【技术实现步骤摘要】
基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法
本专利技术涉及生物分析应用领域,具体涉及一种基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法。
技术介绍
A(H7N9)禽流感疫情给疾病防控带来较大挑战。2013年2月一种可感染人的A(H7N9)禽流感病毒首次在上海被发现报道。到2016年8月,三年多时间确诊患者807例,病死率达40.0%,疫情出现了三次流行高峰。不断出现的病例,较高的病死率和持续扩大的地域给疾病预防带来巨大挑战,给公众造成心理恐慌。对病毒的研究发现,该病毒同时带有可以结合禽的α-2,3和人的α-2,6唾液酸受体,相对于其他禽流感,人群对其更易感。同时,家庭聚集性病例提示有限的人-人传播,病毒内部基因在进化过程中呈现“本地化”特质,使其作为“大流行潜力株”进一步引起国际上重点关注。UBX(泛素调控X因子)蛋白质家族在泛素化相关的过程中起着重要的作用,如细胞周期调控、转录调控、信号转导、发育、胁迫响应、细胞程序性死亡、内吞作用和DNA修复。UBXN11基因编码的蛋白是UBX家族的成员之一,这个 ...
【技术保护点】
1.一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。
【技术特征摘要】
1.一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。2.如权利要求1所述的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,其中,rs189256251的多态性位点基因序列为:其中,B为特异性位点,CC基因型的特异性位点为C;CT基因型的特异性位为T。3.如权利要求1-2任意一项所述的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒,其特征在于,包含以下组成部分:(1)检测UBXN11基因的多态性位点基因型的引物;(2)及PCR反应缓冲液,MgCl2,水和dNTP;(3)TaqDNA聚合酶;(4)PCR产物纯化酶(SAP酶);(5)单碱基延伸反应酶(iPLEX)及相应缓冲液;其中,所述的用于检测SNPrs189256251的扩增引物为:5’-ACGTTGGATGATCAGTAGGAAGGCCTGTTC-3’;5’-ACGTTGGATGAGCCAGGAGTCACCCAACAC-3’;所述的用于检测SNPrs189256251的延伸引物为:5’-CCCATTCTCAGACTTGATG-3’。4.如权利要求3所述的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂...
【专利技术属性】
技术研发人员:张曦,赵雪,秦胜营,贺林,滕峥,袁政安,李崇山,王嘉瑜,房方皓,匡小舟,
申请(专利权)人:上海市疾病预防控制中心,上海交通大学,
类型:发明
国别省市:上海,31
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