与甲状腺癌相关的基因多态性位点及其应用制造技术

本发明专利技术提供了甲状腺癌发病致病基因的体细胞突变位点及其应用，具体地本发明专利技术提供了一组甲状腺癌发病致病基因的突变位点，包括GNAS基因突变位点、NRAS基因突变位点、TSHR基因突变位点等，本发明专利技术提供的基因突变位点能够作为鉴别甲状腺结节良恶性的标志物。

【技术实现步骤摘要】
与甲状腺癌相关的基因多态性位点及其应用
本专利技术属于生物医药领域，具体地说，本专利技术涉及与甲状腺结节相关的基因体细胞特异性突变位点及其应用。
技术介绍
甲状腺结节是临床最常见的一种甲状腺疾病，触诊可以的发现的甲状腺结节的患病率在美国成年人群中约为4-7％。而应用敏感的甲状腺B检查，在65岁以上人群中，甲状腺结节的患病率高达50％以上。我国2010年由中华医学会内分泌协会滕卫平教授牵头进行的全国十城市15,181居民的甲状腺疾病流行病学调查的研究结果发现，我国人群中甲状腺结节的患病率高达18.6％，因此推测我们国家的甲状腺结节的患者高达2亿人。大多数甲状腺结节是良性的，可以采取保守治疗，但有5-10％的甲状腺结节是恶性的，需要早期手术治疗，才能获得良好的预后。因此，一个甲状腺专科的医生，面对的巨大挑战就是如何鉴别病人的甲状腺结节的良性和恶性，只有这样，才能使病人获得及时合理的治疗。如果大量的不需要手术的甲状腺良性结节，不适当地给予手术治疗，这样大的人群患病率，将会产生巨大的医保负担；反之，如果不能从大量的良性结节中识别鉴定真正的恶性肿瘤，将延缓对这些病人的治疗，危及患者的生命健康。目前临床上常用的甲状腺结节良恶性鉴别的手段主要有甲状腺B超、核素扫描及甲状腺结节细针穿刺病理活检(Fine-needleAspirationBiopsy，FNAB)。其中，甲状腺细针穿刺细胞学活检是目前甲状腺结节良恶性鉴别诊断的金标准。根据美国国家癌症研究所2008年的甲状腺细针穿刺病理学的专题会议的指南，目前将甲状腺结节穿刺细胞学诊断分成以下几类：1.因穿刺甲状腺细胞数量不足，无法诊断；2.良性结节；3.病理细胞学无法确诊的结节；4.恶性甲状腺结节四类。近年来，随着B超引导下进行细针穿刺的广泛应用，那种因穿刺获得的细胞数量不足，无法诊断的病人的比例明显减少，从以前的高达15％，降到目前的7％以下。在细针穿刺获得足够的甲状腺滤泡细胞后，大多数的甲状腺结节的良恶性均能通过细胞病理学的诊断方法获得正确的诊断。但即使目前国际上最好的甲状腺细胞病理诊断的实验室，也有20-40％穿刺成功的甲状腺结节不能确定其良恶性，即病理学无法确诊的结节。因此，在病人进行甲状腺穿刺病理活检时，因穿刺失败和病理不能判断良恶性从而无法给患者进行正确诊断的比例高达30-50％，受各中心的甲状腺病理诊断医师和穿刺医师的技术水平影响较大。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种甲状腺癌发病的致病基因突变位点及其应用。本专利技术的第一方面，提供了选自下组(I)中的一个或多个基因突变位点和/或其检测试剂的用途，用于制备试剂或试剂盒，所述试剂或试剂盒用于鉴别甲状腺结节的良恶性，所述组(I)包括以下基因突变位点：GNAS基因：NM_001077490:exon1:c.T1019C；NRAS基因：NM_002524:exon3:c.T284C；TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2098G。在另一优选例中，所述组(I)还包括以下基因突变位点：CHEK2基因：NM_145862:exon11:c.A1250G。在另一优选例中，所述组(I)还包括以下基因突变位点：PIK3CA基因：NM_006218:exon12:c.1818位缺失C。在另一优选例中，所述组(I)还包括以下基因突变位点：GNAS基因：NM_016592:exon1:c.C205A、NM_016592:exon1:c.C216T。在另一优选例中，所述组(I)还包括以下基因突变位点：TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2252G。在另一优选例中，所述组(I)还包括以下基因突变位点：BRAF基因：NM_004333:exon15:c.T1799A。在另一优选例中，被检测对象包括：人或非人哺乳动物(如家畜、家禽、实验动物等)。在另一优选例中，所述的试剂包括引物、探针、芯片、或抗体。在另一优选例中，所述的试剂盒含有一种或多种选自下组的试剂：(A)用于基因检测的特异性引物；(B)用于基因检测的特异性探针；(C)用于基因检测的芯片；(D)用于检测突变的基因所对应的氨基酸突变的特异性抗体。在另一优选例中，所述试剂或试剂盒用于实时荧光定量PCR检测。在另一优选例中，所述实时荧光定量PCR中，退火温度为60-67℃之间，PCR扩增产物长度为80-300bp。在另一优选例中，所述实时荧光定量PCR中，荧光探针退火温度为60-70℃之间。在另一优选例中，所述探针的双末端进行化学基团的修饰，5'端修饰有荧光激发基团，3端修饰有荧光淬灭基团。在另一优选例中，所述检测为辅助性检测。本专利技术的第二方面，提供了一种试剂盒，所述试剂盒包括选自下组的一个或多个基因突变位点的检测试剂：GNAS基因：NM_001077490:exon1:c.T1019C；NRAS基因：NM_002524:exon3:c.T284C；TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2098G。在另一优选例中，所述试剂盒还包括以下基因突变位点的检测试剂：CHEK2基因：NM_145862:exon11:c.A1250G。在另一优选例中，所述试剂盒还包括以下基因突变位点的检测试剂：PIK3CA基因：NM_006218:exon12:c.1818位缺失C。在另一优选例中，所述试剂盒还包括选自下组的一个或多个基因突变位点的检测试剂：GNAS基因：NM_016592:exon1:c.C205A、NM_016592:exon1:c.C216T。在另一优选例中，所述试剂盒还包括以下基因突变位点的检测试剂：TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2252G。在另一优选例中，所述试剂盒还包括选自下组的一个或多个基因突变位点的检测试剂：BRAF基因：NM_004333:exon15:c.T1799A、NM_004333:exon11:c.G1338A、NM_004333:exon15:c.A1801G；CHEK2基因：NM_145862:exon10:c.C1024T；NRAS基因：NM_002524:exon3:c.C181A、NM_002524:exon3:c.A182G；AKT1基因：NM_001014431:exon3:c.G49A；PPM1D基因：NM_003620:exon1:c.C262T；PTEN基因：NM_000314:exon5:c.C328T；RET基因：NM_020630:exon11:c.T1888C、NM_020630:exon16:c.T2753C；TP53基因：NM_001126115:exon3:c.C265T、NM_000546:exon8:c.G814T。在另一优选例中，所述试剂盒还包括选自下组的一个或多个融合基因的检测试剂：ETV6-NTRK3融合基因：ETV6{ENST00000396373}:r.1_737_NTRK3{ENST00000394480}:r.1719_19984；NCOA4-RET融合基因：NCOA4{ENST00000452682}:r.1_1014_RET{ENST00000355710}:r.2369_5659；CCDC6-RET融合基因：CCDC6{ENST0000本文档来自技高网...

