肺癌的生物标志物制造技术

本发明专利技术（部分）涉及用一种或多种生物标志物确定个体内早期肺癌预后的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】【专利摘要】本专利技术（部分）涉及用一种或多种生物标志物确定个体内早期肺癌预后的方法。【专利说明】肺癌的生物标志物
本专利技术涉及预后方法和个性化疗法。专利技术背景肺癌是世界上最常见的癌症诊断，2007年有150万例新病例(Salomon等，CritRev Oncol Hematol.，19:183-232，1995，SEER-数据库05.2010)。高发病率和死亡率使得其成为癌症相关死亡的主要原因，每年有超过975，000例死亡且5年存活率为15% (Salomon等人，同上)。肺癌可分类为小细胞肺癌或非小细胞肺癌(NSCLC)。NSCLC占到约80%的病例。NSCLC能进一步细分成数个组织学类型，最常见的是腺癌(40%)和鳞状细胞癌(25%)。当前的NSCLC治疗主要基于肿瘤形态学和以肿瘤淋巴结转移(--Μ)为基础的分期系统，所述系统将肿瘤分类成对应于肿瘤进展程度的分级类别(IA、IB、IIA、IIB、IIIA、IIIB和IV期)。存在许多分期系统(例如临床相对病理分期，以及多个版本的分期指南，如由国际肺癌研究会(IASLC)发布的那些)(Goldstraw 等,J.Thorac.0ncol.2, 706-714, 2007)。例如，根据临床分期和IASLC第6版--!分期建议，各期的频率为23%1期、19%11期、37%111期和21%IV期(Goldstraw等人，同上)。相对比例可能根据所述指南以及使用临床或是病理分期而显著改变。手术是早期NSCLC (I期和II期)的标准治疗，然后是辅助治疗如放射治疗、化疗(用于II期及以后)以及用于晚期NSCLC的贝伐单抗和表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶抑制剂(TKI) (Kutikova 等，Lung Cancer ;50 (2): 143-154，2005)。美国和欧洲的 NSCLC治疗临床指南支持这些治疗选择(Mendelssohn等，2000 ；NCCN-指南NSCLC VI，2010)。根据目前用于早期肺癌的基于--Μ的分期系统，I期NSCLC患者在手术后5年内复发的概率为35% (SEER-数据库，2008)。目前的治疗指南不建议对这些患者辅以化疗。而基于--Μ的II期患者中有30%在没有任何辅助化疗情况下不经历复发(SEER-数据库)，这意味着根据当前治疗指南(即，ESMO (D，Addario等，Annals of Oncology.2009 ；20 (增刊4):1v68-1v70，2009)、NCCN V1-2010)这些患者经历过度治疗。与此类似的是有报道指出60%的早期NSCLC患者在手术后无复发(Arriagada等，NEJM，350:351-360，2004)。根据当前临床数据，早期NSCLC的辅助化疗提供证据显示辅助化疗的平均效益为4% (NSCLC荟萃分析协作组)，5年内从60%提高到64%。根据现有缺陷，对NSCLC患者进行预后和/或预测基因组标签的需求是具有医学合理性的。专利技术概述本专利技术(部分)涉及用本文所述一种或多种生物标志物确定个体内早期肺癌预后的方法。这些发现可用于帮助为早期肺癌患者确定合适的治疗，例如鉴定那些会通过接受辅助治疗而受益的患者。一方面，本专利技术包括对患有非小细胞肺癌(NSCLC)的对象进行预后或分类的方法，所述方法包括在手术切除后从患有NSCLC的对象获得测试样品；测定表1、表2和/或表3中所鉴定的至少一种或多种生物标志物，或表1、表2和/或表3所鉴定生物标志物的任何组合在所述测试样品中的表达水平；分析该表达水平以产生风险评分，其中风险评分可用于提供预后或分类对象。另一方面，本专利技术包括对患有非小细胞肺癌(NSCLC)的对象进行预后或分类的方法，所述方法包含:在手术切除后从患有NSCLC的对象获得测试样品；测定表1、表2和表3中的至少一种生物标志物在所述测试样品中的表达水平；分析该表达水平以产生风险评分，其中风险评分可用于提供预后或分类对象。