帕金森氏病的检测方法技术

本发明专利技术提供一种用于检测帕金森氏病的标记基因和使用该标记基因的帕金森氏病的检测方法。一种被检验者的帕金森氏病的检测方法，包括：对于从被检验者采集的生物试样，测定选自SNORA16A、SNORA24、SNORA50和REXO1L2P这四种基因群中的至少一种基因或其表达产物的表达水平的工序。达水平的工序。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】帕金森氏病的检测方法


[0001]本专利技术涉及一种使用帕金森氏病标记物检测帕金森氏病的方法。

技术介绍

[0002]从病理学上来看，帕金森氏病是一种以Lewy小体的形成和中脑黑质的多巴胺神经细胞的变性和细胞死亡为主的进行性神经退行性疾病，其中，Lewy小体的形成以α
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突触核蛋白聚集体为主，临床上来看，则是一种以肌肉强直、震颤、少动、行走障碍等运动障碍为主的疾病。
[0003]在神经退行性疾病中，帕金森氏病的数量仅次于阿尔兹海默症，患病率达10万人中120～130人，推测日本约有14万患者。
[0004]目前，没有能够根治帕金森氏病的疗法，通过L
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DOPA补充等对症疗法控制症状对保持QOL被认为是重要的。
[0005]但是，出现运动障碍的自觉症状时，已经处于中晚期，所以需要早期诊断疾病并实现早期介入。
[0006]作为用于检测帕金森氏病的生物标记物，除检测α
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突触核蛋白积累之外，还提出了检测源自循环血清的微RNA(专利文献1)；测定血液中酪氨酸与苯基丙氨酸的浓度比率(专利文献2)等。另外，据报道称，在帕金森氏病患者的皮肤中，与大脑一样可见形成α
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突触核蛋白聚集体(非专利文献1)；帕金森氏病患者会出现脂溢性皮炎、黑色素瘤、水疱性天疱疮、酒糟鼻等皮肤疾病或症状(非专利文献2)，考虑帕金森氏病与皮肤的状态存在某种关系，但科学关联性尚不明确。
[0007]另一方面，正在开发了通过分析生物试样中的DNA和RNA等核酸来考察人体内当前和将来的生理状态的技术。利用核酸的分析具有如下优点：已建立了全面的分析方法，一次分析即能得到丰富的信息；及容易基于与单碱基多态性和RNA功能等相关的诸多研究报告实现分析结果的功能关联。源自生物的核酸可以从血液等体液、分泌物、组织等中提取，最近有些报道中使用皮肤表层脂质(skin surface lipids；SSL)中所含的RNA作为用于分析生物的样本；从SSL能够检测到表皮、汗腺、毛囊和皮脂腺的标记基因(专利文献3)。
[0008]专利文献1：日本特表2019
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506183号公报
[0009]专利文献2：日本特开2016
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75644号公报
[0010]专利文献3：国际公开公报第2018/008319号
[0011]非专利文献1：Rodriguez
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Leyva I et al.Ann Clin Transl Neurol.2014(modified)
[0012]非专利文献2：Ravn AH et al.Clin Cosmet Investig Dermatol.2017

