检测与抗病毒感染性有关的基因OASI中的突变的方法技术

技术编号:1754577 阅读:189 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
一种用于鉴别寡腺苷酸合成酶基因(OAS1)突变的人类基因筛检方法,其包含检测核酸样本中OAS1点突变的存在,所述OAS1点突变是选自由下列各突变组成的群组:参考序列SEQ  ID  NO:19的2135728、2135749、2135978、2144072、2144088、2144116、2144321、2131025、2133961、2139587、2144294、2144985、2156523和2156638核苷酸位置处的非参考核苷酸取代参考核苷酸;和参考序列SEQ  ID  NO:19的2156595位置处的参考核苷酸的缺失;由此鉴别所述突变。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及一种用于检测人类寡腺苷酸合成酶基因中的突变的方法及所编码的蛋白质及其抗体的用途,其中突变赋予对黄病毒感染(包括C型肝炎感染)的抗性,且突变与包括前列腺癌和糖尿病的其他病状有关。
技术介绍
迄今为止已鉴别许多疾病,其中人类群体中存在天然的感染抗性。Alter和Moyer,J.Acquir.Immune Defic.Syndr.Hum Retrovirol.18增刊1S6-10(1998)报导在诸如注射药物使用者的高危群组中的C型肝炎病毒感染(HCV)高达90%。然而,尚未有文献确认剩余的10%明显对抗感染的机制为何。在HCV感染中起作用的蛋白质包括2-端、5-端寡腺苷酸合成酶。OAS是干扰素诱导的蛋白质,其特征为能催化2-端、5-端腺苷寡聚物(2-5A)的合成。Hovanessian等人,EMBO 61273-1280(1987)发现经干扰素治疗的人类细胞含有数种与40(OAS1)、46(OAS1)、69及100kD的蛋白质对应的OAS。Marie等人,Biochem.Biophys.Res.Commun.160580-587(1989)产生高度特异性的抗p69(69-kD OAS)多克隆抗体。通过以抗p69抗体筛检经干扰素治疗的人类细胞表达文库,Marie和Hovanessian,J.Biol.Chem.2679933-9939(1992)分离出部分OAS2 cDNA。他们以部分cDNA筛检另外的文库并回收编码两个OAS2同功异型物(isoform)的cDNA。较小的同功异型物由两个3-端未转译区长度不同的mRNA编码。Northern印迹分析揭示OAS2表达为人类细胞中四个由干扰素诱导的mRNA。所预测的OAS2蛋白质具有共同的683-氨基酸序列及不同的3-端末端。根据活体外转录/转译产物的SDS-PAGE,两个同功异型物的分子质量为69和71kD。两个同功异型物在活体外均显示出OAS活性。序列分析表明OAS2含有两个由富含脯氨酸的假定连接子区所分隔的OAS1同源域。N末端及C末端域分别为41%和53%相同于OAS1。通过荧光原位杂交和通过包含于定位克隆之内,Hovanian等人,Genomics 52267-277(1998)确定OAS1、OAS2和OAS3基因是由12q24.2上的130-kb区丛集。2-5A结合至降解病毒及细胞RNA的核糖核酸酶I并激活其,从而导致细胞蛋白质合成的抑制和病毒复制的削弱。被称为OASL的第四种人类OAS基因与OAS1、OAS2和OAS3的不同在于OASL缺乏酶活性。OASL基因编码双域蛋白质,其是由融合至与泛素的串联重复同源的164-氨基酸C末端域的OAS单元组成。(Eskildsen等人,Nuc.Acids Res.313166-3173,2003;Kakuta等人,J.Interferon & Cytokine Res.22981-993,2002)由于其在抑制病毒复制和病毒感染中的作用,因此此项技术中需要抑制与OAS1活性有关的病毒复制的方法和组合物,包括进一步需要抑制HCV复制的基于抑制剂的疗法。
技术实现思路
