涉及HMGCR蛋白的治疗预测制造技术

技术编号:7138905 阅读:315 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术提供了一种方法,该方法用于确定是否患有一种乳癌的哺乳动物受试者可能受益于一种内分泌治疗,该方法包括以下步骤:提供一种较早从所述受试者获得的样品;评价存在于至少部分的所述样品中的HMGCR蛋白的量,并且确定与所述量对应的一个样品值;将在步骤b)中获得的样品值与一个参考值相比较;以及,如果所述样品值是高于所述参考值的,则做出该受试者可能受益于一种内分泌治疗的结论。此外,提供了一种对应的治疗方法连同进一步的使用方法,以及可以与乳癌治疗或治疗预测结合使用的手段。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本披露涉及乳癌治疗以及治疗预测的领域。还涉及在这种治疗或治疗预测中可以 采用的手段。背景癌症癌症是在西方世界中疾病和死亡的最普通的原因之一。通常,对于癌症的大多数 形式,发病率随着年龄而增加。随着人类种群持续活得更长,由于一般健康状态的增进,癌 症可能影响个体数量的增加。虽然在环境因素(饮食、吸烟、紫外线辐射等等)连同遗传因 素(“癌基因”如p53、APC、BRCAl、XP等的种系突变)与癌症的发生风险之间提供一种联系 的知识体有增加,最普通癌症类型的病因大部分仍然是未知的。从一种细胞生物学观点看没有完全令人满意的癌症的定义,尽管事实上癌症基本 上是一种细胞疾病并且被定义为具有净细胞生长以及抗群体行为的一种转化细胞群体。恶 性转化代表基于不可逆的遗传改变以向一种恶性表型的转变。虽然这还没有正式证明,恶 性转化是被认为是发生在一个细胞中,随后从该细胞发展出的肿瘤开始了( “癌症的克隆 性”教义)。致癌作用是通过它产生癌症的过程并且通常被认为包括最后导致恶性肿瘤生 长的多个事件。这种多级过程包括若干限速步骤,如突变以及还可能的次生事件的加入,其 导致在癌前期增殖阶段之后癌症的形成。这些分级改变涉及决定细胞分裂、不合群行为、以 及细胞死亡的重要调节通路的错误(突变)的累积。与周围的细胞相比,每一种这些改变 可以提供一种选择性达尔文生长优势,导致在肿瘤细胞群中的净生长。一种恶性肿瘤不仅 必需由这些转化肿瘤细胞它们本身组成,而且周围正常细胞充当为一种支持性基质。这种 募集的癌症基质包括结缔组织、血管、以及各种其他的正常细胞例如炎症细胞,它们一致地 起作用从而为这些转化肿瘤细胞提供持续肿瘤生长必需的信号。最常见的癌症的形式出现在体细胞中并且主要是上皮细胞起源的,如前列腺、乳 房、结肠、尿道以及皮肤;随后是从造血系起源的癌症如白血病和淋巴瘤、从神经外胚层起 源的癌症如恶性胶质瘤、以及软组织肿瘤如肉瘤。癌症诊断和预测取自肿瘤的一种组织切片的显微镜评价仍然是确定一种癌症的诊断的金标准。例 如,对于显微镜诊断,收集来自可疑肿瘤的活组织检查材料并且在显微镜下检查。为了获得 一个确定的诊断,将该肿瘤组织在福尔马林中固定、组织学处理、并且石蜡包埋。从该生成 的石蜡块,可以产生组织切片并且使用组织化学(即苏木精-伊红染色)染色以及免疫组 织化学法二者。然后用病理学技术(包括肉眼分析以及显微镜分析)评价该外科标本。这 种分析通常形成用于给定一个特异性诊断的基础,即进行肿瘤类型的分类以及一种肿瘤的 恶性程度的分级。根据对于各癌症类型特异的分类法可以将恶性肿瘤分成若干阶段。用于实体瘤的 最常见的分类系统是肿瘤-淋巴结-转移(TNM)分期系统。T阶段说明原发性肿瘤的局部 范围,即该肿瘤已经侵袭并且强加地生长进入周围组织到什么程度,而N阶段以及M阶段说明该肿瘤已经怎样发生转移,N阶段说明该肿瘤扩散到淋巴结,并且M阶段说明在其他远隔 器官中肿瘤的生长。早期包括T0-1、NO、M0,表示具淋巴结阴性的局部性肿瘤。更晚期包 括T2-4、NO、M0,表示具有更广泛生长的局部性肿瘤,以及Tl-4、Nl_3、MO表示已经转移到 淋巴结的肿瘤,并且T1-4、N1-3、M1表示具有在远隔器官中检出的转移的肿瘤。肿瘤的分期 通常是基于检查的若干形式,包括外科、放射学以及组织病理学分析。除了分期之外,还有 一种对大多数肿瘤类型的恶性级别进行分级的分类系统。该分级系统依赖于一种肿瘤组织 样品的形态学评估,并且以在一种给定的肿瘤中发现的微观特征为基础。这些分级系统可 以是基于肿瘤细胞的分化、增殖、以及非典型外观。通常采用的分级系统的实例包括用于前 列腺癌的Gleason分级以及用于乳腺癌的Nottingham组织学等级(NHG)分级。准确的分期以及分级对于一种正确的诊断是重要的,并且可以提供一种预测预后 的工具。对于一种特异肿瘤的诊断和预测信息其后决定了一种对于给定的癌症患者的适当 的治疗策略。除组织切片的组织化学染色之外,为了获得关于一种肿瘤的更多信息的一种 通常使用的方法是免疫组织化学染色。IHC允许使用特异性抗体检测在组织和细胞中的蛋 白质表达谱。除了从组织化学染色的肿瘤组织切片评估的关于组织结构和细胞形态学的信 息之外,IHC在临床诊断学中的用途允许检测在不同的细胞群中的免疫反应性。