技术实现思路

[0013]本专利技术涉及下面的1)～3)。
[0014]1)一种被检验者的帕金森氏病的检测方法，包括：对于从被检验者采集的生物试
样，测定选自SNORA16A、SNORA24、SNORA50和REXO1L2P这四种基因群中的至少一种基因或其表达产物的表达水平的工序。
[0015]2)一种1)的方法中使用的用于检测帕金森氏病的检查用试剂盒，其中，
[0016]含有与所述基因特异性杂交的寡核苷酸或识别所述基因的表达产物的抗体。
[0017]3)一种帕金森氏病的检测标记物，其由选自表3
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1～3
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4和表6
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1～6
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2所示的基因群的至少一种基因或其表达产物构成。
附图说明
[0018]图1是由测试数据中的最佳预测模型中的预测值和实测值制成的混淆矩阵。
具体实施方式
[0019]本专利技术涉及一种用于检测帕金森氏病的标记物和使用该标记物检测帕金森氏病的方法。
[0020]本专利技术人等从帕金森氏病患者和健康者的皮肤上采集SSL，将SSL中所含的RNA的表达状态作为序列信息进行全面分析，结果发现，在两者之间，特定的基因的表达水平存在显著差异，可以以此为指标来检测帕金森氏病。
[0021]根据本专利技术，可以简单无创地在早期以高精度、灵敏度和特异度检测帕金森氏病。
[0022]本文中引用的全部专利文献、非专利文献和其它刊物整体作为参考引用在本文中。
[0023]在本说明书中，术语“核酸”或“多核苷酸”表示DNA或RNA。DNA中包括cDNA、基因组DNA和合成DNA的全部，“RNA”中包括total RNA、mRNA、rRNA、tRNA、non
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coding RNA和合成RNA的全部。
[0024]在本说明书中，“基因”除表示包含人基因组DNA的双链DNA之外，还表示包含cDNA的单链DNA(正链)、具有与该正链互补的序列的单链DNA(互补链)和包含这些片段的物质，并且，在构成DNA的碱基的序列信息中包含一些生物学信息。
[0025]另外，该“基因”不仅包含特定的碱基序列所表示的“基因”，还包含它们的同源物(即，同系物或者直系同源物)、基因多型等变异体和编码衍生物的核酸。
[0026]本说明书中所公开的基因名称基于NCBI([www.ncbi.nlm.nih.gov/])所记载的官方代号(Official Symbol)。另一方面，关于基因本体(gene ontology、GO)，基于String([string
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db.org/])所记载的Pathway ID.。
[0027]在本说明书中，基因的“表达产物”是包含基因的转录产物和翻译产物的概念。“转录产物”为从基因(DNA)转录生成的RNA，“翻译产物”是指基于RNA翻译合成的被基因编码的蛋白质。
[0028]在本说明书中，“帕金森氏病”表示以黑质致密部多巴胺神经细胞的变性为主要主病变，缓慢进行性地表现出三种运动症状(静息性震颤、强直、运动缓慢和运动不能)的特发性且进行性的疾病。
[0029]在本说明书中，帕金森氏病的“检测”是指明确帕金森氏病存在或不存在，也可以有检查、测定、判定、评价或辅助评价这样的术语替换。其中，在本说明书中，“判定”或“评价”这样的术语不包括医生进行的这些行为。
[0030]本专利技术的由SNORA16A、SNORA24、SNORA50和REXO1L2P构成的四种基因是后述实施例所示的选自下述表A中记载的33种基因的基因，其是在帕金森氏病患者中，源自SSL的RNA的表达量相比健康者显著上升(UP)或下降(DOWN)的基因，并且是至今都没有被知晓为与帕金森氏病有关联的基因(表中由粗体表示)。
[0031][表A][0032][0033][0034]将从两个试验(试验1：健康者/帕金森氏病患者各15名，试验2：健康者/帕金森氏病患者各50名)的被检验者的SSL中所提取的RNA的表达量的数据(读取计数值)转换为经样品间的总读取数(总Read数)的差异校正后的RPM值，将该RPM值转换成以2为底的对数值，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种被检验者的帕金森氏病的检测方法，其包括：对于从被检验者采集的生物试样，测定选自SNORA16A、SNORA24、SNORA50和REXO1L2P这四种基因群中的至少一种基因或其表达产物的表达水平的工序。2.如权利要求1所述的帕金森氏病的检测方法，其中：至少包括测定SNORA24基因或其表达产物的表达水平。3.如权利要求1或2所述的方法，其中：基因或其表达产物的表达水平的测定为mRNA的表达量的测定。4.如权利要求1～3中任一项所述的方法，其中：基因或其表达产物为所述被检验者的皮肤表层脂质中所含的RNA。5.如权利要求1～4中任一项所述的方法，其中：将表达水平的测定值与所述各基因或其表达产物的参照值比较，评价存在或不存在帕金森氏病。6.如权利要求1～4中任一项所述的方法，其中：将来自帕金森氏病患者的所述基因或其表达产物的表达水平和源自健康者的所述基因或其表达产物的表达水平的测定值作为训练样品，制作能够区分帕金森氏病患者和健康者的判别式，将由从被检验者采集的生物试样得到的所述基因或其表达产物的表达水平的测定值代入该判别公式，将得到的结果与参照值比较，以评价被检验者存在或不存在帕金森氏病。7.如权利要求6所述的方法，其中：测定所述四种基因群中的所有基因或其表达产物的表达水平。8.如权利要求6或7所述的方法，其中：除了测定选自所述四种基因群中的至少一种基因之外，还测定选自下述29种基因群中的至少一种基因或其表达产物的表达水平：ANKRD12、C10orf116、CCL3、CCNI、CD83、CNFN、CNN2、CSF2RB、CXCR4、EGR2、EMP1、ITGAX、KCNQ1OT1、LCE3D、LITAF、NDUFA4L2、NDUFS...

【专利技术属性】
技术研发人员：上原裕也，井上高良，服部信孝，齐木臣二，上野真一，竹重遥香，
申请(专利权)人：学校法人顺天堂，
类型：发明
国别省市：