提供例4议现(Parkin ef " (2007) CA Cancer J Clin 55， 74-108)。另外， 世界上结肠直肠癌的发生占全部癌症的9. 4°/。左右，而且结肠直肠癌是西 方世界第二最常见的死亡原因。西方世界的结肠直肠癌的五年存活率约为 60%,但是在东欧和印度则低至30%。癌病目前早期检测和切除胂瘤的外科手术对良好的预后是至关重要的。症 状取决于肺瘤在远端胃肠道中的位置，它包括肠不良应激、腹泻、便秘、 疼痛和贫血(继发于肿瘤出血至肠道中)。恶性肿瘤才艮据不同的分类方案可被分为几个阶段，如TNM/UICC分类法I到IV期或Dukes A到C期。最 轻度恶性肿瘤(Dukes A和B期)可获得合理有利的效果，而另一极端， 某些转移性高度恶性肿瘤(Dukes C期)的存活率则很低。目前的诊断基 于本文档来自技高网...

【技术保护点】
确定患有或怀疑患有结肠直肠癌的哺乳动物受试者的结肠直肠癌预后是否不良的方法，包括以下步骤：　ａ）提供一个来自该受试者的样品；　ｂ）对存在于所述样品中的ＳＡＴＢ２蛋白进行定量以得到一个样品值；　ｃ）将得自步骤ｂ）的样品值与一 个对照值进行比较；并且，如果所述样品值低于所述对照值，　ｄ）则判断所述受试者的结肠直肠癌预后不良。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：M乌莱恩，F庞蒂恩，
申请(专利权)人：阿特拉斯抗体有限公司，
类型：发明
国别省市：SE[瑞典]