【技术实现步骤摘要】
【技术保护点】
一种基于串联质谱鉴定蛋白质翻译后修饰位点的方法,其步骤是:磷酸肽的数据库检索:步骤1、利用开源免费软件ProteoWizard将质谱采集的原始数据转化为可视化的mgf格式的数据;步骤2、利用MASCOT数据库以及pFind数据库进行检索,筛选FDR?值小于1%的磷酸化修饰肽段;蛋白质磷酸化修饰位点重新定位及评估:????步骤1、数据的预处理:使用perl语言程序编写的数据处理程序,处理质谱mgf格式数据;步骤2、蛋白质磷酸化修饰位点重新定位及评估:使用perl语言程序编写的蛋白质磷酸化修饰位点重新定位与评估程序,处理MASCOT以及pFind数据库检索结果文件,通过解析MASCOT以及pFind数据库检索结果文件,获取所有磷酸化肽段信息,包括磷酸化肽段谱图名称,磷酸化肽段序列及分子量,磷酸化修饰位点数,磷酸化肽段价态,根据文献中报道的评估磷酸化修饰位点方法,利用上一步过滤的数据以及磷酸化肽段信息,重新计算匹配的b或y系列离子,采用以下公式对修饰位点进行新的打分计算:p_value?=?(k!/(n!(n?k)!)?*?pk?*?(1?p)(n?k)?=?(k!/(n!(n?k)!)?* ...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:张珈,杨明坤,葛峰,熊倩,郑鹏,李重阳,
申请(专利权)人:中国科学院水生生物研究所,
类型:发明
国别省市:
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