检测10种海域致病菌的基因芯片制造技术

本发明专利技术公开了检测10种海域致病菌的基因芯片，包括固相载片，固相载片上设有质控探针和检测探针，检测探针的核苷酸序列组份为SEQ?ID?NO.1-SEQ?ID?NO.27所示，可以同时检测出阴沟肠杆菌、迟缓爱德华菌、粪链球菌、强壮弧菌、哈维氏弧菌、副溶血弧菌、灿烂弧菌、创伤弧菌、鳗弧菌和黄海希瓦氏菌，而且不需要活的细菌，只要有DNA即可；具有高通量、平行性、微型化、自动化、快速灵敏、定量、样品用量少等显著优点。

Gene chip for detecting 10 kinds of marine pathogenic bacteria

The invention discloses a gene chip detection of 10 marine pathogens, including solid phase carrier, solid carrier plate is provided with a control probe and probe detection, detection of nucleotide probe components for SEQ? ID? NO.1-SEQ? ID? NO.27, can simultaneously detect Enterobacter cloacae, Streptococcus faecalis, and delayed Edward Rand strong Vibrio, Vibrio harveyi, Vibrio parahaemolyticus, Vibrio splendidus, Vibrio anguillarum and Vibrio vulnificus and Shewanella the Yellow Sea, and do not need to live bacteria, as long as there is DNA; with high throughput, parallel, miniaturization, automation, rapid, quantitative, small amount of sample and other significant advantages.

【技术实现步骤摘要】
检测10种海域致病菌的基因芯片
本专利技术涉及细菌基因芯片，具体涉及检测10种海域致病菌的基因芯片。
技术介绍
随着人类对海洋开发力度的加大,海域生态环境承载的压力也与日俱增,而由于病原微生物在海洋环境中的存在与适宜条件下的大量繁殖，影响了人类对海洋的开发与利用活动，影响了近岸海域的海洋功能，也对人体健康造成了潜在的威胁。首先如人、畜共患致病菌通过食用海产品等途径感染人类，严重危及人类的健康和生命安全，因海产品中的霍乱弧菌和副溶血弧菌等引发的霍乱和腹泻等事件频发。其次，由于滨海游泳、水上运动、旅游、度假等休闲娱乐活动而传播的细菌性疾病，已成为严重的公众健康问题。还有我国沿海有600多个大型排污口，约84%的入海排污口超标排放污染物。而船舶排放压舱水及受到污损的船体、锚链等也是造成地理性隔离水体间有害生物传播的最主要途径。有些致病微生物的抗性远远超过陆生微生物，也是引发大多数感染性疾病的病原体，它给人类带来的灾难有时甚至是毁灭性的。因此，致病菌的快速、准确、灵敏、特异的诊断技术是有效预防感染性疾病发生，控制其暴发性传播的前提和关键。因为自然环境中仅有小于1%左右的微生物可培养，而基因芯片不需要活的细菌，只要有DNA即可；基因芯片具有高通量、平行性、微型化、自动化、快速灵敏、定量、样品用量少等显著特点。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技 术问题是提供一种高通量、检测灵敏的检测10种海域致病囷的基因芯片。本专利技术的技术方案是检测10种海域致病菌的基因芯片，包括固相载片，所述固相载片上设有质控探针和检测探针，所述检测探针如下:阴沟肠杆菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.1和SEQ ID N0.2所示，迟缓爱德华菌的检测探针的核苷酸序列如SEQID N0.3和SEQ ID N0.4所示，粪链球菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.5、SEQ IDN0.6和SEQ ID N0.7所示，强壮弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.8、SEQ ID N0.9和SEQ ID N0.10所示，哈维氏弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.11和SEQ IDN0.12所示，副溶血弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.13、SEQ ID N0.14和SEQID N0.15所示，灿烂弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.16和SEQ ID N0.17所示，创伤弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.18,SEQ ID N0.19,SEQ ID N0.20、SEQ IDN0.21和SEQ ID N0.22所示，鳗弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.23和SEQ IDN0.24所示，黄海希瓦氏菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.25、SEQ ID N0.26和SEQID N0.27 所示。所述质控探针HEX的核苷酸序列如SEQ ID N0.28所示，PC的核苷酸序列如SEQID N0.29所示，NC的核苷酸序列如SEQ ID N0.30所示。与现有技术相比本专利技术优点在于检测10种海域致病菌的基因芯片，包括固相载片，固相载片上设有质控探针和检测探针，检测探针的核苷酸序列组份为SEQ ID N0.1-SEQID N0.27所示，可以同时检测出阴沟肠杆菌、迟缓爱德华菌、粪链球菌、强壮弧菌、哈维氏弧菌、副溶血弧菌、灿烂弧菌、创伤弧菌、鳗弧菌和黄海希瓦氏菌，而且不需要活的细菌，只要有DNA即可；具有高通量、平行性、微型化、自动化、快速灵敏、定量、样品用量少等显著优点。【具体实施方式】以下结合实施例对本专利技术作进一步详细描述。一、固相载体(基片)的选取常用的固相载体包括尼龙膜、硝酸纤维素膜、玻璃片和各种有机高分子制作的薄膜等，本实施例所使用的为75.5mmX25.2mmXl.0mm的玻璃片作为基片，要求外观无划痕、无缺损，玻璃片表面要经过化学修饰后，才能将DNA探针固定在基片上，现有的玻璃片表面化学修饰主要有氨基修饰、醛基修饰和巯基修饰。本实施例选择对玻璃片进行醛基修饰，为北京博奥生物有限公司的产品。二、探针的制备1、质控探针的设计:在芯片设计时采用了表1所示的质控探针，探针均在NCBI中进行了比对，和己知基因无明显同源性，也可市售其它质控探针，只要与己知基因无明显同源性即可。表1:质控探针表本文档来自技高网...

【技术保护点】
检测10种海域致病菌的基因芯片，包括固相载片，所述固相载片上设有质控探针和检测探针，其特征在于所述检测探针如下：阴沟肠杆菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.2所示，迟缓爱德华菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.4所示，粪链球菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.5、SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.7所示，强壮弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.8、SEQ?ID?NO.9和SEQ?ID?NO.10所示，哈维氏弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.11和SEQ?ID?NO.12所示，副溶血弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.13、SEQ?ID?NO.14和SEQ?ID?NO.15所示，灿烂弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.16和SEQ?ID?NO.17所示，创伤弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.18、SEQ?ID?NO.19、SEQ?ID?NO.20、SEQ?ID?NO.21和SEQ?ID?NO.22所示，鳗弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24所示，黄海希瓦氏菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.25、SEQ?ID?NO.26和SEQ?ID?NO.27所示。...

【技术特征摘要】
1.检测10种海域致病菌的基因芯片，包括固相载片，所述固相载片上设有质控探针和检测探针，其特征在于所述检测探针如下:阴沟肠杆菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ IDN0.1和SEQ ID N0.2所示，迟缓爱德华菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.3和SEQ IDN0.4所示，粪链球菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.5,SEQ ID N0.6和SEQ ID N0.7所示，强壮弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.8,SEQ ID N0.9和SEQ ID N0.10所示，哈维氏弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.11和SEQ ID N0.12所示，副溶血弧菌的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID N0.13、SEQ ID N0.14和SEQ ID N0...

【专利技术属性】
技术研发人员：苏秀榕，周君，李太武，
申请(专利权)人：宁波大学，
类型：发明
国别省市：