OAS1基因中的突变制造技术

本发明专利技术涉及OAS1基因中的突变，具体的提供了非人灵长类动物中OAS1蛋白的经修饰的氨基酸序列，和与其相关的基因。

【技术实现步骤摘要】
0AS1基因中的突变本申请是申请日为2006年05月03日，申请号为200680022089.5 (国际申请号为PCT/US2006/016983)，名称为“0AS1基因中的突变”的专利技术专利申请的分案申请。1.
本专利技术涉及检测人或非人灵长类动物寡腺苷酸合成酶基因中的突变的方法，和具有至少一处氨基酸修饰的0AS1蛋白。2.专利技术背景迄今为止已鉴别出其中人群中存在天然的感染抗性的多种疾病。Alter和Moyer，J.Acquir.1mmune Def ic.Syndr.Hum Retrovirol.18Suppl.1: S6-10 (1998)报导在诸如注射药物使用者的高危群组中的丙型肝炎病毒感染(HCV)率高达90%。然而，尚未有文献确认剩余的10%明显对抗感染的机制。在HCV感染中起作用的蛋白包括2_’、5_’寡腺苷酸合成酶。0AS是干扰素诱导蛋白，其特征为能催化2_’、5_’腺苷寡聚物(2-5A)的合成。Hovanessian等，EMB06:1273-1280 (1987)发现，经干扰素处理的人类细胞含有数种对应于 40 (0AS1)、46 (0AS1)、69 及 100kD 的蛋白的 0AS。Marie 等，Biochem.Biophys.Res.Commun.160:580-587(1989)制备了高度特异性的抗p69 (69_kD 0AS)多克隆抗体。通过以抗-p69抗体筛选经干扰素处理的人类细胞表达文库，Marie和Hovanessian, J.Biol.Chem.267:9933-9939 (1992)分离出了部分0AS2cDNA。他们以该部分cDNA筛选其它文库，并 回收了编码两个0AS2同种型的cDNA。较小的同种型由3_’非翻译区长度不同的两种mRNA编码。RNA印迹分析揭示，0AS2在人类细胞中表达为四种由干扰素诱导的mRNA。预测的0AS2蛋白具有共同的683-氨基酸序列和不同的3_’末端。根据体外转录/翻译产物的SDS — PAGE，两个同种型的分子质量为69和71kD。两个同种型在体外均显示出0AS活性。序列分析表明，0AS2含有两个由富含脯氨酸的推定连接区所分隔的0AS1-同源域。N末端及C末端域分别与0AS1有41%和53%同一性。通过突光原位杂交和通过包含于作图克隆(mapped clones)之内，Hovanian等，Genomics52:267-277 (1998)确定 0AS1、0AS2 和 0AS3 基因与 12q24.2 上的 130-kb 区域簇集在一起。2 — 5A会结合至降解病毒及细胞RNA的RNA酶I，并将它激活，从而导致细胞蛋白合成的抑制和病毒复制的削弱。被称为0ASL的第四种人类0AS基因与0AS1、0AS2和0AS3的不同在于0ASL缺乏酶活性。0ASL基因编码双域蛋白，后者由融合至与泛素的串联重复同源的164个氨基酸C末端域的 0AS 单兀组成。(Eskildsen 等，Nuc.Acids Res.31:3166-3173, 2003; Kakuta 等，J.1nterferon&Cytokine Res.22:981-993,2002.)由于它们在抑制病毒复制和病毒感染中的作用，本领域需要与0AS1活性有关的抑制病毒复制的方法和组合物，包括十分需要抑制HCV复制的基于抑制剂的疗法。
技术实现思路
本专利技术涉及检测与丙型肝炎抗性有关的突变，所述突变可以表征为寡腺苷酸合成酶1基因中的突变。在一个实施方案中，包括遗传筛查方法。该方法包含，测定从人或非人灵长类动物分离的核酸样品中是否存在寡腺苷酸合成酶1基因突变，该突变造成所有寡腺苷酸合成酶1(0AS1)形式(包括但不限于SEQ ID N0:1)在下述一个或多个位置处的氨基酸修饰:1，24，25，28，31，36，47，53，54，64，69，74，104，108，112，113，114，115，116，117，118，119，127，130，139，142，160，161，162，166，175，179，226，242，246，248，250，254，274，279，282，284，288，289，292，295，314，315 和 335。在另一个实施方案中，包括遗传筛查方法。该方法包含，测定从人或非人灵长类动物分离的核酸样品中是否存在寡腺苷酸合成酶1基因突变，该突变造成与Genbank登录号NP_002525.1在羧基末端同源的所有寡腺苷酸合成酶1形式(包括但不限于SEQ ID NO: 3)在位置363处的氨基酸修饰。 在另一个实施方案中，包括遗传筛查方法。该方法包含，测定从人或非人灵长类动物分离的核酸样品中是否存在寡腺苷酸合成酶1基因突变，该突变造成与Genbank登录号NP_058132.1在羧基末端同源的所有寡腺苷酸合成酶1形式(包括但不限于SEQ ID NO:2)在下述一个或多个氨基酸位置处的氨基酸修饰:347，350，352，353，354，356，357，361，363，364，365，369，371，373，374，375，378，379，382，388，389 或 394。在另一个实施方案中，包括遗传筛查方法。该方法包含，测定从人或非人灵长类动物分离的核酸样品中是否存在寡腺苷酸合成酶1基因突变，该突变造成与Genbank登录号NP_001027581.1在羧基末端同源的所有寡腺苷酸合成酶1形式(包括但不限于SEQ IDNO: 4)在下述一个或多个氨基酸位置处的氨基酸修饰:347，361，364，372，384，385或399。在另一个实施方案中，本专利技术提供了一种蛋白，其具有在所有寡腺苷酸合成酶1 (0AS1)形式(包括但不限于 SEQ ID N0:1)的位置 1，24，25，28，31，36，47，53，54，64，69，74，104，108，112，113，114，115，116，117，118，119，127，130，139，142，160，161，162，166，175，179，226，242，246，248，250，254，274，279，282，284，288，289，292，295，314，315 和 335处的至少一处氨基酸修饰，和所述蛋白在制备对病毒感染、优选黄病毒感染、最优选丙型肝炎感染的抗性的诊断剂中的应用。在具体的实施方案中，所述诊断剂是抗体。在另一个实施方案中，本专利技术提供了一种0AS1蛋白，其具有与Genbank登录号NP_002525.1在羧基末端同源的所有寡腺苷酸合成酶1形式(包括但不限于SEQ ID NO: 3)的位置363处的氨基酸修饰，和所述蛋白在制备对病毒感染、优选黄病毒感染、最优选丙型肝炎感染的抗性的诊断剂中的应用。在具体的实施方案中，所述诊断剂是抗体。在另一个实施方案中，本专利技术提供了一种0AS1蛋白，其具有与Genbank登录号NP_058132.1在羧基末端同源的所有寡腺苷酸合成酶1形式(包括但不限于SEQ ID NO: 2)的位置 347，350，352，353，354，356，357，361，363，364，365，369，371，373，374，375，378，379，382，388，389和394处的至少本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于鉴别寡腺苷酸合成酶基因(OAS1)突变的人遗传筛查方法，其包含，检测核酸样品中OAS1突变的存在，其中所述突变会导致所编码的OAS1蛋白中的至少一处氨基酸修饰。

