【技术实现步骤摘要】
本专利技术提供一种利用实时荧光定量PCR检测基孔肯亚病毒核酸的方法。
技术介绍
基孔肯雅病毒(Chikungunya virus)是单股正链RNA病毒，属于披膜病毒科 (Togaviridae)甲病毒属(Alphavirus)，引起基孔肯雅热(Chikungunyafever，CHIK)。该 病为一种急性传染病，通过伊蚊传播给人，在临床上以发热、关节疼痛、皮疹和轻度出血为 特征。1953年首次从坦桑尼亚的1例发热患者的血液中分离出基孔肯雅病毒。20世纪 60-90年代，在非洲中部和南部的许多国家该病均有流行，并分离到CHIK病毒，如苏丹、乌 干达、刚果民主共和国、中非共和国、马拉维、津巴布韦、肯尼亚和南非；西非的塞内加尔、贝 宁、几内亚共和国、科特迪瓦和尼日利亚等；在东南亚，1999年印度尼西亚首次暴发CHIK， 2001-2003年此地再次出现该病流行；在印度洋岛屿，近几年，印度洋岛屿出现大规模的 CHIK暴发流行。2005年，科摩罗岛发生大暴发流行并迅速传播到整个印度洋的其他岛屿； 在欧洲，2007年7月，意大利拉文纳省的2个村庄发生CHIK ；2004-2007年，亚洲和非洲等 地区的CHIK暴发流行不断发生，其中2006年全球共发生CHIK患者大约200万例。值得注 意的是我国的台湾地区在1967年和2006年曾发生过CHIK流行，2008年我国大陆首次发现 的CHIK输入性病例。但截至目前我国尚无CHIK本土流行的确切报道。纵观历史，CHIK已 经成为全球区日益严重的公共卫生问题。目前，针对外来传染病的实验室快速检测技术主要采用的是免疫学检测...
【技术保护点】
实时荧光定量ＰＣＲ检测基孔肯亚病毒核酸的方法，其特征在于，该方法利用实时荧光定量ＰＣＲ检测技术，通过设计一对引物和探针对病毒样本进行实时定量检测，所设计引物和探针序列如下： ＰｒｉｍｅｒＦ（５’－３’）： ＧＧＧＧＣＴＧＡＡＣＣＡＧＡＧＡＡＴＡＧＴＧ ＰｒｉｍｅｒＲ（５’－３’）： ＴＴＧＧＲＧＣＧＡＣＣＡＧＡＴＣＣＧＣＧＧＧＡＡＫ Ｐｒｏｂｅ（５’－３’）： ＣＧＧＣＡＧＡＡＣＧＣＡＡＣＧＧＡＡＹＡＹＧＡＡＣＡＣＡＴＧＣＣ。
【技术特征摘要】
实时荧光定量PCR检测基孔肯亚病毒核酸的方法，其特征在于，该方法利用实时荧光定量PCR检测技术，通过设计一对引物和探针对病毒样本进行实时定量检测，所设计引物和探针序列如下2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，该方法包括引物和探针的获得，对基孔肯 亚病毒核酸的检测；其中，引物和探针的获得步骤为(1)收集筛选基孔肯亚病毒全基因组 序列，利用生物信息学软件进行同源性比对，并在其保守区设计引物，(2)根据PCR扩增区 域内的核苷酸序列设计特异性探针，并登录 GENEBANK检测探针的特异性；对基孔肯亚病毒 核酸的检测步骤为首先提取病毒的核酸，然后利用所设计的引物和探针对待检...
【专利技术属性】
技术研发人员：姚李四，燕清丽，张晓龙，
申请(专利权)人：中国检验检疫科学研究院，
类型：发明
国别省市：11[中国|北京]
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