【技术实现步骤摘要】
器官基因的组蛋白H3K9三甲基化表达差异的分析方法与基因模型【
】本专利技术涉及组蛋白甲基化，尤其涉及一种器官基因的组蛋白H3K9三甲基化表达差异的分析方法与基因模型。【
技术介绍
】在哺乳动物基因组中，组蛋白可以有很多修饰形式，包括组蛋白末端的乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、ADP (二磷酸腺苷)核糖基化等等，这些修饰都会影响基因的转录活性。组蛋白修饰最重要的表观遗传机制是控制基因表达，因此其与细胞的增殖、发育和生存息息相关。对于组蛋白H3 (组蛋白H3的第9位赖氨酸残基)在不同的组织和生物中已广泛研究并证实组蛋白H3K9三甲基化(H3K9me3)与异染色质形成，基因的表达和转录伸长率具有关联性。表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表达和调控的可遗传变化的过程和机制。与遗传多态性不同，会发生非遗传部分和可逆的DNA修饰。甲基化发生在位于氨基末端的组蛋白尾部的五个主要的赖氨酸残基(H3K4, H3K9, H3K27, H3K36, H4K20),以及一个球状蛋白结构域(H3K79)内的赖氨酸残基，这些赖氨酸可发生单甲基化、二甲基化和三甲...
【技术保护点】
器官基因的组蛋白H3K9三甲基化表达差异的分析方法，其特征在于，包括以下步骤：提取冷冻保存的标本的组织样本，研磨匀浆并用质量百分数为1%的甲醛处理，裂解细胞得到全细胞裂解液；在全细胞裂解液加入三甲基化组蛋白H3K9的抗体和磁珠，在4℃进行孵育，提取DNA；构建DNA文库，进行染色质免疫沉淀测序分析，对有效数据进行产量统计，并与目的物种基因组序列进行比对，根据转录因子结合位点和组蛋白修饰富集区域，获取峰值相关基因；对所述峰值相关基因按照基因功能进行聚类分析，并选取组蛋白H3K9三甲基化表达差异显著的至少一基因。
【技术特征摘要】
1.器官基因的组蛋白H3K9三甲基化表达差异的分析方法，其特征在于，包括以下步骤: 提取冷冻保存的标本的组织样本，研磨匀浆并用质量百分数为1%的甲醛处理，裂解细胞得到全细胞裂解液； 在全细胞裂解液加入三甲基化组蛋白H3K9的抗体和磁珠，在4°C进行孵育，提取DNA ；构建DNA文库，进行染色质免疫沉淀测序分析，对有效数据进行产量统计，并与目的物种基因组序列进行比对，根据转录因子结合位点和组蛋白修饰富集区域，获取峰值相关基因； 对所述峰值相关基因按照基因功能进行聚类分析，并选取组蛋白H3K9三甲基化表达差异显著的至少一基因。2.根据权利要求1所述分析方法，其特征在于，所述标本为心脏和/或脾脏。3.根据权利要求2所述分析方法，其特征在于，所述提取DNA后还进行纯化，然后再构建DNA文库。4.根据权利要求3所述分析方法，其特征在于，所述纯化采用快速PCR纯化试剂盒进行，纯化之后还采用实时定量基因扩增荧光检测系统进行...
【专利技术属性】
技术研发人员：眭维国，戴勇，曹翠辉，薛雯，陈洁晶，
申请(专利权)人：眭维国， 戴勇，
类型：发明
国别省市：广东;44
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