基于肽核酸探针的Wnt信号通路中FoxM1基因突变的检测试剂、PCR检测方法及应用技术

技术编号:12313060 阅读:173 留言:0更新日期:2015-11-11 20:53
本发明专利技术公开了一种基于肽核酸探针的Wnt信号通路中FoxM1基因突变的检测试剂、PCR检测方法及应用,检测试剂有引物和肽核酸荧光探针,引物包括正反向引物,正向引物如序列表中SEQ ID NO.1、NO.3、NO.5、NO.7;反向引物如序列表中SEQ ID NO.2、NO.4、NO.6、NO.8;所述酸荧光探针如序列表中SEQ ID NO.9、NO.10、NO.11、NO.12;野生型互补肽核酸序列如序列表中SEQ ID NO.13、NO.14、NO.15、NO.16。检测方法为基于肽核酸PNA为荧光探针的实时荧光定量PCR方法。本发明专利技术为抗癌药物筛选,新靶向药物探讨及基础科学研究等提供了工具。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学生物核酸检测
,具体涉及一种基于肽核酸探针的 Wnt信号通路中FoxMl基因突变的检测试剂、PCR检测方法及应用。
技术介绍
Wnt信号通路广泛存在于无脊椎动物和脊椎动物中,是一类在物种进化过程中高 度保守的信号通路。Wnt信号在动物胚胎的早期发育、器官形成、组织再生和其它生理过 程中,具有至关重要的作用。如果这条信号通路中的关键蛋白发生突变或者异常表达,导 致信号异常活化,就可能诱导癌症的发生。Wnt信号通路包括经典的Wnt信号通路与非经 典的Wnt信号通路,在经典通路即Wnt-0 -catenin信号通路中,Wnt因子通过激活细胞膜 上的Frizzle/LRP5/6协同受体后抑制细胞内游离0-catenin蛋白的磷酸化和降解,细 胞质中的0-catenin蛋白水平升高后将发生0-catenin蛋白的核移位,导致细胞核中 0-catenin蛋白升高,胞核中0-catenin蛋白能够联合Pygo2、Bcl-9以及FoxMl蛋白共 同与TCF/LEF-1转录因子家族形成复合体并激活Wnt信号通路下游靶基因的转录激活。 FoxMl蛋白是Wnt信号通路中0-catenin下游重要成员之一,目前越来越多的研 究已经发现,除了 Pyg〇2蛋白外,在很多肿瘤中FoxMl蛋白也呈现高表达。目前研究核心信号通路的核心分子调控机制,以及某些重要成员在细胞中的表达 水平,已经成为治疗肿瘤的一种关键手段,虽然近年来Wnt信号通路在癌症中的研究,以及 FoxMl蛋白作为Wnt信号通路重要成员其表达水平的研究,已经成为研究开发肿瘤药物急 需解决的重要问题,但是同时其在很多肿瘤细胞中基因的突变也越来越多,对FoxMl蛋白 发挥功能起着非常重要的作用,例如在肺腺癌细胞中检测出S55C突变、R256G突变,皮肤黑 色素瘤细胞中检测出P271Q突变,膀胱尿路上皮癌细胞中检测出的L318F突变。 肽核酸(peptide nucleic acids,PNA)是一类以多肽骨架取代糖磷酸主链的DNA 类似物。它是在第一代、第二代反义试剂的基础上,通过计算机设计构建并最终人工合成 的第三代反义试剂,是一种全新的DNA类似物,即以中性的肽链酰胺2-氨基乙基甘氨酸键 取代了 DNA中的戊糖磷酸二酯键骨架,其余的与DNA相同,PNA可以通过Watson-Crick碱 基配对的形式识别并结合DNA或RNA序列,形成稳定的双螺旋结构。由于PNA不带负电荷, 与DNA和RNA之间不存在静电斥力,因而结合的稳定性和特异性都大为提高;不同于DNA或 DNA、RNA间的杂交,PNA与DNA或RNA的杂交几乎不受杂交体系盐浓度影响,与DNA或RNA 分子的杂交能力远优于DNA/DNA或DNA/RNA,表现在很高的杂交稳定性、优良的特异序列识 别能力、不被核酸酶和蛋白酶水解。
技术实现思路
本专利技术的目的是针对上述现状,旨在提供一种能确定Wnt信号通路中核心的信号 分子FoxMl基因突变情况,能解释核心分子FoxMl在肿瘤细胞中变化,结果重复性,敏感性 好的基于肽核酸探针的Wnt信号通路中FoxMl基因突变的检测试剂、PCR检测方法及应用。 本专利技术目的的实现方式为,基于肽核酸探针的Wnt信号通路中FoxMl基因突变的 检测试剂,包括引物和探针,所述引物包括正向引物和反向引物,所述探针为肽核酸探针; 所述检测FoxMl基因S55C突变正向引物如序列表中SEQ ID NO. 1; 所述检测FoxMl基因S55C突变反向引物如序列表中SEQ ID NO. 2; 所述检测FoxMl基因R256G突变正向引物如序列表中SEQ ID NO. 3; 所述检测FoxMl基因R256G突变反向引物如序列表中SEQ ID NO. 4; 所述检测FoxMl基因P271Q突变正向引物如序列表中SEQ ID NO. 5 ; 所述检测FoxMl基因P271Q突变反向引物如序列表中SEQ ID NO. 6; 所述检测FoxMl基因L318F突变正向引物如序列表中SEQ ID NO. 7; 所述检测FoxMl基因L318F突变反向引物如序列表中SEQ ID NO. 8; 所述检测FoxMl基因S55C突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO. 9; 所述检测FoxMl基因R256G突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO. 10; 所述检测FoxMl基因P271Q突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO. 11。 