在一个实施方式中，表1、表2和表3中所鉴定的至少一种生物标志物包括CBX7、STX1A和TPX2。在另一个实施方式中，表1、表2和表3中所鉴定的至少一种生物标志物包括CBX7、TMPRSS2、STX1A、KLK6、TPX2和UCK。在另一个实施方式中，表1、表2和表3中所鉴定的至少一种生物标志物包括CBX7、TMPRSS2、GPR116、STX1A、KLK6、SLC16A3、TPX2、UCK2、PHKAl。在另一个实施方式中，表1、表2和表3中所鉴定的至少一种生物标志物包括 CBX7、TMPRSS2、GPRl 16、KCNJl5, STX1A、KLK6、SLC16A3、PYGL,TPX2、UCK2、PHKAl或EIF4A3。在另一个实施方式中，表1、表2和表3所鉴定中的至少一种生物标志物包括 CBX7、TMPRSS2、GPRl 16、KCNJl5, PTPNl3, STX1A、KLK6、SLC16A3、PYGL,LDHA、TPX2、UCK2、PHKA1、EIF4A3*TK1。在另一个实施方式中，表1、表2和表3中所鉴定的至少一种生物标志物包括 CBX7、TMPRSS2、GPRl 16、KCNJl5, PTPN13、CTSH、STX1A、KLK6、SLC16A3、PYGL, LDHA, ITGA5、TPX2、UCK2、PHKAl、EIF4A3、TKl 或 CCNA2。在一个实施方式中，通过将对象对肺癌、距离转移或局部复发所致死亡的时间特异性概率作附图，本专利技术的风险评分可用于预后。在另一个实施方式中，风险评分可用于将对象分入将受益于接受辅助化疗的高风险组或不会受益于接受辅助化疗的低风险组。另一方面，本专利技术包括预测患有非小细胞肺癌(NSCLC)的对象在手术切除后预后的方法，所述方法包含从肿瘤样品确定mRNA的表达谱，所述样品来自新鲜冷冻(FF)或福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)材料。 所述谱包含表1、表2和/或表3所列的一种或多种生物标志物，其中表2和/或表3所列一种或多种生物标志物的表达相较对照的增加以及表1所列一种或多种生物标志物的表达相较对照的减少可用于预测对象是否处于存活差的高风险组或存活良好的低风险组。在本专利技术的方法中，高风险组的对象被选定用于辅助化疗，而低风险组的对象不被选择用于辅助化疗和相应的随后治疗。在另一个实施方式中，本专利技术包括为NSCLC对象选择治疗方案的方法，所述方法包括从已接受切除的患有NSCLC的对象获得测试样品；测定表2所鉴定的至少二种或更多生物标志物在所述测试样品中的表达水平以产生各基因的表达值；分析所述表达值以产生风险评分，其中风险评分可用于分类是否选择该对象接受血管新生抑制剂如阿瓦斯丁。在本专利技术的方法中，本专利技术包括测定表1、表2和/或表3中所鉴定的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种或至少15种生物标志物或其任何组合的表达。例如，各从表1、表2和表3选择至少任意5种生物标志物的表达(此实施方式中的标签会包括至少15种生物标志物)。在一个实施方式中，NSCLC是I期NSCLC、II期NSCLC或其组合。NSCLC能在由鳞状本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于非小细胞肺癌（NSCLC）对象预后的方法，包括：在手术切除后从患有NSCLC的对象获得测试样品；测定表1、表2或表3各自所鉴定的至少三种或更多种生物标志物的表达水平；和分析所述表达水平以产生风险评分，其中该风险评分可用于提供对象的预后。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：E·米希亚格里亚，P·维拉帕蒂，S·罗西，W·克罗尔，
申请(专利权)人：诺华股份有限公司，
类型：
国别省市：