基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法技术

技术编号:20712810 阅读:46 留言:0更新日期:2019-03-30 15:39
本发明专利技术所公开的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。本发明专利技术还公开了一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒及基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的分析方法。通过本发明专利技术所提供的预测A(H7N9)易感人群的方法快速、简便、有效、准确度高,为预测A(H7N9)易感人群后续靶向药的研制和进一步发病机理的研究提供了新的思路和方向。

【技术实现步骤摘要】
基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法
本专利技术涉及生物分析应用领域,具体涉及一种基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法。
技术介绍
A(H7N9)禽流感疫情给疾病防控带来较大挑战。2013年2月一种可感染人的A(H7N9)禽流感病毒首次在上海被发现报道。到2016年8月,三年多时间确诊患者807例,病死率达40.0%,疫情出现了三次流行高峰。不断出现的病例,较高的病死率和持续扩大的地域给疾病预防带来巨大挑战,给公众造成心理恐慌。对病毒的研究发现,该病毒同时带有可以结合禽的α-2,3和人的α-2,6唾液酸受体,相对于其他禽流感,人群对其更易感。同时,家庭聚集性病例提示有限的人-人传播,病毒内部基因在进化过程中呈现“本地化”特质,使其作为“大流行潜力株”进一步引起国际上重点关注。UBX(泛素调控X因子)蛋白质家族在泛素化相关的过程中起着重要的作用,如细胞周期调控、转录调控、信号转导、发育、胁迫响应、细胞程序性死亡、内吞作用和DNA修复。UBXN11基因编码的蛋白是UBX家族的成员之一,这个蛋白C端有一个松散的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。

【技术特征摘要】
1.一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为rs189256251,其中,所述的UBXN11基因rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测该样本为A(H7N9)易感人群,当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测该样本为A(H7N9)非易感人群。2.如权利要求1所述的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的用途,其特征在于,其中,rs189256251的多态性位点基因序列为:其中,B为特异性位点,CC基因型的特异性位点为C;CT基因型的特异性位为T。3.如权利要求1-2任意一项所述的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂盒,其特征在于,包含以下组成部分:(1)检测UBXN11基因的多态性位点基因型的引物;(2)及PCR反应缓冲液,MgCl2,水和dNTP;(3)TaqDNA聚合酶;(4)PCR产物纯化酶(SAP酶);(5)单碱基延伸反应酶(iPLEX)及相应缓冲液;其中,所述的用于检测SNPrs189256251的扩增引物为:5’-ACGTTGGATGATCAGTAGGAAGGCCTGTTC-3’;5’-ACGTTGGATGAGCCAGGAGTCACCCAACAC-3’;所述的用于检测SNPrs189256251的延伸引物为:5’-CCCATTCTCAGACTTGATG-3’。4.如权利要求3所述的一种基于UBXN11基因的多态性位点基因型预测A(H7N9)易感人群的试剂...

【专利技术属性】
技术研发人员:张曦赵雪秦胜营贺林滕峥袁政安李崇山王嘉瑜房方皓匡小舟
申请(专利权)人:上海市疾病预防控制中心上海交通大学
类型:发明
国别省市:上海,31

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