【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】酮还原酶多肽及其用途1.相关申请的交叉引用本申请根据美国法典第35编专利法第119(e)条要求在2007年9月28日提交的 序号为60/976,345的申请的权益,所述申请的内容通过引用被并入本文。2.对序列表、表格或计算机程序的引用根据37C. F. R. 1. 821以计算机可读形式(CRF)通过EFS-Web使用文件名 376247-018. txt随本申请共同提交的序列表通过引用被并入本文。电子版的序列表创建于 2008年9月28日,其文件大小为254千字节。3.背景属于酮还原酶(KRED)或羰基还原酶类别(EC1. 1. 1. 184)的酶用于从相应的前立 体异构(prostereoisomeric)酮底物或相应的外消旋(racemic)醛底物合成旋光的醇。 KRED通常将酮或醛转化为相应的醇产物,但是还可以催化逆反应,即醇底物被氧化为相应 的酮/醛产物。酶例如KRED对酮和醛的还原以及醇的氧化需要辅助因子,其中最常见的为 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)或还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)以及 用于氧化反应的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)或烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP)。NADH 和NADPH充当电子供体,而NAD和NADP充当电子受体。经常观察到酮还原酶和醇脱氢酶接 受磷酸化的或非磷酸化的辅助因子(以其氧化态和还原态)。可在大范围的细菌和酵母中发现KRED酶(关于综述,参见Kraus和Waldman, 1995,Enzyme catalysis in organic synthesis (有机合成中的酶催化),卷 1 和 ...
【技术保护点】
一种能够以SEQ ID NO:4多肽速率的至少1.5倍的速率将底物2-[3-[3-[2-(7-氯-2-喹啉基)乙烯基]苯基]-3-氧代丙基]苯甲酸甲酯转化为产物(S,E)-2-(3-(3-(2-(7-氯喹啉-2-基)乙烯基)苯基)-3-羟丙基)苯甲酸甲酯的酮还原酶多肽。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】US 2007-9-28 60/976,345一种能够以SEQ ID NO4多肽速率的至少1.5倍的速率将底物2-[3-[3-[2-(7-氯-2-喹啉基)乙烯基]苯基]-3-氧代丙基]苯甲酸甲酯转化为产物(S,E)-2-(3-(3-(2-(7-氯喹啉-2-基)乙烯基)苯基)-3-羟丙基)苯甲酸甲酯的酮还原酶多肽。2.根据权利要求1所述的多肽,其能够将所述底物转化为具有至少约95%的百分比立 体异构过量的所述产物。3.根据权利要求1所述的多肽,其能够将所述底物转化为具有至少约99%的百分比立 体异构过量的所述产物。4.根据权利要求1所述的多肽,其包括与具有下述特征的基于SEQIDN0:2、4或114 的参考序列至少约85%相同的氨基酸序列对应于X190的残基是脯氨酸,而且对应于X202 的残基是色氨酸;条件是所述酮还原酶多肽具有这样的氨基酸序列,其中对应于X190的残 基是受限残基,而且对应于X202的残基是芳香族残基。5.根据权利要求1所述的多肽,其包括与具有下述特征的基于SEQIDN0:2、4或114的 参考序列至少约85%相同的氨基酸序列对应于X190的残基是脯氨酸;对应于X195的残 基是精氨酸;而且对应于X202的残基是色氨酸;条件是所述酮还原酶多肽具有这样的氨基 酸序列,其中对应于X190的残基是受限残基,对应于X195的残基是碱性的、酸性的、非极性 的或极性的残基,而且对应于X202的残基是芳香族残基。6.根据权利要求4所述的多肽,其包括这样的氨基酸序列,其中对应于X190的残基是 脯氨酸,而且对应于X202的残基是色氨酸。7.根据权利要求5所述的多肽,其包括这样的氨基酸序列,其中对应于X190的残基是 脯氨酸,对应于X195的残基是精氨酸,而且对应于X202的残基是色氨酸。8.根据权利要求4至7任一项所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或 多种下述特征对应于X7的残基是受限的或非极性的残基; 对应于X17的残基是非极性的或脂肪族的残基; 对应于X25的残基是极性的或酸性的残基; 对应于X27的残基是芳香族的残基; 对应于X41的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X53的残基是极性的、非极性的或酸性的残基; 对应于X57的残基是非极性的或脂肪族的残基; 对应于X64的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X66的残基是酸性的残基;对应于X68的残基是极性的、酸性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X72的残基是碱性的残基; 对应于X76的残基是脂肪族的、非极性的或极性的残基; 对应于X80的残基是脂肪族的、非极性的或极性的残基; 对应于X93的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X95的残基是脂肪族的、非极性的或酸性的残基;对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X97的残基是碱性的、受限的或极性的残基;对应于XlOO的残基是碱性的、酸性的、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X108的残基是碱性的或受限的残基;对应于Xlll的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X139的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X145的残基是酸性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X148的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X151的残基是受限的、非极性的或脂肪族的残基;对应于X152的残基是极性的、芳香族的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X163的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