The invention discloses a gene chip for rapid identification of pathogenic bacteria of pneumonia. The gene chip can detect Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Haemophilus influenzae, Mycoplasma pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter Bauman, Enterococcus faecalis, Enterococcus, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Stenotrophomonas maltophilia, Burke Holder, from onion Legionella and Chlamydia pneumoniae 15 kinds of pathogenic bacteria, including clinical common and difficult to cultivate the pathogen of pneumonia. In the process of preparation, design, screening and verification using 16S rDNA and specific gene sequence of each pathogen of pneumonia corresponding probes, species respectively from the \Genus\ and \kind\ level at the same time to detection of bacteria in samples were identified. The chip of the invention makes up for the defect that the clinical detection of the pathogenic bacteria of pneumonia is not timely and incomplete, and provides a new detection means for early diagnosis and treatment of pneumonia patients.
【技术实现步骤摘要】
肺炎致病菌快速识别基因芯片
本专利技术涉及基因技术,尤其涉及肺炎致病菌快速识别基因芯片。
技术介绍
近年来,由于空气污染的加剧及公共卫生事件的发生,呼吸道疾病引起越来越多的关注。肺炎是指包括终末气道,肺泡和肺间质等在内的肺实质性炎症,是全球感染性疾病死亡的首要原因[1]。据世界卫生组织(WHO)统计,每年约有350万人死于下呼吸道感染,居所有死亡原因的第三位[2]。在美国,肺炎和流行性感冒位于所有死因的第九位,2010年和2011年均有5万多人死于肺炎[3-5],而且该统计没有将肺炎导致的败血症以及死于肺炎并发症的癌症、帕金森等病例纳入肺炎组,所以实际因肺炎死亡的人数比这个数还要高[2]。在我国,每年至少有250万人罹患肺炎,农村多于城市,其中5岁以下儿童肺炎死亡率为184/10万—1223万/10万[6],老年肺炎病死率没有确切的数据,但据黄华瑞报道[7]老年肺炎明显高于其他年龄段。可见,肺炎严重威胁着人类的生命健康。肺炎的致病原有很多,包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等,其中最重要最常见的是细菌。众所周知,肺炎按照发病环境可分为社区获得性肺炎(CAP)和医院获得性肺炎(HAP)。大部分CAP患者只需要门诊就诊,但仍有大约20%的患者仍需住院治疗[8]。CAP致病菌以革兰氏阳性菌为主,其中又以肺炎链球菌为第一位,占35-80%,其次为流感嗜血杆菌,嗜肺军团菌,肺炎支原体,肺炎衣原体,金黄色葡萄球菌等[9]。HAP致病菌比较广泛,以革兰氏阴性菌为主,其中常见的是铜绿假单胞菌,大肠埃希菌,肺炎克雷伯菌,鲍曼不动杆菌,其它还有嗜麦芽窄食单胞菌,洋葱伯克霍尔德菌,粪 ...
【技术保护点】
一种肺炎致病菌快速识别基因芯片,其中,所述肺炎致病菌包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎支原体、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、洋葱伯克霍尔德菌、嗜肺军团菌、肺炎衣原体中的至少一种;所述基因芯片上包括至少一个探针,用于与待检样品进行杂交;所述至少一个探针中的每个探针对应于所述肺炎致病菌中的至少一种;所述至少一个探针包括至少一个第一探针;一个所述第一探针对应于所述肺炎致病菌中的一种病菌;所述第一探针用于鉴定与其对应的所述的肺炎致病菌的特异基因,由此确定被测细菌的种;其中,用于鉴定所述肺炎链球菌的第一探针的序列为:CAAAGTAGTACCAAGTGCCATTGATTTTCTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述金黄色葡萄球菌的第一探针的序列为:CAAAGAACTGATAAATATGGACGTGGCTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述流感嗜血杆菌的第一探针的序列为:GAACGTGGTACACCAGAATACAACATCGCTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述肺炎支原体的第一探针的序列为:TGAGGTGA ...
【技术特征摘要】
1.一种肺炎致病菌快速识别基因芯片,其中,所述肺炎致病菌包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎支原体、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、洋葱伯克霍尔德菌、嗜肺军团菌、肺炎衣原体中的至少一种;所述基因芯片上包括至少一个探针,用于与待检样品进行杂交;所述至少一个探针中的每个探针对应于所述肺炎致病菌中的至少一种;所述至少一个探针包括至少一个第一探针;一个所述第一探针对应于所述肺炎致病菌中的一种病菌;所述第一探针用于鉴定与其对应的所述的肺炎致病菌的特异基因,由此确定被测细菌的种;其中,用于鉴定所述肺炎链球菌的第一探针的序列为:CAAAGTAGTACCAAGTGCCATTGATTTTCTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述金黄色葡萄球菌的第一探针的序列为:CAAAGAACTGATAAATATGGACGTGGCTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述流感嗜血杆菌的第一探针的序列为:GAACGTGGTACACCAGAATACAACATCGCTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述肺炎支原体的第一探针的序列为:TGAGGTGAATGGGTTGTTGAATCCGTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述铜绿假单胞菌的第一探针的序列为:TTGTGCCTGCTCGACCCGCTGGACGGGGTCTACAACTACCTCGCCCAGTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述鲍曼不动杆菌的第一探针的序列为:TCGATCCACGTGCTAAAGTGATTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述粪肠球菌的第一探针的序列为:TTACATGGGCCAAATGGTGAAGATGGAACATTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述屎肠球菌的第一探针的序列为:TCCTTTTTCCGTCATCAGTATAAAGTATAGTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述肺炎克雷伯杆菌的第一探针的序列为:AAAGCCGGCGTGTACGATAATTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述大肠埃希菌的第一探针的序列为:CGCCAAATCCGCAACGTAATGACAGTGTACCAACCCTTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述阴沟肠杆菌的第一探针的序列为:GCAGGCGATCTGTACGTTCAGGTTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述嗜麦芽窄食单胞菌的第一探针的序列为:TACCACCCGTACCTGGACTTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述洋葱伯克霍尔德菌的第一探针的序列为:TGGTGCGCTCGGGCTCGATCGACATTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述嗜肺军团菌的第一探针的序列为:ATAGCATTGGTGCCGATTTGGGGAAGAATTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述肺炎衣原体中的第一探针的序列为:ACTGCCGTAGATAGACCTAACCCGGCCTATTTTTTTTTTTT。2.如权利要求1所述的肺炎致病菌快速识别基因芯片,其特征在于:所述至少一个探针包括至少一个第二探针;所述第二探针用于鉴定与其对应的所述的肺炎致病菌的16SrDNA基因,由其确定被测细菌的属;其中,用于鉴定所述肺炎链球菌的第二探针的序列为:TGTGAGAGTGGAAAGTTCACACTGTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述金黄色葡萄球菌的第二探针的序列为:ACATATGTGTAAGTAACTGTGCACATCTTGACGGTATTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述流感嗜血杆菌的第二探针的序列为:GAGGAAGGTTGATGTGTTATTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述肺炎支原体的第二探针的序列为:GACCTGCAAGGGTTCGTTTTTTTTTTTTT;用于鉴定所述铜绿假单胞菌的第二探针的序列为:TTGCTGTTTTGACG...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈良安,马秀清,王升启,刘琪琦,李春笋,梁志欣,
申请(专利权)人:中国人民解放军总医院,
类型:发明
国别省市:北京,11
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