儿童哮喘血清特异miRNAs及决策树模型的建模方法技术

本发明专利技术公开儿童哮喘血清特异miRNAs及决策树模型的建模方法。儿童哮喘血清特异miRNAs组合物包括hsa‑miR‑18a‑5p，hsa‑miR‑106a‑5p，hsa‑miR‑144‑3p和hsa‑miR‑375。儿童哮喘特异的血清miRNAs组合物，作为儿童哮喘生物标志物，是预警评估儿童哮喘的特异性强、敏感性高的新方法，对儿童哮喘预警具有重要的意义，同时为提高儿童哮喘的临床治疗效果检测提供了一种新的筛查和检测的评估方法。

【技术实现步骤摘要】
儿童哮喘血清特异miRNAs及决策树模型的建模方法
本专利技术属于生物领域，特别涉及儿童哮喘血清特异miRNAs及决策树模型的建模方法。本专利技术适用于新的非侵入性的体外检测手段，用于儿童哮喘的预警以及治疗情况的评估。
技术介绍
支气管哮喘(bronchialasthma)简称哮喘，是由多种因素引发的慢性呼吸道疾病。2018年全球哮喘防治倡议(GINA)的结果显示，全球有3亿人患有哮喘，每年有34.6万人死于哮喘。而作为儿童期常见的反复发作的喘鸣气喘性肺性疾病，2003年的国际儿童哮喘及过敏性疾病研究组织(ISAAC)调查结果显示全世界特别是亚太地区儿童哮喘患病率在逐年升高。我国的哮喘患者也逐年增加，尤其是儿童哮喘患者，已经从2000年的1.97％增加到了2010年的3.01％，在2000年的基础上上升了50％左右。儿童哮喘虽然与成人哮喘具有相同的病理生理基础，但是由于儿童处于生长发育阶段，哮喘的反复作用会影响儿童的生长发育和正常生活，给家庭社会带来巨大的心理和经济负担。因此对儿童哮喘的灵敏特异的预警评估极其重要。目前临床上对儿童哮喘的主要诊断方法以临床症状、肺功能及治疗效果来诊断和本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.儿童哮喘血清特异miRNAs组合物，其特征在于包括hsa‑miR‑18a‑5p，hsa‑miR‑106a‑5p，hsa‑miR‑144‑3p和hsa‑miR‑375。

【技术特征摘要】
1.儿童哮喘血清特异miRNAs组合物，其特征在于包括hsa-miR-18a-5p，hsa-miR-106a-5p，hsa-miR-144-3p和hsa-miR-375。2.儿童哮喘血清特异miRNAs决策树模型的建模方法，其特征在于包括以下步骤：步骤(1)、针对儿童哮喘患者及健康对照者进行血清样本的采集，并保存于-80℃冰箱低温冷冻备用；步骤(2)、采用TruSeqSmallRNASamplePrepKits试剂盒进行文库构建；步骤(3)、采用IlluminaHiseq2000/2500进行测序分析以及初步筛查，获得多个miRNAs；步骤(4)、以hsa-miR-16为内参基因，采用qRT-PCR检测步骤(3)初步筛选的miRNAs的表达水平；步骤(5)、采用BiomarkerPatternsSoftware5.0软件分析并比较各miRNAs的权重组合，构建了四个血清miRNAs组成的儿童哮喘miRNAs决策树模型；所述的方法，所述步骤(3)具体执行以下操作：采用IlluminaHiseq2000/2500进行测序分析得到的初步结果，选取的miRNAs满足四个条件：①在儿童哮喘患者或健康对照者中检测miRNAs表达量至少达到10copies；②表达差异ratio≥1.5或ratio≤0.5，并且百分比含量高；③P值有显著差异(Pvalue(chisquare_2×2)≤0.05AndPvalue(fishertest)≤0.05)；④筛选出与儿童哮喘相关的miRNAs，筛选出14个miRNAs：hsa-miR-17-5p，hsa-miR-18a-5p，hsa-miR-19b-3p，hsa-miR-106a-5p，hsa-miR-144-3p，hsa-miR-375，hsa-miR-20a-5p，hsa-miR-25-3p，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-153-3p，hsa-miR-192-5p，hsa-miR-199b-5p，hsa-miR-381-3p，hsa-miR-410-3p；所述的方法，所述步骤(5)具体执行以下操作：将差异miRNAs荧光定量PCR数据以hsa-miR-16为内参基因，对目标基因进行归一化处理；miRNAs相对表达量采用2-△△Ct方法进行计算，△△Ct＝(CtmiRNA-CtmiR-16)...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘姬艳，贺琳娟，
申请(专利权)人：杭州师范大学，
类型：发明
国别省市：浙江,33