快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR引物及其检测方法和应用技术

本发明专利技术涉及一种快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR引物及其检测方法和应用，所述引物的序列为：上游引物N6‑F1：5’‑TATAAACATTCCAAACATGA‑3’，下游引物N6‑R1：5’‑TTCACATAGCGGCTTGGTCA‑3’，利用该引物建立实时荧光定量PCR方法，根据实时荧光定量PCR反应结束后的溶解曲线存在Tm值的差异，直接对不缺失型神经氨酸酶N6基因以及缺失型神经氨酸酶N6基因进行鉴别诊断，本发明专利技术鉴定方法简单、方便高效、准确率较高，可应用于对N6基因型进行快速鉴别。

【技术实现步骤摘要】
快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR引物及其检测方法和应用
本专利技术属于动物传染病学领域，具体涉及一种快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR引物及其检测方法和应用。
技术介绍
禽流感(avianinfluenza，AI)是由A型流感病毒引起的主要侵害家禽及野鸟的一种急性、高度接触性传染病，可引起禽类出现大量死亡、产蛋量下降、严重的呼吸道系统综合症或隐性感染等多种病型。目前禽流感遍布世界各地，给各国养禽业造成巨大的经济损失。禽流感病毒(avianinfluenzavirus，AIV)基因组为单股负链分节段的RNA，其基因组分为8个片段，分别为PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS。依照流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)结构及特性的不同，可将A型流感病毒分为若干亚型，迄今共发现18种HA亚型(H1～H18)和11种NA亚型(N1～N11)。H5N6亚型AIV是近年来发现的基因重组型禽流感病毒，有研究表明当前流行的H5N6亚型禽流感病毒的NA基因存在缺失和不缺失两种类型。从NCBI上下载已知的H5N6亚型禽流感病毒的NA基因序列，利用分子生物学软件本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR引物，其特征在于：所述引物的序列如下：上游引物N6‑F1：5’‑TATAAACATTCCAAACATGA‑3’，下游引物N6‑R1：5’‑TTCACATAGCGGCTTGGTCA‑3’。

【技术特征摘要】
1.一种快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR引物，其特征在于：所述引物的序列如下：上游引物N6-F1：5’-TATAAACATTCCAAACATGA-3’，下游引物N6-R1：5’-TTCACATAGCGGCTTGGTCA-3’。2.一种快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR检测方法，其特征在于：利用上游引物N6-F1：5’-TATAAACATTCCAAACATGA-3’和下游引物N6-R1：5’-TTCACATAGCGGCTTGGTCA-3’建立实时荧光定量PCR方法；所述引物对不缺失型神经氨酸酶N6基因以及缺失型神经氨酸酶N6基因的扩增需要跨过基因缺失区，造成因核苷酸碱基连续缺失导致GC含量差异，根据实时荧光定量PCR反应结束后的溶解曲线存在Tm值的差异，直接对不缺失型神经氨酸酶N6基因以及缺失型神经氨酸酶N6基因进行鉴别诊断。3.根据权利要求2所述的快速区分神经氨酸酶N6基因型的实时荧光定量PCR检测方法，其特征在于：它包括以下步骤：(1)核酸的提取：提取病毒样本的RNA；(2)cDNA的制备：将步骤(1)提取的RNA分别反转录为cDNA；(3)实时荧光定量PCR反应：...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈翠腾，朱春华，陈珍，刘斌琼，蔡国漳，
申请(专利权)人：福建省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：福建,35