【技术特征摘要】
2005.05.04 US 60/677,6801.用于鉴别寡腺苷酸合成酶基因(0AS1)突变的人遗传筛查方法，其包含，检测核酸样品中0AS1突变的存在，其中所述突变会导致所编码的0AS1蛋白中的至少一处氨基酸修饰。2.寡腺苷酸合成酶1蛋白，其包含具有SEQID NO: 1的氨基酸序列的多肽，例外是在位置 1，24，25，28，31，36，47，53，54，64，69，74，104，108，112，113，114，115，116，117，118，119，127，130，139，142，160，161，162，166，175，179，226，242，246，248，250，254，274，279，282，284，288，289，292，295，314，315和335处具有至少一处氨基酸修饰。3.寡腺苷酸合成酶1蛋白，其包含具有与Genbank登录号NP_002525.1在羧基末端同源的0AS1蛋白的氨基酸序列的多肽，所述氨基酸序列具有在位置363处的氨基酸修饰。4.寡腺苷酸合成酶1蛋白，其包含具有与Genbank登录号NP_058132.1在羧基末端同源的0AS1蛋白的氨基酸序列的多肽，例外是在位置347，350，352，353，354，356，357，361，363，364，365，369，371，373，374，375，378，379，382，388，389 和 394 处具有至少一处氨基酸修饰。5.寡腺苷酸合成酶1蛋白，其包含具有与Genbank登录号NP_001027581.1在羧基末端同源的0AS1蛋白的氨基酸序列的多肽，例外是在位置347，361，364，372，384，385和399处具有至少一处氨基酸修饰。6.寡腺苷酸合成酶1蛋白， 其包含具有SEQID NO: 2的氨基酸序列的多肽，例外是在位置 1，24，25，28，31，36，47，53，54，64，69，74，104，108，112，113，114，115，116，117，118，119，127，130，139，142，160，161，162，166，175，179，226，242，246，248，250，254，274，279，282，284，288，289，292，295，314，315，335，347，350，352，353，354，356，357，361，363，364，365，369，371，373，374，375，378，379，382，388，389 和 394 处具有至少一处氨基酸修饰。7.寡腺苷酸合成酶1蛋白，其包含具有SEQID NO: 3的氨基酸序列的多肽，例外是在位置 1，24，25，28，31，36，47，53，54，64，69，74，104，108，112，113，114，115，116，117，118，119，127，130，139，142，160，161，162，166，175，179，226，242，246，248，250，254，274，279，282，284，288，289，292，295，314，315，335和363处具有至少一处氨基酸修饰。8.寡腺苷酸合成酶1蛋白，其包含具有SEQID NO:4的氨基酸序列的多肽，例外是在位置 1，24，25，28，31，36，47，53，54，64，69，74，104，108，112，113，114，115，116，117，118，119，127，130，139，142，160，161，162，166，175，179，226，242，246，248，250，254，274，279，282，284，288，289，292，295，314，315，335，347，361，364，372，384，385 和 399 处具有至少一处氨基酸修饰。9.寡腺苷酸合成酶1蛋白，其包含具有SEQID NO:5-16中任一的氨基酸序列的多肽...

【专利技术属性】
技术研发人员：SP伊多纳托，CL马格内斯，CA谢勒，PC费林，T哈根，A奥尔森，
申请(专利权)人：基尼塔图有限责任公司，
类型：发明
国别省市：