一种19个CODIS基因座探针提取纯化试剂盒制造技术

本发明专利技术公开了一种从低拷贝模板生物检材中提取纯化极微量目的基因座的探针组合，包括该基因座探针组合的试剂盒和便于存储、使用、携带的外包装盒。所述探针组合包括针对19个CODIS STR基因座的特异性捕获探针，所述针对19个CODIS STR基因座的特异性捕获探针的序列分别如SEQ ID NO.1至ID NO.14所示。本发明专利技术利用微型离心管上包被CODIS包含的多个基因座探针序列，利用DNA的碱基互补配对原理，进行特异性的抓捕目的片段，从而对各种检材上极微量的DNA进行快速、高效、准确的提取和纯化。

【技术实现步骤摘要】
一种19个CODIS基因座探针提取纯化试剂盒
本专利技术涉及生物检测领域，更具体地，涉及一种人源DNA样本CODIS探针组合和包括该DNA探针组合的试剂盒，尤其涉及微量DNA提取纯化的试剂盒。
技术介绍
STR(shorttandemrepeat，短片段重复序列)广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中，具有高度多态性，它们是由2-6个碱基构成一个核心序列，核心序列串联重复排列，由核心序列重复数目的变化产生长度多态性。对于一个特定的个体，染色体上某个特定基因座位的重复序列的重复次数是固定的，而对于不同的个体在同一基因座位的重复次数可能不同，这就构成了人群中不同个体间在同一基因座存在一定的差异。由于人类基因组中这种重复序列非常多，通过对多个基因座多态性的联合检测，就可以明确区分个体与个体的不同，以及确定父母子的亲缘关系，所以STR基因座的分型在公安、司法、科研部门被广泛应用。为了建立全国范围内STR分型的查询系统数据库，使罪犯DNA资料能够异地查询，便于搜寻犯罪嫌疑人及串、并案的目的，1990年美国联邦调查局(FBI)开始实施联合DNA检索系统(combinedDNAindexsystem，CODIS)计划，并挑选了13个常染色体STR基因座作为核心基因座，2011年CODIS核心基因座工作组在剔除原有的TPOX基因座的基础上，又新增了6个常染色体STR基因座，形成了19个新的CODIS核心基因座。联合应用的STR基因座越多，得到准确结果的概率就越高，所以一些案件分析中，工作者会检测包括CODIS基因座在内的多个基因座。对于大多数STR分型试剂盒，1ng是最理想的模板量，然而在法医学实践中经常遇到不够理想的检材，微量甚至超微量即低拷贝模板DNA(lowcopytemplate，LCN)检材，乃至高度腐败降解的生物物证检材。目前国内外已有多种针对STR分型的试剂盒，但在DNA模板含量低于125pg时，绝大多数试剂盒PCR扩增后DNA的STR分型RFUs峰值较低或者无法正常出峰，数据无法采用，这给案件分析带来了许多不便。
技术实现思路
本专利技术的目的在于克服现有技术的不足，适应现实发展，提供一种从低拷贝模板生物检材中提取纯化极微量目的基因座的探针组合、包括该基因座探针组合的试剂盒和便于存储、使用、携带的外包装盒。本专利技术所述的一种从低拷贝模板生物检材中提取纯化极微量目的基因座的探针组合，包括针对19个CODISSTR基因座的特异性捕获探针，其中，所述19个CODISSTR基因座分别为：D3S1358、FGA、D5S818、CSF1PO、D8S1179、D7S820、TH01、vWA、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D2S1338、D19S433、D1S1656、D12S391、D2S441、D10S1248和DYS391；所述针对19个CODISSTR基因座的特异性捕获探针的序列分别如SEQIDNO.1至IDNO.14所示；针对所述D3S1358、D8S1179、D21S11基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.1所示；SEQIDNO.1：5’-(TCTA)m-(TCTG)n-3’；针对所述FGA基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.2所示；SEQIDNO.2：5-(TTTC)4TTTTTTCT(CTTT)m(CTGT)n(CTTT)0(CTTC)3-4(CTTT)3CTCC(TTCC)4-3’；针对所述D5S818、CSF1PO基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.3所示；SEQIDNO.3：5’-(AGAT)m-3’；针对所述D7S820、D16S539基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.4所示；SEQIDNO.4：5’-(GATA)m-3’；针对所述TH01基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.5所示；SEQIDNO.5：5’-(AATG)m-3’；针对所述vWA基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.6所示；SEQIDNO.6：5’-(ACTA)m-3’；针对所述D13S317、D2S441基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.7所示；SEQIDNO.7：5’-(TATC)m-3’；针对所述D18S51基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.8所示；SEQIDNO.8：5’-(AGAA)m-3’；针对所述D2S1338基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.9所示；SEQIDNO.9：5’-(TGCC)m(TTCC)n-3’；针对所述D19S433基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.10所示；SEQIDNO.10：5’-(AAGG)AAAG(AAGG)TAGG(AAGG)m-3’；针对所述D1S1656基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.11所示；SEQIDNO.11：5’-(TAGA)m(TGA)0-1(TAGA)n(TAGG)0-1(TG)5-3’；针对所述D12S391基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.12所示；SEQIDNO.12：5’-(TAGA)m(AGAC)n(AGAT)0-1-3’；针对所述D10S1248基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.13所示；SEQIDNO.13：5’-(GGAA)m-3’；针对所述DYS391基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.14所示；SEQIDNO.14：5’-(TCTG)3(TCTA)m-3’；m和n均为可变数目，每组基因座的特异性捕获探针的序列总长度控制在300bp。本专利技术还公开了一种微量人源DNA样本的提取、纯化试剂盒，包括上述的一种从低拷贝模板生物检材中提取纯化极微量目的基因座的探针组合。进一步，所述特异性捕获探针的序列SEQIDNO.1至IDNO.14等比例混合，优选特异性捕获探针的点样浓度为100uM。进一步，包括包被有基因座特异性捕获探针的微型离心管，还包括杂交增强剂和杂交清洗液。本专利技术还公开了上述微量人源DNA样本的提取、纯化试剂盒的应用方法：将待检测的微量或降解的人源DNA样本、针对所述19个CODISSTR基因座的捕获探针组合，特异性抓捕目的片段作为模板，再结合市售STR分型试剂盒进行检验，能够大大提高检出率。进一步，能够应用于法医个体识别，亲子鉴定，尸源认定过程中遇到的各种检材样本，包括对高浓度血迹，精液样本，微量、高度降解、高抑制剂含量的样本DNA的提取、纯化，以及对白骨化尸骨、接触性脱落细胞或者土壤中的血液样本DNA的提取、纯化。本专利技术同时还提供了一种微量人源DNA样本的提取、纯化试剂盒的外包装盒，包括盒体和底板，所述盒体包括内壳和外壳，所述内壳和外壳均为圆柱体，所述底板与所述盒体内壁底部相结合，所述内壳包括内层和外层，所述内壳内层填充有乳胶海绵或泡沫，所述乳胶海绵或泡沫上开设有放置杂交增强剂试管的插孔和放置杂交清洗液试剂瓶的凹槽，所述插孔和所述凹槽的开口位于所述内壳的上端面上，便于杂交增强剂试管和杂交清洗液试剂瓶的取装，所述底板上设有与所述内壳外层底部相对应的轨道，所述内壳外层能够在所述轨道上旋转，真空包装有探针管的真空包装袋连接缠绕于所述内壳的外层，所述外壳侧壁开设有与所述真空包装本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种从低拷贝模板生物检材中提取纯化极微量目的基因座的探针组合，其特征在于：包括针对19个CODISSTR基因座的特异性捕获探针，其中，所述19个CODISSTR基因座分别为：D3S1358、FGA、D5S818、CSF1PO、D8S1179、D7S820、TH01、vWA、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D2S1338、D19S433、D1S1656、D12S391、D2S441、D10S1248和DYS391；所述针对19个CODISSTR基因座的特异性捕获探针的序列分别如SEQ ID NO.1至ID NO.14所示。

