CSFV、PRRSV和SIV H1亚型的三重荧光RT-PCR检测试剂盒及引物、探针制造技术

技术编号:13712485 阅读:137 留言:0更新日期:2016-09-16 17:56
本发明专利技术目的是提供一种针对猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT‑PCR检测试剂盒及引物、探针。本发明专利技术的第一个目的是提供猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光定量RT‑PCR检测试剂盒;本发明专利技术的第二个目的是提供猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的检测引物和探针;本发明专利技术的第三个目的是提供猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光定量RT‑PCR检测方法。本发明专利技术实现在猪中对上述3种病原的快速早期鉴别诊断,由于引物和探针具有很高的特异性和灵敏度,提高了早期鉴别检测效率,并简化了检测方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术目的是提供一种针对猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT-PCR检测试剂盒及引物、探针。
技术介绍
猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)是ssRNA病毒,黄病毒科瘟病毒属,病毒粒子呈圆形,其RNA为单股正链。猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)为动脉炎病毒属,病毒粒子呈球型,是一种有囊膜的单股正链RNA病毒。猪流感病毒(Swine influenza virus,SIV)H1亚型为正黏病毒科甲型流感病毒,病毒粒子多形性,有囊膜,基因组为分节段单股负链RNA。以上三种病原均为RNA病毒,均会造成养猪业巨大经济损失,引起的临床症状有类似之处,甚至有可能同时混合感染,但不同病原感染引起的危害性、流行性及其防控措施截然不同。因此,建立一种区分三种病原的检测方法非常重要,准确灵敏的检测方法能有效防止疾病的传播,减少经济损失。ELISA、RT-PCR等免疫学和分子生物学检测方法已经应用在上述疫病的诊断中,但目前主要用于单一病原的检测,其灵敏性、特异性和简便性等方面均有待进一步提高,普通RT-PCR检测结果的判断需要对产物进行凝胶电泳分析,操作繁琐。本专利技术采用三重荧光RT-PCR检测方法能够同时检测区分这三种病毒,不但可提高灵敏性、特异性和简便性等,还可节约大量时间和成本。上述3种病原都可以通过在保守区域设计特异性引物和探针,进行荧光RT-PCR检测。荧光实时定量PCR(Real-time PCR)是在PCR反应体系中加入荧光基团标记的探针,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过扩增曲线对结果进行分析。AllgloTM探针是美国AlleLogic Biosciences公司推出的最新一代荧光定量探针,它打破传统Taqman探针的一端报告基团一端粹灭基团的限制,其最大优势是探针两端标记同样的荧光基团,探针在水解之前荧光基团互相淬灭,水解后均为报告发光基团,大大提高探针的荧光强度和灵敏性,AllgloTM探针染料上面含有特殊的能提高Tm值的化学基团(BGB),可以大大提高探针特异性。多重荧光定量PCR技术是指在同一个荧光定量PCR扩增试验中同时扩增多个目的基因。在多重定量应用领域,AllgloTM探针避免了TaqMan探针相互抑制的问题,探针染料采用比较容易酶切的化学基团,多条AllgloTM探针在一个反应体系中相互干扰非常小,使一个荧光反应检测多种病原微生物的效果非常好。根据该原理设计特异性多重荧光探针,常用的荧光基团有MAR、JUP、URA等,可通过不同的荧光检测通道,同时检测多种荧光信号。由于该方法引入了特异 性扩增引物和荧光探针,使得检测的灵敏度和特异性得到很大程度的增强,从而避免了其他检测方法特异性不高且容易漏检的问题。
技术实现思路
为了实现同步检测猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型,本专利技术的第一个目的是提供猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光定量RT-PCR检测试剂盒;本专利技术的第二个目的是提供猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的检测引物和探针;本专利技术的第三个目的是提供猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光定量RT-PCR检测方法。本专利技术实现在猪中对上述3种病原的快速早期鉴别诊断,由于引物和探针具有很高的特异性和灵敏度,提高了早期鉴别检测效率,并简化了检测方法。为了实现上述的第一个目的,本专利技术采用的技术方案是:猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT-PCR检测试剂盒,该试剂盒包括脱氧三磷酸核苷混合物、逆转录酶M-MLV、MgCl2、DNA聚合酶、特异性引物和荧光探针、阳性参考品、阴性参考品,所述的特异性引物和Allglo荧光探针序列如下:猪瘟-F:GGACTAGCCRTAGTGGCGAGC猪瘟-R:GGCATGCCCTCGTCCAC猪瘟-P:MAR-CCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGG-MAR;猪繁殖与呼吸综合征病毒-F:TTGTTTGGCTTCACAATCGC猪繁殖与呼吸综合征病毒-R:GTAGAGCGCGCACGGAGTA猪繁殖与呼吸综合征病毒-P:JUP-TTGGCTGGTGGTCTTATGCATCAGACT-JUP;猪流感病毒H1型-F:GTGCTATAAACACCAGCCTYCCA猪流感病毒H1型-R:CGGGATATTCCTTAATCCTGTRGC猪流感病毒H1型-P:URA–CAGAATATACATCCRGTCACAATTGGARAA-URA。对于脱氧三磷酸核苷混合物、MgCl2、DNA聚合酶等,这些组分对于本领域技术人员来说属于公知常识,可根据需要选用。作为优选,猪瘟病毒阳性参考品的序列:AACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGGGCAGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACC;猪繁殖与呼吸综合征病病毒阳性参考品的序列:CTCAGGGTGAACGGTAGAGCGCGCACGGAGTACCGCGGAGCAAACCAGTCTGATGCATAAGACCACCAGCCAACCGGCGATTGTGAAGCCAAACAAAATGGGC;猪流感病毒H1型阳性参考品的序列:ACCCAAGGGTGCTATAAACACCAGCCTCCCATTTCAGAATATACATCCAGTCACAATTGGAGAATGTCCAAAATATGTCAAAAGCACAAAATTGAGAATGGCTACAGGACTAAGGAATATCCCGTCTATTCAAT。为了实现上述的第二个目的,本专利技术采用的技术方案是:猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT-PCR检测用特异性引物和Allglo荧光探针序列,所述的特异性引物和Allglo荧光探针序列如下:猪瘟-F:GGACTAGCCRTAGTGGCGAGC猪瘟-R:GGCATGCCCTCGTCCAC猪瘟-P:MAR-CCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGG-MAR;猪繁殖与呼吸综合征病毒-F:TTGTTTGGCTTCACAATCGC猪繁殖与呼吸综合征病毒-R:GTAGAGCGCGCACGGAGTA猪繁殖与呼吸综合征病毒-P:JUP-TTGGCTGGTGGTCTTATGCATCAGACT-JUP;猪流感病毒H1型-F:GTGCTATAAACACCAGCCTYCCA猪流感病毒H1型-R:CGGGATATTCCTTAATCCTGTRGC猪流感病毒H1型-P:URA–CAGAATATACATCCRGTCACAATTGGARAA-URA。为了实现上述的第三个目的,本专利技术采用的技术方案是:猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT-PCR检测方法,所述方法如下:1)提取待测样品RNA,该步骤所述样品RNA提取可按常规方法进行,如采本文档来自技高网
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【技术保护点】
猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT‑PCR检测试剂盒,其特征在于该试剂盒包括脱氧三磷酸核苷混合物、逆转录酶M‑MLV、MgCl2、DNA聚合酶、特异性引物和荧光探针、阳性参考品、阴性参考品,所述的特异性引物和Allglo荧光探针序列如下:猪瘟‑F:GGACTAGCCRTAGTGGCGAGC猪瘟‑R:GGCATGCCCTCGTCCAC猪瘟‑P:MAR‑CCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGG‑MAR;猪繁殖与呼吸综合征病毒‑F:TTGTTTGGCTTCACAATCGC猪繁殖与呼吸综合征病毒‑R:GTAGAGCGCGCACGGAGTA猪繁殖与呼吸综合征病毒‑P:JUP‑TTGGCTGGTGGTCTTATGCATCAGACT‑JUP;猪流感病毒H1型‑F:GTGCTATAAACACCAGCCTYCCA猪流感病毒H1型‑R:CGGGATATTCCTTAATCCTGTRGC猪流感病毒H1型‑P:URA–CAGAATATACATCCRGTCACAATTGGARAA‑URA。