IHC可以 涉及支持准确的诊断,包括一种原发性肿瘤的分期和分级连同未知起源的转移的诊断。在 当今临床实践中最通常使用的抗体包括对抗细胞类型“特异性”蛋白,例如PSA(前列腺)、 MelanA(黑色素细胞)、以及甲状腺球蛋白(甲状腺)的抗体,以及识别中间丝的抗体(上 皮细胞、间充质、神经胶质)、分化群(CD)抗原(造血细胞、淋巴样细胞的亚类)、以及恶性 潜能的标志物(例如Ki67 (增殖)、p53 (通常突变的肿瘤抑制基因)以及HER-2 (生长因子 受体)。除了 IHC以外,用于检测基因扩增的原位杂交以及用于突变分析的基因测序的使 用是癌症诊断内的展开技术。另外,所有转录物、蛋白质、或代谢物的整体分析增加了有关 信息。然而,大多数的这些分析仍然代表基础研究并且对于在临床医学中的使用还有待评 价和标准化。乳癌乳癌是全世界癌症的第二最常见的形式,并且到目前为止是女性最频繁发生的癌 症。来自由Parkin等人提出的GL0B0CAM2002数据库的资料揭示在2002年有115万个新 病例并且在同一期间有41万个死亡病例(Parkin DM et al. (2005)CA Cancer J Clin 55, 74-108)。如果在一个早期检测出,则对于生活在一个发达国家中的患者预后是相对好的, 与在一个发展中国家中的57%相比,具有73%的总体五年生存率。该发病率正在缓慢增 加,并且在发达国家中大约每九个女性中有一个在她的一生中被认为患上乳癌。虽然与雌 性类固醇激素相关的生活方式改变(包括暴露于外源性激素)影响发展乳癌的风险,这些 因素仅仅构成了病因学的一小部分,并且预防操作的益处被认为是低的。死亡率的降低主 要是由于通过乳房X线照相术筛选的早期检测以及现代辅助全身疗法的使用。乳癌的治疗自从在七十年代后期它的引进,保乳治疗(结合乳房保留手术以及手术后放射治 疗)已经成为在女性中的第一位的治疗选择,其中肿瘤的根治性切除可以与一种好的美容 结果相结合。乳房切除术在一些患者即具有小乳房、大肿瘤(> km)或多病灶/多中心疾病的女性中仍然是优选的。腋窝切开主要是用于诊断目的而进行的,并且将至少10个淋巴结去除以给出一 种具有97%至98%敏感性的好的分期指导(Axelsson CK et al. (1992)Eur J Cancer 28A :1415-8 ;Recht A and Houlihan MJ(1995)Cancer 6(9) :1491-1512) 然而,对于原发 癌的治疗中的微创手术的下一步已经引进了具有腋窝淋巴结定位而不是腋窝淋巴结清扫 (它与高的并发症相关)的前哨淋巴结活检技术。这种技术作为认识的结果而被引入,即认 识到从乳房到腋窝的大多数淋巴引流最初通过一个(或少数)淋巴结(前哨淋巴结),其支 持这个淋巴结可能是腋窝淋巴结状况的一种充分指本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于确定是否患有一种乳癌的哺乳动物受试者可能受益于一种内分泌治疗的方法,该方法包括以下步骤:a)提供一种较早从所述受试者获得的样品;b)评价存在于至少部分的所述样品中的HMGCR蛋白的量,并且确定与所述量对应的一个样品值;c)将在步骤b)中获得的样品值与一个参考值相比较;以及,如果所述样品值是高于所述参考值的,d)则做出该受试者可能受益于一种内分泌治疗的结论。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】EPPCT/EP2008/0560712008年5月16日1.用于确定是否患有一种乳癌的哺乳动物受试者可能受益于一种内分泌治疗的方法, 该方法包括以下步骤a)提供一种较早从所述受试者获得的样品;b)评价存在于至少部分的所述样品中的HMGCR蛋白的量,并且确定与所述量对应的一 个样品值;c)将在步骤b)中获得的样品值与一个参考值相比较;以及, 如果所述样品值是高于所述参考值的,d)则做出该受试者可能受益于一种内分泌治疗的结论。2.对于患有一种乳癌的哺乳动物受试者的非治疗策略方法,该方法包括a)提供一种较早从所述受试者获得的样品;b)评价存在于至少部分的所述样品中的HMGCR蛋白的量,并且确定与所述量对应的一 个样品值;c)将在步骤b)中获得的样品值与一个参考值相比较;以及, 如果所述样品值是低于或等于所述参考值的,d)则避免用一种内分泌治疗来治疗所述受试者。3.根据权利要求1和2的任一项所述的方法,其中所述乳癌是ER阴性的或冊阴性的。4.根据权利要求3所述的方法,其中所述乳癌是ER阴性的。5.用于确定是否患有一种乳癌的哺乳动物受试者可能受益于一种内分泌治疗的方法, 该方法包括以下步骤a)提供一种较早从所述受试者获得的样品;b)评价存在于至少部分的所述样品中的HMGCR蛋白的量,并且确定与所述量对应的一 个样品值;c)将在步骤c)中获得的样品值与一个参考值相比较;以及由此确定所述受试者的 HMGCR状况;d)获得所述受试者的ER状况;并且如果所述ER状况或所述HMGCR状况是阳性的,el)则做出该受试者可能受益于一种内分泌治疗的结论,或如果所述ER状况以及所述HMGCR状况是阴性的,e2)则做出该受试者不可能受益于一种内分泌治疗的结论。