本专利技术涉及检测与C型肝炎抗性有关的突变,所述突变的特征在于其为寡腺苷酸合成酶1基因中的点突变。在一实施例中,涵盖一种人类基因筛检方法。所述方法包含对分离自人类的核酸样本分析寡腺苷酸合成酶1基因点突变的存在,所述点突变的特征为在根据Genbank序列登记号第NT_009775.13号(连续核苷酸2,130,000-2,157,999,其以SEQ ID NO19显示于图2中)的寡腺苷酸合成酶1基因(OAS1)的2135728、2135749、2135978、2144072、2144088、2144116、2144321、2131025、2133961、2139587、2144294、2144985、2156523或2156638核苷酸位置处的碱基取代或在2156595核苷酸位置处的碱基缺失。在一优选实施例中,所述方法包含于扩增条件下以聚合酶链式反应(PCR)引物对处理来自人类的基因组DNA样本,以扩增含有寡腺苷酸合成酶1基因NT_009775.13的2135728、2135749、2135978、2144072、2144088、2144116、2144321、2131025、2133961、2139587、2144294、2144985、2156523、2156595或2156638核苷酸位置的人类基因组DNA区。PCR处理产生含有所述区的扩增产物,然后分析其点突变的存在。在另一实施例中,本专利技术提供一种由在NT_009775.13的2135728、2135749、2135978、2144072、2144088、2144116、2144321、2131025、2133961、2139587、2144294、2144985、2156523、2156595或2156638位置处具有至少一个突变的基因所编码的蛋白质,和所述蛋白质用以制备抗病毒感染、优选为黄病毒感染、最优选为C型肝炎感染用的诊断剂的用途。在特定实施例中,所述诊断剂为抗体。在另一实施例中,本专利技术提供一种用于预防或抑制病毒感染、优选为黄病毒感染、最优选为C型肝炎病毒感染的治疗化合物,其中所述治疗化合物为由在NT_009775.13的2135728、2135749、2135978、2144072、2144088、2144116、2144321、2131025、2133961、2139587、2144294、2144985、2156523、2156595或2156638位置处具有至少一个突变的OAS1基因所编码的蛋白质。在其他实施例中,所述治疗化合物为编码蛋白质的聚核苷酸,诸如DNA或RNA。在另一实施例中,本专利技术提供一种用于预防或抑制病毒感染、优选为黄病毒感染、最优选为C型肝炎病毒感染的治疗化合物,其中所述治疗化合物为具有以下序列的蛋白质SEQ ID NO20、SEQ ID NO21、SEQ ID NO22、SEQ ID NO23、SEQ ID NO24、SEQ ID NO25、SEQ ID NO26、SEQ ID NO27、SEQ ID NO28、SEQ ID NO29、SEQID NO32、SEQ ID NO33、SEQ ID NO34、SEQ ID NO35、SEQ ID NO46、SEQ ID NO47和/或SEQ ID NO48。在另一实施例中,本专利技术提供一种用于预防或抑制病毒感染、优选为黄病毒感染、最优选为C型肝炎病毒感染的治疗化合物,其中所述治疗化合物模拟在NT_009775.13的2135728、2135749、2135978、2144072、2144088、2144116、2144321、2131025、2133961、2139587、2144294、2144985、2156523、2156595或2156638位置处的至少一个突变的有利作用。所述治疗化合物可为小分子、蛋白质、肽、DNA或RNA分子或抗体。在另一实施例中,本专利技术提供一种用于预防或治疗癌症、优选为前列腺癌的治疗化合物,其中所述治疗化合物为由在NT_009775.13的213572本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

【专利技术属性】
技术研发人员:肖恩·P·艾度纳托查尔斯·L·麦格尼斯盖瑞·罗森堡克莉斯汀娜·A·席尔蒂埃里·吉尔洛德约克斯
申请(专利权)人:伊洛默格生物科学公司
类型:发明
国别省市:

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