X165的残基是极性的、非极性的或脂肪族的残基;对应于X173的残基是酸性的、非极性的或脂肪族的残基;对应于X179的残基是芳香族的、碱性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X194的残基是受限的、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X196的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X197的残基是酸性的残基;对应于X198的残基是酸性的或极性的残基;对应于X210的残基是极性的或碱性的残基;对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;对应于X212的残基是极性的、脂肪族的或非极性的;对应于X216的残基是受限的或碱性的残基;对应于X223的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X226的残基是非极性的或极性的残基;对应于X233的残基是极性的或酸性的;对应于X235的残基是极性的或芳香族的残基;对应于X248的残基是非极性的或芳香族的残基;对应于X249的残基是芳香族的残基;而且其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。9.根据权利要求4至7任一项所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或 多种下述特征对应于X7的残基是组氨酸; 对应于X17的残基是甲硫氨酸; 对应于X25的残基是天冬氨酸; 对应于X27的残基是酪氨酸; 对应于X41的残基是丝氨酸或丙氨酸; 对应于X53的残基是天冬氨酸;对应于X57的残基是缬氨酸; 对应于X64的残基是缬氨酸; 对应于X66的残基是谷氨酸;对应于X68的残基是缬氨酸; 对应于X72的残基是精氨酸; 对应于X76的残基是丙氨酸; 对应于X80的残基是苏氨酸或缬氨酸; 对应于X93的残基是丝氨酸; 对应于X94的残基是半胱氨酸或甘氨酸; 对应于X95的残基是亮氨酸或谷氨酸;对应于X96的残基是半胱氨酸、天冬酰胺、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸或苏氨酸;对应于X97的残基是组氨酸或丝氨酸;对应于XlOO的残基是赖氨酸;对应于X108的残基是组氨酸;对应于Xlll的残基是甲硫氨酸;对应于X139的残基是亮氨酸;对应于X145的残基是谷氨酰胺或亮氨酸;对应于X147的残基是亮氨酸;对应于X148的残基是缬氨酸;对应于X151的残基是丙氨酸;对应于X152的残基是丝氨酸;对应于X163的残基是异亮氨酸;对应于X165的残基是天冬酰胺;对应于X173的残基是缬氨酸;对应于X179的残基是苯丙氨酸、赖氨酸或亮氨酸;对应于X194的残基是谷氨酰胺、丝氨酸或亮氨酸;对应于X196的残基是亮氨酸;对应于X197的残基是谷氨酸;对应于X198的残基是谷氨酸或谷氨酰胺;对应于X210的残基是精氨酸;对应于X211的残基是缬氨酸、亮氨酸、苏氨酸或异亮氨酸;对应于X212的残基是丝氨酸或缬氨酸;对应于X216的残基是精氨酸;对应于X223的残基是缬氨酸;对应于X226的残基是苏氨酸;对应于X233的残基是天冬酰胺或天冬氨酸;对应于X235的残基是色氨酸;对应于X248的残基是甘氨酸或色氨酸;对应于X249的残基是色氨酸;而且其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。10.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基,而且 对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;而且 其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。11.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基, 对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基;而且 其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。12.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;而且 其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。13.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X194的残基是受限的、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;而且 其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。14.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基;对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X194的残基是受限的、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;而且其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。15.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X93的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;而且 其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。16.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X93的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X94的残基是半胱氨酸、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于XlOO的残基是碱性的、酸性的、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X152的残基是极性的、芳香族的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X194的残基是受限的、极性的、脂肪族的或非极性的残基; 对应于X196的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;而且 其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。