6.根据权利要求5所述的方法,其中该ER状况是获自步骤a)的样品。7.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述内分泌治疗是选自一种SERM治 疗、一种芳香酶抑制剂治疗、以及一种留体雌激素受体拮抗剂治疗。8.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述内分泌治疗是一种SERM治疗,并 且所述SERM是选自托瑞米芬、雷洛昔芬、屈洛昔芬、阿佐昔芬、以及它莫西芬。9.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述内分泌治疗是它莫西芬治疗。10.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述样品是一种体液样品。11.根据权利要求10所述的方法,其中该体液是选自下组,其组成为血液、血浆、血 清、脑脊液、尿液、以及渗出物。12.根据权利要求1至9的任一项所述的方法,其中所述样品是一种细胞学样品。13.根据权利要求1至9的任一项所述的方法,其中所述样品是一种粪便样品。14.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述样品包括来自所述受试者的细胞。15.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述样品包括来自所述受试者的肿 瘤细胞。16.根据权利要求1至9的任一项所述的方法,其中所述样品是一种组织样品。17.根据权利要求16所述的方法,其中所述组织样品是一种乳癌组织样品。18.根据权利要求14至17的任一项所述的方法,其中步骤b)的评价限于所述样品的 细胞的细胞质。19.根据权利要求18所述的方法,其中所述样品的所述细胞是肿瘤细胞。20.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中该受试者是一位人类女性。21.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述受试者是一位绝经前的女性。22.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述乳癌是一种II期乳癌。23.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述乳癌是一种淋巴结阳性的乳癌。24.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述参考值是一个与在参比样品中 HMGCR蛋白的一个量对应的值。25.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中步骤b)的所述样品值被确定为1(对 应于在所述样品中可检出的HMGCR蛋白)或0(对应于在所述样品中没有可检出的HMGCR 蛋白)。26.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中步骤c)的所述参考值对应于不具有 可检出的HMGCR蛋白的一个参比样品。27.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中步骤c)的所述参考值是0。28.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述参考值是选自下组,其组成为 一种细胞质部分、一种细胞质强度、一种细胞质部分与一种细胞质强度的一种函数、一种细 胞核部分、一种细胞核强度、以及一种细胞核部分与一种细胞核强度的一种函数。29.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述参考值是选自下组,其组成为 一种细胞质部分、一种细胞质强度、以及一种细胞质部分与一种细胞质强度的一种函数。30.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述参考值是50%或更低的HMGCR 蛋白阳性细胞的一种细胞质部分。31.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述参考值是25%或更低的HMGCR 蛋白阳性细胞的一种细胞质部分。32.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中所述参考值是10%或更低的HMGCR 蛋白阳性细胞的一种细胞质部分。33.根据权利要求1至四的任一项所述的方法,其中所述参考值是HMGCR蛋白表达的 一种弱的或更低的细胞质强度。34.根据权利要求1至四以及33的任一项所述的方法,其中所述参考值是HMGCR蛋白 表达的一种缺乏的细胞质强度。35.根据权利要求1至四的任一项所述的方法,其中所述参考值是25%或更低的 HMGCR蛋白的一种细胞质部分或HMGCR蛋白表达的弱的或更低的一种细胞质强度。