所述检测FoxMl基因L318F突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO. 12; 所述肽核酸荧光探针的5'端和3'端分别用荧光报告基团和淬灭基团修饰,修饰 所述5'端的荧光报告基团为:FAM、HEX、TET、J0E、VIC、R0X、Cy3或Cy5,修饰所述3'端的 淬灭基团为:TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3 或 DABCYL。 基于肽核酸探针的Wnt信号通路中FoxMl基因突变的检测试剂进行检测的方法, 检测方法为基于肽核酸为荧光探针的实时荧光定量PCR方法; 所述实时荧光定量PCR的反应体系为:正向引物、反向引物、DEPC7K、具有5' 一3' 外切活性的 DNA 聚合酶、dNTPs、10XPCR Buffer、RNASIN、M-MLV 逆转录酶、oligo(dT)和含 Mg离子的溶液; 所述具有5' 一 3'外切活性的DNA聚合酶为Taq酶。 基于肽核酸探针的Wnt信号通路中FoxMl基因突变的检测试剂的应用,用于制备 检测肿瘤细胞及正常细胞的检测试剂,所述癌细胞为肺腺癌细胞、皮肤黑色素瘤细胞或膀 胱尿路上皮细胞。 本专利技术采用特异序列的PNA寡聚物作为探针。由于PNA是一种人工合成的核酸的 类似物,并且为非手性、不带电荷的分子,避免了寡核苷酸与其靶基因结合时因电荷相互排 斥所导致的杂交不稳定性,结合不易受杂交液离子强度的影响,从而显示出极强的杂交优 势,大大提高了检测灵敏度。 与现有技术相比,本专利技术的优点和积极效果是:FoxMl基因是新发现的Wnt信号通 路中P-catenin蛋白下游的发挥着重要功能的基因,本专利技术提供了直接检测Wnt信号通路 中FoxMl基因突变检测的试剂,借助于所述检测试剂能够通过实时荧光定量PCR法在转录 水平快速检测出FoxMl基因的突变,而与普通实时荧光定量PCR不同的是,我们使用的肽核 酸PNA荧光探针更加灵敏,本专利技术为抗癌药物的筛选,新靶向药物的机制研究都提供了非 常有力的工具。【附图说明】 图1是本专利技术实施例中所述肽核酸质谱图; 图2是本专利技术实施例中所述S55C突变型和野生型参考品PCR扩增图; 图3是本专利技术实施例中所述R256G突变型和野生型参考品PCR扩增图; 图4是本专利技术实施例中所述P271Q突变型和野生型参考品PCR扩增图; 图5是本专利技术实施例中所述L318F突变型和野生型参考品PCR扩增图。【具体实施方式】 基于肽核酸探针的Wnt信号通路中Pyg〇2基因突变的检测试剂,所述引物包括正 向引物和反向引物,所述探针为肽核酸探针,其特征在于: 所述检测Pygo2基因R46S突变正向引物如序列表中SEQ ID NO. 1 ; 所述检测Pygo2基本文档来自技高网
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【技术保护点】
基于肽核酸探针的Wnt信号通路中FoxM1基因突变的检测试剂,包括引物和探针,所述引物包括正向引物和反向引物,所述探针为肽核酸探针,其特征在于:所述检测FoxM1基因S55C突变正向引物如序列表中SEQ ID NO.1;所述检测FoxM1基因S55C突变反向引物如序列表中SEQ ID NO.2;所述检测FoxM1基因R256G突变正向引物如序列表中SEQ ID NO.3;所述检测FoxM1基因R256G突变反向引物如序列表中SEQ ID NO.4;所述检测FoxM1基因P271Q突变正向引物如序列表中SEQ ID NO.5;所述检测FoxM1基因P271Q突变反向引物如序列表中SEQ ID NO.6;所述检测FoxM1基因L318F突变正向引物如序列表中SEQ ID NO.7;所述检测FoxM1基因L318F突变反向引物如序列表中SEQ ID NO.8;所述检测FoxM1基因S55C突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO.9;所述检测FoxM1基因R256G突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO.10;所述检测FoxM1基因P271Q突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO.11。所述检测FoxM1基因L318F突变PNA荧光探针如序列表中SEQ ID NO.12;所述肽核酸荧光探针的5'端和3'端分别用荧光报告基团和淬灭基团修饰,修饰所述5'端的荧光报告基团为:FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3或Cy5,修饰所述3'端的淬灭基团为:TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:唐景峰陈兴珍周策凡张毅代俊周梦舟
申请(专利权)人:湖北工业大学
类型:发明
国别省市:湖北;42

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