17.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X7的残基是受限的或非极性的残基;对应于X66的残基是酸性的残基;对应于X93的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X94的残基是半胱氨酸、非极性的或脂肪族的残基;对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X194的残基是受限的、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X196的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X198的残基是酸性的或极性的残基;对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基;而且 其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。18.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有一种或多种或至 少所有的下述特征对应于X7的残基是受限的或非极性的残基;对应于X17的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X27的残基是芳香族的残基; 对应于X64的残基是极性的、非极性的或脂肪族的残基; 对应于X66的残基是酸性的残基;对应于X80的残基是脂肪族的、非极性的或极性的残基;对应于X93的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X94的残基是半胱氨酸、非极性的或脂肪族的残基;对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于XlOO的残基是碱性的或受限的残基;对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X194的残基是受限的、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X196的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X198的残基是酸性的或极性的残基;对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基; 对应于X216的残基是受限的或碱性的残基;其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。19.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有所有的下述特征 对应于X7的残基是受限的或非极性的残基;对应于X17的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X27的残基是芳香族的残基;对应于X64的残基是极性的、非极性的或脂肪族的残基;对应于X80的残基是脂肪族的、非极性的或极性的残基;对应于X93的残基是极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X94的残基是半胱氨酸、非极性的或脂肪族的残基;对应于X96的残基是半胱氨酸、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于XlOO的残基是碱性的或受限的残基;对应于X147的残基是芳香族的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X194的残基是受限的、极性的、脂肪族的或非极性的残基;对应于X196的残基是非极性的或脂肪族的残基;对应于X198的残基是酸性的或极性的残基;对应于X211的残基是碱性的、脂肪族的、非极性的、酸性的或极性的残基; 对应于X216的残基是受限的或碱性的残基;其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。20.根据权利要求4所述的多肽,其中酮还原酶氨基酸序列另外具有所有的下述特征 对应于X7的残基是组氨酸;对应于X17的残基是甲硫氨酸;对应于X27的残基是芳香族的残基;对应于X64的残基是酪氨酸;对应于X80的残基是苏氨酸;对应于X93的残基是丝氨酸;对应于X94的残基是半胱氨酸;对应于X96的残基是缬氨酸、亮氨酸或异亮氨酸;对应于XlOO的残基是赖氨酸;对应于X147的残基是亮氨酸;对应于X194的残基是谷氨酰胺;对应于X196的残基是亮氨酸;对应于X198的残基是谷氨酸;对应于X211的残基是缬氨酸;对应于X216的残基是精氨酸;其中任选地,所述氨基酸序列与所述参考序列相比在其他氨基酸残基位置具有一个或 多个残基差异。21.根据权利要求8所述的多肽,其中所述酮还原酶氨基酸序列具有下述特征对应于 X7的残基是组氨酸;对应于X96的残基是苏氨酸;对应于X147的残基是亮氨酸;而且对应 于X196的残基是亮氨酸。22.根据权利要求21所述的多肽,其中所述酮还原酶氨基酸序列另外具有下述特征 对应于X93的残基是丝氨酸;对应于X94的残基是半胱氨酸;对应于X96的残基是亮氨酸; 而且对应于X211的残基是缬氨酸。23.根据权利要求22所述的多肽,其中所述酮还原酶氨基酸序列另外具有下述特征 对应于X17的残基是甲硫氨酸;对应于X27的残基是酪氨酸;对应于X64的残基是缬氨酸; 对应于X80的残基是苏氨酸;而且对应于XlOO的残基是赖氨酸。24.根据权利要求22所述的多肽,其中所述酮还原酶氨基酸序列另外具有下述特征 对应于X66的残基是谷氨酸;对应于X96的残基是异亮氨酸;对应于X194的残基是谷氨酰 胺;对应于X198的残基是谷氨酸;而且对应于X216的残基是精氨酸。25.根据权利要求22所述的多肽,其中所述酮还原酶氨基酸序列另外具有下述特征 对应于X66的残基...
【专利技术属性】
技术研发人员:杰克梁,波蒂博勒普,韦丝娜米切尔,艾米丽穆德弗,詹姆士拉隆德,吉伽特哈思曼,
申请(专利权)人:科德克希思公司,
类型:发明
国别省市:US[美国]
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