【技术实现步骤摘要】
编辑RNA的方法和组合物
[0001]本申请是申请号为201980067380.1、专利技术名称为“编辑RNA的方法和组合物”的中国专利申请的分案申请。
[0002]对相关申请的交叉引用
[0003]本申请要求于2018年10月12日提交的国际申请号PCT/CN2018/110105的国际申请,和于2019年4月15日提交的国际申请号CN2019/082713的国际申请的优先权,其内容在此通过提及以其整体并入。
[0004]以ASCII文本文件提交序列表
[0005]以下以ASCII文本文件提交的内容在此通过提及以其整体并入:序列表的计算机可读形式(CRF)(文件名:FC00158PCT
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zhc.TXT,记录日期:2019年10月11日,大小:104KB)。
[0006]本专利技术涉及利用工程化RNA来编辑RNA的方法和组合物,工程化RNA能够募集腺苷脱氨酶用以使靶标RNA中的一个或多个腺苷脱氨基。
技术介绍
[0007]基因组编辑是生物医学研究和疾病疗法开发的有力工具。到目前为止,最流行的基因编辑技术是成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats,CRISPR)
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Cas系统,它是从细菌和古细菌的适应性免疫系统开发出来的。CRISPR ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种编辑宿主细胞中靶标RNA的方法,包含将脱氨酶募集RNA(dRNA)或编码所述dRNA的构建体引入所述宿主细胞,其中所述dRNA包含与所述靶标RNA杂交的互补RNA序列,并且其中所述dRNA能够募集作用于RNA的腺苷脱氨酶(ADAR)以使所述靶标RNA中的靶标腺苷脱氨基。2.如权利要求1所述的方法,其中所述dRNA的长度大于70个核苷酸。3.如权利要求2所述的方法,其中所述dRNA的长度为约100至约150个核苷酸。4.如权利要求1
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3中任一项所述的方法,其中所述ADAR由所述宿主细胞内源表达。5.如权利要求1
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4中任一项所述的方法,其中所述宿主细胞是原代细胞。6.如权利要求5所述的方法,其中所述宿主细胞是T细胞。7.如权利要求1
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6中任一项所述的方法,其中所述dRNA不包含ADAR募集结构域。8.如权利要求1
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7中任一项所述的方法,其中所述dRNA不包含化学修饰的核苷酸。9.如权利要求8所述的方法,其包括将编码所述dRNA的构建体引入所述宿主细胞,其中所述构建体是病毒载体或质粒。10.如权利要求1
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9中任一项所述的方法,其中所述RNA序列包含与所述靶标RNA中的所述靶腺苷正对的胞苷、腺苷或尿苷。11.如权利要求10所述的方法,其中所述RNA序列包含与所述靶标RNA中的所述靶腺苷正对的胞苷错配。12.如权利要求11所述的方法,其中所述胞苷错配位于所述dRNA中距所述互补序列的3'端至少20个核苷酸,并且距所述互补序列的5'端至少5个核苷酸。13.如权利要求12所述的方法,其中所述胞苷错配位于所述dRNA中所述互补序列中心的10个核苷酸内。14.如权利要求1至13中任一项所述的方法,其中所述互补序列还包含一个或多个鸟苷,其各自与所述靶标RNA中的非靶腺苷相对。15.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述互补序列包含与所述靶标RNA中的非靶腺苷相对的两个或更多个连续错配核苷酸。16.如权利要求1
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15中任一项所述的方法,其中所述靶标RNA中所述靶标腺苷的5'侧最近邻位是选自U,C,A和G的核苷酸,优先度U>C≈A>G,而所述靶标RNA中所述靶标腺苷的3'侧最近邻位是选自G,C,A和U的核苷酸,优先度G>C>A≈U。17.如权利要求1
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16中任一项所述的方法,其中所述靶标RNA中的所述靶标腺苷位于选自由UAG,UAC,UAA,UAU,CAG,CAC,CAA,CAU,AAG,AAC,AAA,AAU,GAG,GAC,GAA和GAU构成的组的三碱基基序中。18.如权利要求17所述的方法,其中所述三碱基基序是UAG,并且其中所述dRNA包含与所述三碱基基序中的尿苷正对的A,与所述靶标腺苷正对的胞苷,以及与所述三碱基基序中的鸟苷正对的胞苷、鸟苷或尿苷。19.如权利要求1
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18中任一项所述的方法,其中所述靶标RNA是选自由前信使RNA,信使RNA,核糖体RNA,转移RNA,长非编码RNA和小RNA构成的组的RNA。20.如权利要求19所述的方法,其中所述靶标RNA是前信使RNA。21.如权利要求1至20中任一项所述的方法,其进一步包括将ADAR3的抑制剂引入所述宿主细胞。
22.如权利要求1
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21中任一项所述的方法,其进一步包括将干扰素的刺激物引入所述宿主细胞。23.如权利要求1
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22中任一项所述的方法,其包括引入分别靶向不同靶标RNA的多个dRNA。24.如权利要求1至23中任一项所述的方法,其中编辑所述靶标RNA的效率为至少5%。25.如权利要求1至24中任一项所述的方法,其中所述dRNA不诱导免疫应答。26.如权利要求1至25中任一项所述的方法,...
【专利技术属性】
技术研发人员:魏文胜,璩良,伊宗裔,朱诗优,王春慧,曹中正,周卓,袁鹏飞,
申请(专利权)人:北京辑因医疗科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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