The invention belongs to the medicine chemical technology field, relates to drug screening methods, method of establishing particular virtual screening model and in vitro test model on cathepsin D into small molecular targeted inhibitors of the invention comprises the steps of: (1) acquisition, analysis and processing of the three-dimensional structure of cathepsin D protein; (2) construction and processing molecular database; (3) the establishment of virtual screening system; (4) using the step (3) computer virtual screening system of step (2) in small ligand library screening; (5) ADME T forecast. The screening method of cathepsin D inhibitors of this invention eventually screened 6 compounds with signs of cathepsin D inhibitory activity, which is rapid, efficient and economic advantages, improve efficiency, provide the basis for small molecule inhibitors of cathepsin D. The compounds with cathepsin D inhibitory activity obtained by this method can be further used for the development of new anticancer drugs.
【技术实现步骤摘要】
一种以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法
本专利技术属医药化学
,涉及药物筛选方法,具体涉及利用虚拟筛选技术结合体外生物活性评价进行药物筛选的方法,尤其涉及以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的虚拟筛选模型及体外测试模型的建立方法,应用该方法获得的具有组织蛋白酶D抑制活性的化合物,可进一步用于开发新型抗癌药物。
技术介绍
资料显示,恶性肿瘤已成为威胁人类的重大疾病。肿瘤化疗仍是目前治疗恶性肿瘤的主要手段;由于化学药物其毒副作用大,选择性差,易产生耐药等缺点,其临床应用开始受到了限制。因此,开发选择性好、活性高的抗肿瘤药物成为当前药物研发领域的重要任务。现有技术公开了组织蛋白酶D(cathepsinD)是天冬氨酸蛋白酶家族的主要成员,其几乎存在于所有的哺乳动物组织和细胞内。cathepsinD是一种溶酶体肽链内切酶,在正常情况下,以低浓度存在于细胞内,其作用是参与蛋白质和多肽的降解。研究显示,在恶性肿瘤细胞中,CathepsinD过表达并过度分泌至胞外,参与肿瘤细胞入侵、增殖扩散、转移和凋亡等过程,此外,它还参与阿尔兹海默症和动脉粥样硬化等疾病的病理过程。研究公开了CathepsinD由粗面体内质网合成,经过高尔基体、内涵体的蛋白质水解修饰成cathepsinD前体,到达溶酶体后,再经历几次蛋白水解加工成成熟的cathepsinD。有研究报道,许多恶性肿瘤细胞过度表达并分泌的cathepsinD前体可从正常通路中逃逸出来,分泌至细胞外,参与恶性肿瘤的浸润和转移,cathepsinD的转移潜能和催化活性相关;一小部分的分泌cathepsinD前体由 ...
【技术保护点】
一种以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法,其特征在于,其包括步骤:(1)组织蛋白酶D三维结构的获取、分析及处理;(2)建立对接用小分子配体库;(3)计算机虚拟筛选系统的构建;(4)运用步骤(3)的计算机虚拟筛选系统对步骤(2)中的小分子配体库进行筛选;(5)生物活性测试。
【技术特征摘要】
1.一种以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法,其特征在于,其包括步骤:(1)组织蛋白酶D三维结构的获取、分析及处理;(2)建立对接用小分子配体库;(3)计算机虚拟筛选系统的构建;(4)运用步骤(3)的计算机虚拟筛选系统对步骤(2)中的小分子配体库进行筛选;(5)生物活性测试。2.如权利要求1所述的以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法,其特征在于,所述步骤(1)中,在蛋白数据库(http://www.rcsb.org)中搜寻并获得组织蛋白酶D蛋白的三维结构(PDBcode:1LYB),该结构为组织蛋白酶D蛋白与其抑制剂PepstatinA的复合物;使用薛定谔软件包中maestro10.1(2015-01,version10.1,http://www.)的Proteinpreparationwizard模块进行准备,其中,首先对蛋白进行加氢,并删除蛋白中的水分子、α-甘露糖、β-甘露糖、N-乙酰-D-葡萄糖胺,然后在OPLS2005力场条件下对蛋白进行能量优化,最终晶体结构中重原子RMSD小于3.如权利要求1所述的以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法,其特征在于,所述步骤(2)的建立对接用小分子配体库中;小分子结构specs201510mg数据库中获取,并滤...
【专利技术属性】
技术研发人员:张伟,李英霞,高顶顶,包可婷,
申请(专利权)人:复旦大学,
类型:发明
国别省市:上海,31
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。