36.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中该HMGCR蛋白的氨基酸序列包括选 自以下的一个序列i)SEQID NO 1 ;以及ii)一个与SEQ ID NO 1有至少85%相同的序列。37.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中HMGCR蛋白的氨基酸序列包括选自 以下的一个序列i)SEQID NO 2 ;以及ii)一个与SEQ ID NO 2有至少85%相同的序列。38.根据以上权利要求的任一项所述的方法,其中步骤b)包括bl)对所述样品应用一种能够选择性地与该有待评价的HMGCR蛋白相互作用的可以计 量的亲和配体,所述应用是在能够使所述亲和配体结合至存在于所述样品中的任何HMGCR 蛋白的条件之下进行的;b2)去除未结合的亲和配体;以及b3)定量该保持与所述样品缔合的亲和配体以评价所述量。39.根据权利要求38所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体是选自下组,其组成 为抗体、它们的片段、以及它们的衍生物。40.根据权利要求39所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体是通过一个方法能得 到的,该方法包括用一种蛋白质免疫一种动物的一个步骤,该蛋白质的氨基酸序列包括序 列 SEQ ID NO :1ο41.根据权利要求40所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体是通过一个方法能得 到的,该方法包括用一种蛋白质免疫一种动物的一个步骤,该蛋白质的氨基酸序列包括氨 基酸序列SEQ ID NO :1ο42.根据权利要求38所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体是一种衍生于选自下 组的一种支架的蛋白配体,该组的组成为葡萄球菌蛋白A和其域、脂质运载蛋白、锚蛋白 重复域、纤维素结合域、Y晶型、绿色荧光蛋白、人细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4、蛋白酶 抑制剂、PDZ域、肽适体、葡萄球菌核酸酶、淀粉酶抑肽、纤连蛋白III型域以及锌指结构。43.根据权利要求38所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体是一种寡核苷酸分子。44.根据权利要求38至43的任一项所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体是能 够与一种HMGCR蛋白选择性地相互作用,该HMGCR蛋白的氨基酸序列包括SEQ ID NO 1或 SEQ ID NO 4 的序列。45.根据权利要求38至44的任一项所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体包括一 种选自下组的标记物,该组的组成为荧光染料类和金属类、发色染料类、化学发光化合物 类和生物发光蛋白类、酶类、放射性同位素类、颗粒以及量子点。46.根据权利要求38至45的任一项所述的方法,其中所述可以计量的亲和配体是使用 能够识别所述可以计量的亲和配体的一种第二亲和配体检测的。47.根据权利要求46所述的方法,其中所述第二亲和配体能够识别所述可以计量的亲 和配体,该可以计量的亲和配体包括一种选自下组的标记物,该组的组成为荧光染料类和 金属类、发色染料类、化学发光化合物类和生物发光蛋白类、酶类、放射性同位素类、颗粒以及量子点。48.用于进行根据以上权利要求中的任一项所述的方法的试剂盒,该试剂盒包括a)能够与一种HMGCR蛋白选择性地相互作用一种可以计量的亲和配体;以及b)用于定量所述可以计量的亲和配体必需的试剂。49.根据权利要求48所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体是选自下组,其组 成为抗体、它们的片段、以及它们的衍生物。50.根据权利要求49所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体是通过一个方法能 得到的,该方法包括用一种蛋白质免疫一种动物的一个步骤,该蛋白质的氨基酸序列包括 序列 SEQ ID NO 1。51.根据权利要求49所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体是通过一个方法能 得到的,该方法包括用一种蛋白质免疫一种动物的一个步骤,该蛋白质的氨基酸序列包括 序列 SEQ ID NO 1。52.根据权利要求48的任一项所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体是一种衍 生于选自下组的一种支架的蛋白配体,该组的组成为葡萄球菌蛋白A和其域、脂质运载蛋 白、锚蛋白重复域、纤维素结合域、Y晶型、绿色荧光蛋白、人细胞毒性T淋巴细胞相关抗原 4、蛋白酶抑制剂、PDZ域、肽适体、葡萄球菌核酸酶、淀粉酶抑肽、纤连蛋白III型域以及锌指 结构。