一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选方法技术

本发明专利技术公开了一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选方法，步骤包括：选用编号为GSE13990，GSE15242，GSE21171和GSE23637的基因芯片，对基因芯片中的探针进行归一化处理，获得候选内参基因，再利用InterproScan软件进行功能预测，选择维持杨树生命基础功能的相关基因为内参基因。该筛选方法能够获得现有技术报道以外的新的内参基因，丰富了杨树内参基因的选择，为筛选出更稳定、更理想的内参基因提供了途径，对杨树抗逆相关基因的表达水平的研究，以及系统地进行杨树的抗逆性研究具有重要意义，对进一步选育抗逆优良植株具有重要的指导作用。

A screening method of reference gene expression and regulation related genes poplar longhorn beetle

The present invention discloses a kind of inverse and poplar longhorn beetle gene expression screening methods, reference gene regulation related steps include: the number of GSE13990, GSE15242, gene chip GSE21171 and GSE23637, to probe in gene chip was normalized to obtain candidate reference genes, then the function prediction was carried out using InterproScan software, select the relevant gene to maintain the basic life function of poplar as a reference gene. This screening method can obtain new reference genes reported in the existing technology outside, enrich the poplar reference gene selection, for screening provides a way to reference gene is more stable and more ideal, the research on the expression of poplar longhorn beetle stress-related gene, has important significance of systematic research and resistance of poplar, with guidance an important role in plant resistance breeding.

【技术实现步骤摘要】
一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选方法
本专利技术涉及的是基因工程的
，尤其涉及的是一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选方法。
技术介绍
杨树(Populustrichocarpa)是重要的绿化能源树种，大力发展杨树产业，对于森林资源的丰富，自然生态环境的改善大有裨益。杨树在我国主要分布于华北、西北等干旱和半干旱地区，干旱不仅会影响叶片的光合速率、枝条生长速率和干物质积累，也会使杨树干重减轻、材积减少，从而制约着杨树的速生丰产。干旱往往与高盐度引起的渗透胁迫有关，影响杨树的生长和产量。杨树作为重要的木本模式作物，在抗旱、抗高盐等抗逆境胁迫等分子遗传改良方面发展显著。随着基因工程技术的不断发展，抗逆基因的研究也越来越受到大家的青睐。因此，研究抗逆相关基因的表达水平不仅可以系统的研究杨树的抗病过程，还可以更好的指导杨树抗逆优良植株的选育。实时荧光定量PCR(Quantitativereal-timePCR)是最常用、最快速、最简单的基因表达水平定量分析的方法。作为强有力的检测基因表达谱的方法，它可以分析基因在不同生长时期和不同组织器官中的表达差异，以及不同环境本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选，其特征在于，包括以下步骤：(1)收集与杨树抗逆基因表达调控相关的基因芯片，选择编号为GSE13990，GSE15242，GSE21171和GSE23637的基因芯片为特异性筛选芯片；(2)对步骤(1)的4个基因芯片中包含的探针进行归一化处理，步骤包括：步骤一：利用Expression Console软件中的MAS5算法计算得到基因芯片中每个探针的P‑Value值，筛选P‑Value值<0.05的探针；步骤二：利用Expression Console软件中的RMA算法计算筛选后的探针在不同胁迫条件下的CV值，将探针按照CV值从小到大的顺序进行...

【技术特征摘要】
1.一种与杨树抗逆基因表达调控相关的内参基因的筛选，其特征在于，包括以下步骤：(1)收集与杨树抗逆基因表达调控相关的基因芯片，选择编号为GSE13990，GSE15242，GSE21171和GSE23637的基因芯片为特异性筛选芯片；(2)对步骤(1)的4个基因芯片中包含的探针进行归一化处理，步骤包括：步骤一：利用ExpressionConsole软件中的MAS5算法计算得到基因芯片中每个探针的P-Value值，筛选P-Value值<0.05的探针；步骤二：利用ExpressionConsole软件中的RMA算法计算筛选后的探针在不同胁...

【专利技术属性】
技术研发人员：项艳，严涵薇，储文渊，程欣然，
申请(专利权)人：安徽农业大学，
类型：发明
国别省市：安徽,34