一种检测少量样品全基因组DNA甲基化的方法技术

本发明专利技术提供了一种检测少量样品全基因组DNA甲基化的方法。具体地，本发明专利技术的方法包括步骤：(a)提供DNA片段；(b)在所述DNA片段两端添加接头；(c)向所述末端带有接头的DNA中加入辅助核酸片段，形成第一混合物；(d)将所述第一混合物进行热变性，使双链DNA成为单链DNA，形成第二混合物；(e)用特异性抗体对所述第二混合物中甲基化的核酸片段进行捕获；(f)用特异性引物对被捕获的核酸片段进行扩增，从而获得含有甲基化的核酸片段的扩增产物。本发明专利技术的方法适用于极少量来源样品的甲基化核酸测序分析，而且成本较低，具有很高的普遍适用性。

【技术实现步骤摘要】
一种检测少量样品全基因组DNA甲基化的方法
本专利技术属于生物
，具体涉及一种通过MeDIP-seq(MethylatedDNAimmunoprecipitationsequencing)检测少量细胞全基因组DNA甲基化的方法。
技术介绍
目前通过MeDIP-seq方法检测细胞全基因组DNA甲基化所需的最低DNA量为50ng，若以细胞为出发样品，则至少需要约75000个细胞。然而，目前的方法仍难以令人满意，其所需的最低样品起始量为50ngDNA或75000个细胞，仍不适用于极少量来源样品的MeDIP-seq分析，而且需要利用试剂盒和全自动样品处理系统进行MeDIP实验，成本较高，不具有普遍适用性。因此，本领域迫切需要开发一种能够检测微量细胞全基因组DNA甲基化的方法。
技术实现思路
本专利技术的目的就是提供一种检测少量细胞全基因组DNA甲基化的方法。在本专利技术的第一方面，提供了一种检测全基因组DNA甲基化的方法，包括步骤：(a)提供DNA片段，所述DNA片段包括源自细胞基因组DNA；(b)在所述DNA片段两端添加接头，得到末端带有接头的DNA；(c)向所述末端带有接头的DNA片段本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测全基因组DNA甲基化的方法，其特征在于，包括步骤：(a)提供DNA片段，所述DNA片段包括源自细胞基因组DNA；(b)在所述DNA片段两端添加接头，得到末端带有接头的DNA；(c)向所述末端带有接头的DNA片段中加入辅助核酸片段，形成第一混合物；(d)将所述第一混合物进行热变性，使第一混合物中的双链DNA成为单链DNA，从而形成第二混合物；(e)用特异性抗体对所述第二混合物中甲基化的DNA片段进行捕获；(f)用特异性引物对被捕获的DNA片段进行扩增，从而获得对应于甲基化的DNA片段的扩增产物；(g)对所述扩增产物进行检测，从而获得全基因组DNA甲基化的检测结果。

【技术特征摘要】
1.一种检测全基因组DNA甲基化的方法，其特征在于，包括步骤：(a)提供DNA片段，所述DNA片段包括源自细胞基因组DNA；(b)在所述DNA片段两端添加接头，得到末端带有接头的DNA；(c)向所述末端带有接头的DNA片段中加入辅助核酸片段，形成第一混合物；(d)将所述第一混合物进行热变性，使第一混合物中的双链DNA成为单链DNA，从而形成第二混合物；(e)用特异性抗体对所述第二混合物中甲基化的DNA片段进行捕获；(f)用特异性引物对被捕获的DNA片段进行扩增，从而获得对应于甲基化的DNA片段的扩增产物；(g)对所述扩增产物进行检测，从而获得全基因组DNA甲基化的检测结果。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，在步骤(g)中，包括：对所述扩增产物进行建库，然后进行检测。3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(a)中所述DNA片段来自20-10000个细胞，较佳地，50-2000个细胞。4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵小东，康亚妮，邵志峰，胡丛霞，
申请(专利权)人：上海交通大学，
类型：发明
国别省市：上海,31