【技术保护点】
选自下组(I)中的一个或多个基因突变位点和/或其检测试剂的用途，用于制备试剂或试剂盒，所述试剂或试剂盒用于鉴别甲状腺结节的良恶性，所述组(I)包括以下基因突变位点：GNAS基因：NM_001077490:exon1:c.T1019C；NRAS基因：NM_002524:exon3:c.T284C；TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2098G。

【技术特征摘要】
1.选自下组(I)中的一个或多个基因突变位点和/或其检测试剂的用途，用于制备试剂或试剂盒，所述试剂或试剂盒用于鉴别甲状腺结节的良恶性，所述组(I)包括以下基因突变位点：GNAS基因：NM_001077490:exon1:c.T1019C；NRAS基因：NM_002524:exon3:c.T284C；TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2098G。2.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述组(I)还包括以下基因突变位点：CHEK2基因：NM_145862:exon11:c.A1250G；和/或所述组(I)还包括以下基因突变位点：PIK3CA基因：NM_006218:exon12:c.1818位缺失C；和/或所述组(I)还包括以下基因突变位点：GNAS基因：NM_016592:exon1:c.C205A、NM_016592:exon1:c.C216T；和/或所述组(I)还包括以下基因突变位点：TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2252G；和/或所述组(I)还包括以下基因突变位点：BRAF基因：NM_004333:exon11:c.G1338A。3.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述的试剂包括引物、探针、芯片、或抗体。4.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括选自下组的一个或多个基因突变位点的检测试剂：GNAS基因：NM_001077490:exon1:c.T1019C；NRAS基因：NM_002524:exon3:c.T284C；TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2098G。5.如权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括以下基因突变位点的检测试剂：CHEK2基因：NM_145862:exon11:c.A1250G；和/或所述试剂盒还包括以下基因突变位点的检测试剂：PIK3CA基因：NM_006218:exon12:c.1818位缺失C；和/或所述试剂盒还包括选自下组的一个或多个基因突变位点的检测试剂：GNAS基因：NM_016592:exon1:c.C205A、NM_016592:exon1:c.C216T；和/或所述试剂盒还包括以下基因突变位点的检测试剂：TSHR基因：NM_000369:exon10:c.A2252G。6.如权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括选自下组的一个或多个基因突变位点的检测试剂：BRAF基因：NM_004333:exon15:c.T1799A、NM_004333:exon11:c.G1338A、NM_004333:exon15:c.A1801G；CHEK2基因：NM_145862:exon10:c.C1024T；NRAS基因：NM_002524:exon3:c.C181A、NM_002524:exon3:c.A182G；AKT1基因：NM_001014431:exon3:c.G49A；PPM1D基因：NM_003620:exon1:c.C262T；PTEN基因：NM_000314:exon5:c.C328T；RET基因：NM_020630:exon11:c.T188...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋怀光，刘磊，
申请(专利权)人：上海安甲生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31