53.根据权利要求48的任一项所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体是一种寡 核苷酸分子。54.根据权利要求48至53的任一项所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体能够 与一种HMGCR蛋白选择性地相互作用,该HMGCR蛋白包括或或其组成为选自以下的一个序 列i)SEQID NO 1 ;以及ii)一个与SEQ ID NO 1有至少85%相同的序列。55.根据权利要求48至M的任一项所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体能 够与一种HMGCR蛋白选择性地相互作用,该HMGCR蛋白包括或其组成为选自以下的一个序 列i)SEQ ID NO 2 ;以及一个与SEQ ID NO :2有至少85%相同的序列。56.根据权利要求48至55的任一项所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体能够 与一种HMGCR蛋白选择性地相互作用,该HMGCR蛋白包括或其组成为序列SEQ ID NO :4。57.根据权利要求48至56的任一项所述的试剂盒,其中所述可以计量的亲和配体包括 一种选自下组的标记物,该组的组成为荧光染料类和金属类、发色染料类、化学发光化合 物类和生物发光蛋白类、酶类、放射性同位素类、颗粒以及量子点。58.根据权利要求48至57的任一项所述的试剂盒,其中用于对所述可以计量的亲和配 体的所述量进行定量必需的所述试剂包括能够识别所述可以计量的亲和配体的一种第二 亲和配体。59.根据权利要求58所述的试剂盒,其中所述第二亲和配体包括一种选自下组的标记 物,该组的组成为荧光染料类和金属类、发色染料类、化学发光化合物类和生物发光蛋白类、酶类、放射性同位素类、颗粒以及量子点。60.根据权利要求48至59的任一项所述的试剂盒,进一步包括至少一种参比样品用于 提供一个参考值。61.根据权利要求60所述的试剂盒,其中至少一种参比样品是一种不含有可检出的 HMGCR蛋白的组织样品。62.根据权利要求60或61所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括HMGCR蛋白。63.根据权利要求60至62的任一项所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于 50%或更低的细胞质部分的一个量的HMGCR蛋白。64.根据权利要求63所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于25%或更低的 细胞质部分的一个量的HMGCR蛋白。65.根据权利要求64所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于10%或更低的 细胞质部分的一个量的HMGCR蛋白。66.根据权利要求65所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于或更低的 细胞质部分的一个量的HMGCR蛋白。67.根据权利要求60至66的任一项所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于 一种弱的或更低的细胞质强度的一个量的HMGCR蛋白。68.根据权利要求67所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于一种缺乏的细 胞质强度的一个量的HMGCR蛋白。69.根据权利要求60至68的任一项所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于 高于所述参考值的一个值的一个量的HMGCR蛋白。70.根据权利要求69所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于一种强的细胞 质强度的一个量的HMGCR蛋白。71.根据权利要求69或70所述的试剂盒,其中至少一种参比样品包括对应于75%或 更高的细胞质部分的一个量的HMGCR蛋白。72.根据权利要求60至71的任一项所述的试剂盒,该试剂盒包括一种第一参比样品,该参比样品包括对应于高于一个参考值的一个值(阳性参考值) 的一个量的HMGCR蛋白;以及一种第二参比样品,该参比样品包括对应于低于或等于所述参考值的一个值(阴性参 考值)的一个量的HMGCR蛋白。73.根据权利要求6...

【专利技术属性】
技术研发人员:M·乌莱恩
申请(专利权)人:阿特拉斯抗体有限公司
类型:发明
国别省市:SE

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1