【技术特征摘要】
1.猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT-PCR检测试剂盒,其特征在于该试剂盒包括脱氧三磷酸核苷混合物、逆转录酶M-MLV、MgCl2、DNA聚合酶、特异性引物和荧光探针、阳性参考品、阴性参考品,所述的特异性引物和Allglo荧光探针序列如下:猪瘟-F:GGACTAGCCRTAGTGGCGAGC猪瘟-R:GGCATGCCCTCGTCCAC猪瘟-P:MAR-CCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGG-MAR;猪繁殖与呼吸综合征病毒-F:TTGTTTGGCTTCACAATCGC猪繁殖与呼吸综合征病毒-R:GTAGAGCGCGCACGGAGTA猪繁殖与呼吸综合征病毒-P:JUP-TTGGCTGGTGGTCTTATGCATCAGACT-JUP;猪流感病毒H1型-F:GTGCTATAAACACCAGCCTYCCA猪流感病毒H1型-R:CGGGATATTCCTTAATCCTGTRGC猪流感病毒H1型-P:URA–CAGAATATACATCCRGTCACAATTGGARAA-URA。2.根据权利要求1所述的猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪流感病毒H1亚型的三重荧光RT-PCR检测试剂盒,其特征在于猪瘟病毒阳性参考品的序列:AACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGGGCAGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACC;猪繁殖与呼吸综合征...

【专利技术属性】
技术研发人员:何永强莫虹斐帅江冰曾若雪门光琦曹爱玲金晨晨张晓峰李辉王素华余招锋
申请(专利权)人:浙江省检验检疫科学技术研究院
类型:发明
国别省市:浙江;33

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