一种利用测序技术检测未知病毒的方法技术

技术编号:8384251 阅读:484 留言:0更新日期:2013-03-07 02:02
本发明专利技术涉及一种利用测序技术检测未知病毒的方法。揭示了一种利用二代高通量测序技术检测未知病毒的新方法。本发明专利技术的方法通过结合微量病毒核酸的扩增技术和二代高通量测序技术,有效地解决了现有技术存在的问题,为临床诊断、传染病监控、公共卫生环境监测、环境保护等方面的应用建立有效、快速、准确、的手段和技术平台。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物
;更具体地,本专利技术涉及。
技术介绍
第二代高通量测序技术是对传统测序技术一次革命性的变革,一次对几十万到几百万条DNA/RNA分子进行序列测定。应用第二代高通量测序技术,可以对混合的核酸分子进行序列测定,同时分辨和测出每个独立的序列,而这是第一代测序技术做不到的。目前存在的依赖于第一代测序技术的病毒核酸序列测定技术,具有操作复杂,灵敏度低,不适合在临床诊断、传染病监控、公共卫生环境监测、环境保护等方面的应用。 二代高通量测序技术经过近几年突破性的发展,目前有几个成熟的平台投放市场。以454公司于2005年底推出的创新性的基于焦磷酸测序法和emulsion PCR的高通量基因组测序系统Genome Sequencer 20 System为起始,2007年454公司又推出了性能更优的二代基因组测序系统Genome Sequencer FLX System。目前,实现市场商业化的二代高通量测序技术平台,除了 454的GS系统外,还包括SOLiD (ABI公司),Solexa (Illumina公司),Helicos、Polonater,和Ion Torren本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种鉴定未知病毒的方法,其特征在于,所述方法包括:(1)获取未知病毒的核酸;(2)以步骤(1)的核酸为模板,以第一引物为引物,获得第一链cDNA产物;其中,所述的第一引物序列如下:5’?与测序引物1部分互补或部分相同的碱基?随机引物碱基?3’;(3)以步骤(2)的第一链cDNA产物为模板,以第一引物和第二引物为引物,获得第二链cDNA产物;其中,所述的第二引物序列如下:5’?可识别标记物?与测序引物2部分互补或部分相同的碱基?随机引物碱基?3’;(4)从步骤(3)获得的第二链cDNA产物中分离携带有可识别标记物的cDNA产物;(5)从步骤(4)获得的cDNA产物为模板,以测序引物1和测序引物2...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李轩王蔚郝沛蓝柯
申请(专利权)人:中国科学院上海生命科学研究院中国科学院上海巴斯德研究所
类型:发明
国别省市:

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