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污染成分琥珀腈降解微生物根瘤菌USDA 110及其同属物种密码子库制造技术

技术编号:8235801 阅读:343 留言:0更新日期:2013-01-20 11:05
本发明专利技术涉及一种污染成分琥珀腈降解微生物根瘤菌USDA110及其同属物种密码子库,是基于windows7系统下的能够方便用户查询获取数据的功能全面的数据库,该数据库涉及十一个表格,涵盖了五个物种每个基因的密码子信息、最优密码子资料及各密码子信息的内在关联。本发明专利技术方便不同根瘤菌密码子使用的差异比较、降解环境污染物的根瘤菌与不能降解根瘤菌密码子使用的差异的比较,进而作为参考,查找新的降解污染物种类或品系。本发明专利技术适用于环境治理、生物进化研究、工业生产、品系鉴定等多个领域,具有广阔的应用前景。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及污染成分琥珀腈降解微生物根瘤菌USDA 110及其同属物种密码子库
技术介绍
同义密码子的分布是不均匀的,称为密码子的偏好性。密码子的简并性使得大部分的氨基酸能够被不只一种密码子编码。突变偏好性、DNA修复和DNA的复制的不对称性、选择能够导致密码子偏好性的形成。调控倾向于使同义密码子的使用适用于最大量的转运RNA种类,进而提闻翻译的效率和精确性。在闻表达基因中,例如核糖体蛋白,选择能提闻偏好密码子的频度。理解控制根瘤菌USDA 110的降解琥珀腈蛋白(例如腈水合酶)的翻译效 率是一个重要的挑战。根瘤菌USDA 110全长基因组的可用性使得我们能够从密码子角度找寻一些线索。但前提是所有的根瘤菌USDA 110密码子资料可用。同时掌握其他根瘤菌密码子资料能够为根瘤菌的进化和发现新的降解琥珀腈物种或品系提供参考和科学的基础保障。
技术实现思路
本专利技术的目的在于填补上述的空白,设计开发了一个污染成分琥珀腈降解微生物根瘤菌USDA 110及其同属物种密码子库。本专利技术提供一种能够简单实用、用户群广泛的污染成分琥珀腈降解微生物根瘤菌USDA 110及其同属物种密码子库,能够本文档来自技高网...

【技术保护点】
污染成分琥珀腈降解微生物根瘤菌USDA?110及其同属物种密码子库,其特征在于,由五个密码子基本资料查询表单、偏好密码子查询表单和一个密码子关联表单构成,包括了所有全长基因组可用的根瘤菌的密码子数据,每个查询表单链接到一个表格,每个表格设计严密,密码子数据全面,几乎可以查到每个基因的密码子信息,用户可以通过选择一个物种,进而选择一个基因,获取到该基因的密码子信息,密码子关联表单主要是方便用户查询密码子不同信息之间的pearson关联。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:万俊松陈明
申请(专利权)人:万俊松
类型:发明
国别省市:

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