【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及用于扩增UGTlAl基因的引物对,含有该引物对的UGTlAl基因扩增用试剂及其用途。
技术介绍
已知葡糖醛酸转移酶(UDP-葡糖醛酸基转移酶UGT)是一种已知的药物代谢酶, 是一种催化将葡糖醛酸结合到药物、异物、作为内源性物质的胆红素、留类激素、胆汁酸等上的反应的酶。已报道了 UGT有被分类为UGTl家族和UGT2家族的多种同工酶。这些同工酶中,编码属于UGTl家族的UGTlAl的基因(UGT1A1基因)存在基因多态性,一般而言认为这与抗癌剂盐酸伊立替康(Irinotecan)的副作用的表现相关。具体而言,据报道,患者UGTlAl基因具有多态性时,通过UGT将具有高抗肿瘤活性的伊立替康水解物(SN-38) 解毒的能力下降,因而发生白血球减少和腹泻等严重的副作用。与这种副作用相关的代表性的基因多态性已知有启动子区域的多态性UGT1AN28,外显子1的多态性UGT1A1*6 和UGT1AN27。尤其是据报道包括日本人在内的亚洲人中,由于除了最重要的多态性 UGT1AN28,还同时具有多态性UGT1A1*6和UGT1AN27的至少一种,因而容易出现更强的副作用。另外,UGTlAl由于与生物体内的由葡糖醛酸产生的结合胆红素相关,因此其多态性也是吉伯综合症等体质性黄疸的成因。因此,研究UGTlAl基因的多个多态性对于预测抗癌剂所产生的副作用的程度,预测副作用的发生十分重要。另一方面,作为在基因水平分析所有疾病的成因、个体间疾病易感性(容易患病性)、个体间药效差异等的方法,现在广泛使用点突变,即所谓单核苷酸多态性(SNP)的检测。作为点突变的一般的检测 ...
【技术保护点】
1.一种探针,其特征在于,其为用于检测UGT1A1基因的多态性的探针,其由下述(1)的寡核苷酸构成,与序列号1中的、以第2173位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基,朝着5’方向直至第17~25个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以前述胞嘧啶碱基作为3’末端。
【技术特征摘要】
2006.11.30 JP 2006-322955;2007.09.07 JP 2007-232611.一种探针,其特征在于,其为用于检测UGTlAl基因的多态性的探针,其由下述(1)的寡核苷酸构成,与序列号1中的、以第2173位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基,朝着5’方向直至第 17 25个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以前述胞嘧啶碱基作为 3’末端。2.根据权利要求1所述的探针,所述寡核苷酸(1)为序列号51 58中的任意一种寡核苷酸。3.根据权利要求2所述的探针,所述寡核苷酸(1)为序列号55的寡核苷酸和序列号 56的寡核苷酸中的至少一种。4.根据权利要求1所述的探针,所述探针为荧光标记探针。5.一种试剂,其特征在于,其为用于检测UGTlAl基因的多态性的试剂,含有权利要求1 所述的探针。6.根据权利要求5所述的试剂,其还含有由下述(2-1)的寡核苷酸构成的探针、由下述 (2-2)的寡核苷酸构成的探针和由下述(3)的寡核苷酸构成的探针组成的组中的至少一种探针,(2-1)与序列号1中的、以第沈45位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基,朝着5’方向直至第15 22个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以前述胞嘧啶碱基作为3’末端,禾口(2-2)与序列号1中的、以第沈25位的鸟嘌呤碱基(G)作为第1个碱基,朝着3’方向直至第17 22个碱基的区域互补的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以与前述鸟嘌呤碱基互补的胞嘧啶碱基(C)作为3’末端中的至少一种,(3)与序列号1中的、以第1892位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基,朝着3’方向直至第25 31个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以前述胞嘧啶碱基作为3’末端。7.根据权利要求6所述的试剂,所述的寡核苷酸为序列号59 66中的任意一种寡核苷酸,所述0-2)的寡核苷酸为序列号100 105中的任意一种寡核苷酸,所述(3) 的寡核苷酸为序列号6773中的任意一种寡核苷酸。8.根据权利要求7所述的试剂,所述的寡核苷酸为由序列号62的碱基序列构成的寡核苷酸,所述0-2)的寡核苷酸为序列号102的寡核苷酸,所述C3)的寡核苷酸为序列号69的寡核苷酸。9.根据权利要求5所述的试剂,所述探针为荧光标记探针。10.一种多态性分析方法,其特征在于,其为分析UGTlAl基因中的检测对象部位的多态性的方法,包括以下步骤(i) (iv)(i)以试样中的核酸为模板,在反应液中扩增UGTlAl基因中包含检测对象部位的区域的步骤;( )准备含有所述步骤⑴中的扩增产物和权利要求5所述的试剂的反应液的步骤;(iii)改变所述反应液的温度,测定所述扩增产物和所述试剂中的探针的杂交产物显示融解状态的信号值的步骤;(iv)根据伴随温度变化的所述信号值的变动,决定所述检测对象部位的多态性的步马聚ο11.根据权利要求10所述的多态性解析方法,在所述(i)步骤中,在扩增反应之前,向所述反应液中添加权利要求5所述的试剂。12.根据权利要求10所述的多态性解析方法,所述试样为生物体试样。13.根据权利要求12所述的多态性解析方法,所述生物体试样为全血。14.根据权利要求10所述的多态性解析方法,所述试剂还含有由下述的寡核苷酸构成的探针、由下述0-2)的寡核苷酸构成的探针和由下述(3)的寡核苷酸构成的探针组成的组中的至少一种探针,(2-1)与序列号1中的、以第沈45位的胞嘧啶碱基(C)作为第1个碱基,朝着5’方向直至第15 22个碱基的区域序列相同的至少一种寡核苷酸,该寡核苷酸以前述胞嘧啶碱基作为3’末端, 禾口(2-2)与序列号1中的、以第沈25位的鸟嘌呤碱基(G)作为第...
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