BIM基因缺失突变检测探针和液相芯片制造技术

技术编号:9662436 阅读:335 留言:0更新日期:2014-02-13 15:53
本发明专利技术公开了一种BIM基因缺失突变检测液相芯片和检测探针,该BIM基因缺失突变检测液相芯片包括有:分别包被有针对BIM基因缺失突变的野生型和突变型检测探针的微球,所述野生型检测探针为SEQ?ID?NO.1或SEQ?ID?NO.2,所述突变型检测探针为SEQ?ID?NO.3或SEQ?ID?NO.4;带有生物素标记的扩增引物。所制备的BIM基因突变检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比,并且所设计的检测探针与扩增引物、扩增产物之间基本上不存在交叉反应,在同一个反应体系中实现野生型和突变型序列的并行检测。

【技术实现步骤摘要】
BIM基因缺失突变检测探针和液相芯片
本专利技术属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种BIM基因缺失突变检测探针和液相芯片。
技术介绍
BM基因存在于人2号染色体上,是一种B细胞白血病/淋巴瘤2 (BCL2基因)蛋白家族促凋亡成员。BM基因表达一个包含BH3 (BCL2-homology domain3)结构域的蛋白, 通过和Bcl2家族Bcl2-ll,BCL-XL, BCL2A1, MCLl等一些促生长的蛋白相结合抑制肿瘤细胞生长,或者和促进凋亡的蛋白BAX、BAK1相结合促进肿瘤细胞凋亡。BH3结构域是BIM基因发挥作用的关键功能域,研究发现该功能域与TKIs发挥作用密切相关。例如在TKIs药物吉非替尼治疗的非小细胞肺癌(NSCLC)中需要BM基因的正常表达,并且BH3-类似药物能够明显增强其治疗效果。人类很多激酶表达异常导致的人类肿瘤细胞都会通过抑制BIM 基因的表达或者通过MAPKl磷酸化修饰BM蛋白来保持自身的生长优势。在几乎所有人类肿瘤中BM基因的激活表达对于TKIs类药物发挥作用是必须的,而抑制BM基因的表达则会导致TKIs耐药。表明BM基因在TKIs药物发挥作用过程中发挥重要作用。目前,BM基因突变检测方法主要有=Illumina光纤微珠芯片技术、 Affymetrix6.0芯片技术。虽然Illumina光纤微珠芯片技术是高灵敏度和精确性的高通量检测系统,但是自动化程度低,手工操作比较多,难以满足实际应用的需要,高通量的 Affymetrix SNP6.0芯片技术比较成熟,然而该芯片技术对于中低密度的临床诊断型芯片并不合适,很难在同一个反应体系中扩展检测众多生物学性状相关的SNP或标签SNP。另外,Affymetrix SNP6.0芯片主要在表达谱芯片上比较强,物种较多,在SNP芯片上相对较弱,而且检测价格昂贵,并不能满足实际需要。本专利技术目标检测的BM基因突变突变,该序列(SEQ IDN0.16:发生缺少突变后的序列)从第169位碱基开始,有2903位碱基发生了缺失突变,框中序列即为缺失区域,本领域技术人员使用常规技术手段,根据缺失区域前后的碱基组成,在基因库中便能容易获得该缺失区域的碱基组成,因此,本专利技术目标检测的BIM基因缺失突变的内容是充分公开的。SEQ ID N0.16BM基因缺失突变GTTGGTAGAGTTATCAATT`AGGAAACCCAGTACAGAGTCTATTATAATTTAGATTGTACCTCATGATG AAGGCTAACTCAACAAACCCATCAGAACAGACACTGGAACAAAATGACATTTCTAAATACCATCCAGCTCTGTCTT CATAGGCTTCAGTGAGGTAAATCA \GGCA(K}C(%TT(KXTAT(mWimAAlTGGAAAGAACXTCAGAGJXKmKiTCACTTGTCAGAGGTTGGGCACUcctgtgaggtggtgggga gaaatgacagaca tccca gcagctacaca tgctggctgca cgt|lryrr?-G(T^J/jZ'Gr(^G6^G67^/l/l?T--:4(?GT;?r(T7YY7T^(;Ga4/l.4(;......GGCTArfGll\GAGTAGTGCTGCTA TGAACA TGGGTA TGCAAA TA TCniTGGGGGA riCmCTTTGAA rnTTl\ \l\i(}ATA TATAi TflKMdGTGGMTTGCTGGATCATATGGTMrfCTArnTfAA TrnTT(iGGaA\本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种BIM基因缺失突变检测液相芯片,其特征在于,包括有A、分别包被有针对BIM基因缺失突变的野生型和突变型检测探针的微球,所述野生型检测探针为SEQ?ID?NO.1或SEQ?ID?NO.2,所述突变型检测探针为SEQ?ID?NO.3或SEQ?ID?NO.4;B、用于扩增出需要检测的、带有生物素标记的、含有BIM缺失突变基因型的目标序列的引物。

【技术特征摘要】
1.一种BIM基因缺失突变检测液相芯片,其特征在于,包括有A、分别包被有针对BIM基因缺失突变的野生型和突变型检测探针的微球,所述野生型检测探针为SEQ ID N0.1或SEQ ID N0.2,所述突变型检测探针为SEQ ID N0.3或SEQ ID N0.4 ;B、用于扩增出需要检测的、带有生物素标记的、含有BIM缺失突变基因型的目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的BM基因缺失突变检测液相芯片,其特征在于,所述扩增引物的碱基序列为:SEQ ID N0.5—SEQ ID N0.7。3.根据权利要求2所述的BM基因缺失突变检测液相芯片,其特征在于,所述扩...

【专利技术属性】
技术研发人员:许嘉森刘志明
申请(专利权)人:益善生物技术股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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