囊性纤维化患者的CFTR基因缺失突变形式及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种囊性纤维化患者的CFTR基因缺失突变形式及其应用。本发明专利技术保护蛋白质：(a1)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第508位氨基酸残基缺失得到的蛋白质；(a2)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第476至478位氨基酸残基缺失得到的蛋白质。本发明专利技术还保护检测突变甲和/或乙的物质在制备试剂盒中的应用；突变甲：人基因组中序列3第128‑130位核苷酸缺失；突变乙：人基因组中序列3第34‑42位核苷酸缺失；试剂盒的功能：(c1)评价待测者患囊性纤维化的风险性；(c2)评价待测者或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性；(c3)诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。本发明专利技术对于囊性纤维化患者的诊断具有重大应用价值。

Deletion form of CFTR gene in cystic fibrosis patients and its application

The invention discloses a CFTR gene deletion mutant form of cystic fibrosis patient and an application thereof. The present invention will protect the protein: (A1) the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator 508th amino acid deletion proteins obtained; (A2) the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator 476th to 478 amino acid residues of the protein are missing. The present invention also protect material mutations and / or a B application kit for the mutation; a: genomic sequence of 3 people in 128th 130 nucleotide deletion mutation in the genome sequence; B: 3 thirty-fourth 42 nucleotide deletion kit; function: (C1) to measure the risk evaluation of patients with cystic fibrosis (C2); evaluation of measured or tested couples in offspring of cystic fibrosis risk; (C3) diagnosis or auxiliary diagnosis of tested whether patients with cystic fibrosis. The invention is of great value for the diagnosis of cystic fibrosis patients.

【技术实现步骤摘要】
囊性纤维化患者的CFTR基因缺失突变形式及其应用
本专利技术涉及囊性纤维化患者的CFTR基因缺失突变形式及其应用。
技术介绍
囊性纤维化(cysticfibrosis，CF)是一种常染色体隐性遗传病，是由于囊性纤维化跨膜传导调节因子(cysticfibrosistransmembraneconductanceregulator，CFTR)的基因突变导致大量黏液阻塞全身外分泌腺，可累及呼吸、消化、生殖等多系统，临床表现为慢性咳嗽、咯大量黏痰、反复发作的肺部感染、脂肪泻、生长发育迟缓及男性不育等。囊性纤维化首要累及的器官是肺，而肺部病变也是囊性纤维化患者的最主要的致死因素(85％)。囊性纤维化造成气道粘膜分泌物稠化，通过慢性阻塞、感染、炎症，最终导致支气管扩张和肺实质破坏。胰腺也是囊性纤维化的重要受累器官，患者主要表现为胰腺外分泌功能障碍：营养障碍(脂肪、蛋白质吸收障碍、脂肪泻、生长迟滞)，胰腺功能不全所致低体重和肺功能及生存率呈负相关，是预后不良的重要因素。患者亦可有其他消化系统表现，如肝脏肿大、肝硬化、黄疸等。因此当同时出现呼吸系统和消化系统表现时，更应警惕囊性纤维化。囊性纤维化在发达国家高加索人群中的流行病学研究较为完善，是高加索人群中最常见的遗传性疾病之一，发病率约为1/1800至1/25000。亚洲囊性纤维化发病率的数据主要来自回顾性研究或病例研究，并不能十分准确、客观地描述囊性纤维化在亚洲人群准确的发病率，其发病率很可能被低估。1975年-2015年报道的文献中，共记载了36例囊性纤维化患者。近10年，中国大陆报道的囊性纤维化患者为13例。由于病例数较少，我国目前尚无该病发病情况的流行病学统计数据。基因检测作为一种安全、快速、易行的手段在囊性纤维化诊断中也有着重要作用。对于临床表现不典型和/或汗液试验阴性(或临界值)的患者可通过基因检测进行确诊。囊性纤维化在我国的可能并非罕见，患者临床表现不典型，但如提高对疾病的认识，仍可通过临床表现和相关辅助检查发现高度怀疑的病例，进而通过基因检测快速地做出正确的判断。我国CFTR基因与欧美国家报道大为不同且具有很高的异质性，因此关于CFTR基因突变谱及与临床表型关系还需要进一步完善。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供囊性纤维化患者的CFTR基因缺失突变形式及其应用。本专利技术保护一种蛋白质，为如下(a1)或(a2)：(a1)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第508位氨基酸残基“苯丙氨酸”缺失得到的蛋白质；(a2)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第476至478位氨基酸残基“谷氨酸-脯氨酸-丝氨酸”缺失得到的蛋白质。囊性纤维化跨膜传导调节因子具体如序列表的序列1所示。编码所述蛋白质的基因也属于本专利技术的保护范围。所述基因为如下(b1)或(b2)：(b1)编码区为将序列表的序列2所示的DNA分子1520-1522位核苷酸“TCT”缺失得到的DNA分子；(b2)编码区为将序列表的序列2所示的DNA分子1426-1434位核苷酸“GAGCCTTCA”缺失得到的DNA分子。本专利技术还保护用于检测特异突变甲的物质和/或用于检测特异突变乙的物质在制备试剂盒中的应用；所述特异突变甲为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第128-130位核苷酸“TCT”缺失；所述特异突变乙为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第34-42位核苷酸“GAGCCTTCA”缺失；所述试剂盒的功能为如下(c1)、(c2)或(c3)：(c1)评价待测者患囊性纤维化的风险性；(c2)评价待测者或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性；(c3)诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。本专利技术还保护一种试剂盒，包括用于检测所述特异突变甲的物质和/或用于检测所述特异突变乙的物质；所述试剂盒的功能为评价待测者患囊性纤维化的风险性。所述试剂盒还包括记载如下判断标准(d1)和/或(d2)和/或(d3)的载体：(d1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(d2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(d3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高。本专利技术还保护一种试剂盒，包括用于检测所述特异突变甲的物质和/或用于检测所述特异突变乙的物质；所述试剂盒的功能为评价待测者的后代或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性。所述试剂盒还包括记载如下判断标准(e1)和/或(e2)和/或(e3)和/或(e4)的载体：(e1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(e2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(e3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(e4)如果所述待测夫妻中的一位携带所述特异突变甲、另一位携带所述特异突变乙，待测夫妻的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高。本专利技术还保护一种试剂盒，包括用于检测所述特异突变甲的物质和/或用于检测所述特异突变乙的物质；所述试剂盒的功能为诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。所述试剂盒还包括记载如下判断标准(f1)和/或(f2)和/或(f3)的载体：(f1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者为或候选为囊性纤维化患者；(f2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者为或候选为囊性纤维化患者；(f3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者为或候选为囊性纤维化患者。所述正常人为两条染色体均携带序列表的序列1所示的囊性纤维化跨膜传导调节因子的编码基因的人。所述序列表的序列1所示的囊性纤维化跨膜传导调节因子的编码基因具体如序列表的序列2所示。所述序列表的序列1所示的囊性纤维化跨膜传导调节因子的编码基因具体如GENBANKACCESSIONNO.NG_016465.4所示(linearPRI28-AUG-2016)。以上任一所述用于检测所述特异突变甲的物质具体可为特异引物对。特异引物对由两条引物组成，一条引物为序列表的序列5所示的单链DNA分子，另一条引物为序列表的序列6所示的单链DNA分子。以上用于检测所述特异突变乙的物质具体可为特异引物对。特异引物对由两条引物组成，一条引物为序列表的序列5所示的单链DNA分子，另一条引物为序列表的序列6所示的单链DNA分子。本专利技术对于囊性纤维化患者的诊断具有重大应用价值。附图说明图1为胸部CT的照片。图2为患儿、患儿父亲、患儿母亲与缺失突变甲临近区域的测序峰图。图3为患儿、患儿父亲、患儿母亲与缺失突变乙临近区域的测序峰图。具体实施方式以下的实施例便于更好地理解本专利技术，但并不限定本专利技术。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。基因组中，CFTR基因的核苷酸序列见GENBANKACCESSIONNO.NG_016465.4本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种蛋白质，为如下(a1)或(a2)：(a1)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第508位氨基酸残基“苯丙氨酸”缺失得到的蛋白质；(a2)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第476至478位氨基酸残基“谷氨酸‑脯氨酸‑丝氨酸”缺失得到的蛋白质。

