【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术尤其涉及检测、诊断和/或鉴定病原体例如传染病病原体和确定其对已知或潜在治疗的敏感性的方法。
技术介绍
分子诊断学的发展在除传染病之外的大多数医学学科中彻底改革了护理，在传染病中它们未能起到普遍的变革作用。对慢速培养法的依赖在抗生素抗性的当前危机中尤其无效，因为快速诊断刺激病原体及其抗药谱的分子工具的开发将改变细菌感染、真菌感染、病毒感染和寄生虫感染的管理，在试图降低死亡率、控制卫生保健费用和改进对病原体中逐步上升的抗药性的公共卫生控制方面，导向快速、知情的药物治疗。仅在美国医院，每年有170万人获得医院细菌感染且死亡99，000人，这些感染的70%因细菌对至少一种药物的抗性所致，估计每年花费450亿美元(Klevens等，2002. Public HealthR印· 2007 ；122(2)160-6 ;Klevens 等，Clin Infect Dis. 2008 ；47(7) :927-30 ;Scott, The Direct MedicalCosts of Healthcare-Associated Infection in U. S. Hos...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2010.02.24 US 61/307,669;2010.04.12 US 61/323,2521.一种确定病原体的药物敏感性的方法，所述方法包括提供包含病原体的样品；使所述样品与一种或多种试验化合物接触以提供试样；在将信使核糖核酸(mRNA)自病原体释放进入试样的条件下处理所述试样；将所述试样暴露给包含多个探针子集的多种核酸探针，其中各子集包含与靶mRNA特异性结合的一种或多种探针，与抗药性生物相比，所述靶mRNA在对试验化合物敏感的生物中差异表达，其中所述暴露在使探针和靶mRNA之间的结合可发生的时间内和条件下进行；确定探针与祀mRNA之间的结合水平,从而确定祀mRNA水平；和将存在试验化合物时的靶mRNA水平与参考水平进行比较，其中所述靶mRNA水平相对于靶mRNA参考水平的差异表明所述病原体对试验化合物是敏感的还是抗性的。2.权利要求1的方法，其中所述试验化合物为针对病原体的已知或潜在治疗。3.权利要求1的方法，其中所述方法包括使样品与两种或更多种试验化合物接触。4.权利要求1的方法，其中使所述样品与一种或多种试验化合物接触达少于4小时。5.—种鉴定传染病病原体的方法，所述方法包括提供来自疑似被病原体感染的受试者的试样；在释放信使核糖核酸(mRNA)的条件下处理所述试样；将试样暴露给包含多个探针子集的多种核酸探针，其中各子集包含与靶mRNA特异性结合的一种或多种探针，所述靶mRNA唯一地鉴定病原体，其中所述暴露在使探针和靶mRNA之间的结合可发生的时间内和条件下进行；和确定探针与祀mRNA之间的结合水平,从而确定祀mRNA水平；其中试样相对于参考样品在祀mRNA方面的增加,表明试样中病原体的身份。6.权利要求1或5的方法，其中所述试样选自痰、血、尿、粪便、关节液、脑脊液和子宫颈/阴道拭子。7.权利要求1或5的方法,其中所述试样包含多种不同的传染病病原体或非致病生物。8.权利要求1或5的方法,其中所述一种或多种核酸探针选自表2。9.权利要求1或5的方法，其中所述病原体为细菌、真菌、病毒或寄生虫。10.权利要求1或5的方法，其中所述病原体为结核分枝杆菌。11.权利要求1或5的方法，其中所述mRNA在与探针接触之前为粗制的。12.权利要求1或5的方法，其中所述方法不包括扩增mRNA。13.权利要求1或5的方法，其中所述方法包括以酶法、化学法或机械法裂解细胞。14.权利要求1或5的方法，其中所述方法包括微流体装置的使用。15.权利要求1或5的方法，其中将所述方法用于监测病原体感染。16.权利要求1的方法，其中所述病原体在来自受试者的样品中。17.权利要求5或16的方法，其中所述受试者为人。18.权利要求5或16的方法，其中所述方法进一步包括确定或选择用于受试者的治疗，以及任选给予受试者所述治疗。19.一种选择用于受试者的治疗的方法，所述方法包括任选用以下方法鉴定来自受试者的样品中的病原体，所述方法包括提供来自疑似被病原体感染的受试者的试样；在释放信使核糖核酸(mRNA)的条件下处理所述试样；将试样暴露给包含多个探针子集的多种核酸探针，其中各子集包含与靶mRNA特异性结合的一种或多种探针，所述靶...
【专利技术属性】
技术研发人员：D洪，J戈麦斯，L科西米，R尼科尔，M博罗夫斯基，A巴查克，AB安德东克，
申请(专利权)人：布罗德研究所有限公司，综合医院公司，布里格姆妇女医院，
类型：
国别省市：
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