【技术特征摘要】
1.一种从低拷贝模板生物检材中提取纯化极微量目的基因座的探针组合，其特征在于：包括针对19个CODISSTR基因座的特异性捕获探针，其中，所述19个CODISSTR基因座分别为：D3S1358、FGA、D5S818、CSF1PO、D8S1179、D7S820、TH01、vWA、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D2S1338、D19S433、D1S1656、D12S391、D2S441、D10S1248和DYS391；所述针对19个CODISSTR基因座的特异性捕获探针的序列分别如SEQIDNO.1至IDNO.14所示。2.根据权利要求1所述的一种从低拷贝模板生物检材中提取纯化极微量目的基因座的探针组合，其特征在于：针对所述D3S1358、D8S1179、D21S11基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.1所示；SEQIDNO.1：5’-(TCTA)m-(TCTG)n-3’；针对所述FGA基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.2所示；SEQIDNO.2：5-(TTTC)4TTTTTTCT(CTTT)m(CTGT)n(CTTT)0(CTTC)3-4(CTTT)3CTCC(TTCC)4-3’；针对所述D5S818、CSF1PO基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.3所示；SEQIDNO.3：5’-(AGAT)m-3’；针对所述D7S820、D16S539基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.4所示；SEQIDNO.4：5’-(GATA)m-3’；针对所述TH01基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.5所示；SEQIDNO.5：5’-(AATG)m-3’；针对所述vWA基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.6所示；SEQIDNO.6：5’-(ACTA)m-3’；针对所述D13S317、D2S441基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.7所示；SEQIDNO.7：5’-(TATC)m-3’；针对所述D18S51基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.8所示；SEQIDNO.8：5’-(AGAA)m-3’；针对所述D2S1338基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.9所示；SEQIDNO.9：5’-(TGCC)m(TTCC)n-3’；针对所述D19S433基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.10所示；SEQIDNO.10：5’-(AAGG)AAAG(AAGG)TAGG(AAGG)m-3’；针对所述D1S1656基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.11所示；SEQIDNO.11：5’-(TAGA)m(TGA)0-1(TAGA)n(TAGG)0-1(TG)5-3’；针对所述D12S391基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.12所示；SEQIDNO.12：5’-(TAGA)m(AGAC)n(AGAT)0-1-3’；针对所述D10S1248基因座的特异性捕获探针的序列如SEQIDNO.13所示；SEQIDNO.13：5’-(GGAA...

【专利技术属性】
技术研发人员：李倩倩，张惠丹，赵洪玉，吴渊虬，
申请(专利权)人：苏州博睿义达生物科技有限公司，苏州绘真生物科技有限公司，苏州工业园区龙兆生物科技研究院有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏,32