使用二代测序预测器官移植排斥的方法技术

本发明专利技术涉及通过测定器官移植受体的生物样品中的器官供体特异性核酸序列和受体特异性核酸序列之间的比率来非侵入性预测器官移植排斥的方法并且，更具体地，涉及通过测试器官移植受体的生物学样品(例如，血液)来测定关于表1至10中选择的三种或更多种标志物的源于供体的标志物序列和源于受体的标志物序列之间的比率而预测器官移植排斥和基于所述测定预测器官移植排斥的方法。根据本发明专利技术使用二代测序(NGS)预测器官移植排斥的方法或数字碱基扩增预测技术甚至可应用于极少量的样品，快速且廉价、数据分析速度快，可以应用于世界上所有种族的所有器官移植，并且可同时检测序列分析误差的概率，并且因此，可用于非侵入性预测器官移植排斥。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用二代测序预测器官移植排斥的方法
本申请涉及一种通过测定获自器官移植受体的生物样品中的供体特异性核酸序列和受体特异性核酸序列之间的比率非侵入性预测器官移植排斥的方法，更具体地，涉及一种基于通过分析获自器官移植受体的生物样品(例如血液)测定源于供体的标志物序列和源于受体的标志序列之间的比率的结果预测器官移植排斥的方法。
技术介绍
准确及时诊断器官移植受体中的器官移植排斥对于器官移植受体的存活来说是必需的。然而，目前所使用的诊断器官移植排斥的方法具有许多缺陷。例如，用于诊断心脏移植排斥的黄金标准是使用心脏活检手术在各时间点检查组织，然而，此方法显示许多问题，包括高成本，组织活检医生之间的差异性，以及严重的患者不适(F.Saraiva等，Transplant.Proc.卷43，第1908-1912页，2011)。为了克服这些缺陷，已经使用非侵入性方法，诸如，当发生器官移植排斥时测定基因表达信号的方法，测定免疫蛋白水平的方法，等等。然而，由于不同免疫反应的复杂交叉反应而倾向于产生高假阳性结果，并且基于组织特异性基因表达信号，这些方法也有局限性。在九十年代末，在器官移植受体的尿液和血液中检测本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增来预测生物样品中器官移植排斥的方法，所述生物样品获自从供体接受器官的受体，所述方法包括如下步骤：从自供体接受器官的受体非侵入性获得生物样品，所述生物样品含有源于供体和源于受体的无细胞核酸分子；扩增自所述生物样品分离的无细胞核酸分子中的三种或更多种标志物序列，所述标志物序列选自表1至10所示的标志物序列；通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增分析所扩增的序列；基于所述序列的分析，测定各所述源于供体的标志物序列和各所述源于受体的标志物序列之间的比率；以及将所述比率与一个或多个截断值进行比较。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.04.14 KR 10-2015-00526491.一种通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增来预测生物样品中器官移植排斥的方法，所述生物样品获自从供体接受器官的受体，所述方法包括如下步骤：从自供体接受器官的受体非侵入性获得生物样品，所述生物样品含有源于供体和源于受体的无细胞核酸分子；扩增自所述生物样品分离的无细胞核酸分子中的三种或更多种标志物序列，所述标志物序列选自表1至10所示的标志物序列；通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增分析所扩增的序列；基于所述序列的分析，测定各所述源于供体的标志物序列和各所述源于受体的标志物序列之间的比率；以及将所述比率与一个或多个截断值进行比较。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述生物样品是血液、血浆、血清、尿液或唾液。3.根据权利要求1所述的方法，其中所述扩增所述标志物序列的步骤进一步包括扩增表1至10中所列的所有标志物。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述标志物序列之间的比率是各所述源于供体的标志物序列的量和各所述源于受体的标志物序列的量之间的比率，所述标志物选自表1至10中所示的标志物。5.根据权利要求1所述的方法，其中将所述标志物序列之间的比率连同序列误差率一起计算。6.根据权利要求1所述的方法，其中所扩增的所述生物样品中的标志物序列的长度小于200bp。7.根据权利要求1所述的方法，其中所述截断值是从正常生物样品确立的参考值。8.一种通过二代测序(NGS)或数字碱基扩增来预测获自从供体接受器官的受体的生物样品中器官移植排斥的方法，所述方法包括如下步骤：从自供体接受器官的受体非侵入性获得生物样品，所述生物样品含有源于供体和源于受体的无细胞核酸分子；扩增自所述生物样品分离的无细胞核酸分子中的三种或更多种标志物序列，所述标志物序列选自表1至10所示的标志物序列；通过二代测...

【专利技术属性】
技术研发人员：李旻燮，裵真植，
申请(专利权)人：伊万基因诊断中心有限公司，
类型：发明
国别省市：韩国,KR