【技术特征摘要】
1.一种蛋白质，为如下(a1)或(a2)：(a1)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第508位氨基酸残基“苯丙氨酸”缺失得到的蛋白质；(a2)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第476至478位氨基酸残基“谷氨酸-脯氨酸-丝氨酸”缺失得到的蛋白质。2.编码权利要求1所述蛋白质的基因。3.如权利要求2所述的基因，其特征在于：所述基因为如下(b1)或(b2)：(b1)编码区为将序列表的序列2所示的DNA分子1520-1522位核苷酸“TCT”缺失得到的DNA分子；(b2)编码区为将序列表的序列2所示的DNA分子1426-1434位核苷酸“GAGCCTTCA”缺失得到的DNA分子。4.用于检测特异突变甲的物质和/或用于检测特异突变乙的物质在制备试剂盒中的应用；所述特异突变甲为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第128-130位核苷酸“TCT”缺失；所述特异突变乙为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第34-42位核苷酸“GAGCCTTCA”缺失；所述试剂盒的功能为如下(c1)、(c2)或(c3)：(c1)评价待测者患囊性纤维化的风险性；(c2)评价待测者或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性；(c3)诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。5.一种试剂盒，包括用于检测特异突变甲的物质和/或用于检测特异突变乙的物质；所述特异突变甲为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第128-130位核苷酸“TCT”缺失；所述特异突变乙为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第34-42位核苷酸“GAGCCTTCA”缺失；所述试剂盒的功能为评价待测者患囊性纤维化的风险性。6.如权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒还包括记载如下判断标准(d1)和/或(d2)和/或(d3)的载体：(d1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(d2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(d3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一...

【专利技术属性】
技术研发人员：徐保平，
申请(专利权)人：首都医科大学附属北京儿童医院，
类型：发明
国别省市：北京,11