人类亲权鉴定用多重PCR引物组及检测方法技术

本发明专利技术优化了SNP位点在亲权鉴定检测中的筛选条件，并依据筛选条件构建了由SNP遗传标记位点组成的多重PCR引物组，采用该引物组进行人类亲权鉴定能够克服怀孕早期无创亲子鉴定的不足，准确度高，可应用于司法鉴定以及法医学研究中。

【技术实现步骤摘要】
人类亲权鉴定用多重PCR引物组及检测方法
本专利技术涉及医疗检测领域，通过使用特定的SNP标记组合对人类亲权关系进行检测，具体涉及表一中部分或全部核苷酸序列以及检测方法。
技术介绍
亲权鉴定是指通过对人类遗传标记的检测，根据遗传规律分析，对个体之间血缘关系的鉴定。目前用于亲权鉴定的方法是DNA分析，由于最早时的第一代遗传标记--限制性片段长度多态性(RFLP)具有自身的局限性，检测过程费时费力，且一次仅能检测一个位点，多态性程度较低，因此在亲权鉴定中的应用逐渐减少；此后以第二代遗传标记--短串联重复序列(STR)为主的分型技术成为个体识别与亲权鉴定研究中使用频率最高的分子标记，它具有信息量大、分布广泛、易于检测、多态性程度高且遵循孟德尔共显性遗传等特点。在应用STR进行亲权鉴定时，检测的基因座需要达到15-20个，若出现3个及3个以上违反遗传规律的基因座，则可排除亲权关系。然而，近年来发现STR标记判型错误率较高，重复性差，会直接影响亲权鉴定的准确性和可重复性。单核苷酸多态性(SNP)作为继RFLP和STR后的第三代遗传标记，越来越多地受到人们的关注。目前大量的SNP标记已经被应用于本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种人类亲权鉴定用多重PCR引物组，所涉及的SNP位点及引物满足以下条件：T1：常染色体上SNP位点的MAF值大于0.4；T2：X染色体上SNP位点的MAF值大于0.3；T3：Y染色体上SNP位点的MAF值大于0.1；T4：MAF的频率在北京人种和亚洲人种中同时要满足上述T1,T2,T3频率要求；T5：所选的SNP位点不能位于人类常见CNV区域；T6：所选SNP位点与其相邻3bp组成的区域不能是3个或3个以上相同的碱基重复序列；T7：所选SNP位点与其左右50bp组成的区域不能存在循环(Repeat)序列；T8：所选SNP位点上已知的基因型不能超过两种；T9：所选SNP位点之间的距离要大于4,...

【技术特征摘要】
1.一种人类亲权鉴定用多重PCR引物组，所涉及的SNP位点及引物满足以下条件：T1：常染色体上SNP位点的MAF值大于0.4；T2：X染色体上SNP位点的MAF值大于0.3；T3：Y染色体上SNP位点的MAF值大于0.1；T4：MAF的频率在北京人种和亚洲人种中同时要满足上述T1,T2,T3频率要求；T5：所选的SNP位点不能位于人类常见CNV区域；T6：所选SNP位点与其相邻3bp组成的区域不能是3个或3个以上相同的碱基重复序列；T7：所选SNP位点与其左右50bp组成的区域不能存在循环(Repeat)序列；T8：所选SNP位点上已知的基因型不能超过两种；T9：所选SNP位点之间的距离要大于4,000,000bp；T10：对SNP左右75bp进行发夹结构，二聚体的预测，去除存在发夹结构或二聚体的SNP位点；T11：把SNP左右50bp的序列切割成30bpk-mer，重新比对到基因组，比对质量相加，最大者优先选择；T12：对上述所选SNP位点进行高通量测序，进行重复测序实验，计算每个SNP位点测得的reads数目中位数，计算这些中位数的标准差，去除中位数大于或小于标准差3倍的SNP位点。2.根据权利要求1所述的人类亲权鉴定用多重PCR引物组，其特征在于，所述多重PCR引物组中所涉及的SNP位点不少于150个，优选地不少于179个，更优选地不少于400个。3.一组由SNP遗传标记位点组成的多重PCR引物组，包括表一所示的714对引物组的部分或全部；其中，所述多重PCR引物组优选地由表一中的任意150对以上的...

【专利技术属性】
技术研发人员：田荣荣，洪小龙，杨呈勇，
申请(专利权)人：广东腾飞基因科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：广东,44