【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】生物标志物组合物和方法交叉参考本申请要求2011年8月8日提交的美国临时专利申请N0.61/521，333 ；2011年8 月 15 日提交的 N0.61/523，763 ；2011 年 8 月 23 日提交的 N0.61/526，623 ；2011 年 8 月31 日提交的 N0.61/529，726 ;2011 年 9 月 13 日提交的 N0.61/534，352 ;2011 年 9 月 21 日提交的61/537,462 ;2011年10月3日提交的N0.61/542，639 ;2011年10月26日提交的 N0.61/551,674 ;2011 年 11 月 14 日提交的 N0.61/559，676 ;2012 年 3 月 16 日提交的N0.61/612，111 ;和2012年4月3日提交的N0.61/619，803 ;将该申请全部按引用并入本文中作为参考。本申请是2012年6月14日提交的国际专利申请PCT/US2012/042519的部分继续，该国际专利申请要求2011年6月16日提交的美国临时专利申请N0.61/497,895 ；2011年 6 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种方法，其包括: (a)将生物样品接触一种或多种试剂，其中所述一种或多种试剂特异性地结合表5中的一种或多种生物标志物； (b)基于所述生物样品与所述一种或多种试剂的接触检测生物样品中一种或多种生物标志物的存在或水平；和 (C)鉴定包含所述生物样品中检测的所述一种或多种生物标志物的存在或水平的生物印记。2.权利要求1的方法,其中所述一种或多种生物标志物包括选自A33、ABL2、ADAMlO,AFP、ALA、ALIX、ALPL, ApoJ/CLU、ASCA、ASPH(A-1O)、ASPH (DOlP)、AURKB, B7H3、B7H3、B7H4、BCNP、BDNF、CA125(MUC16)、CA-19-9, C-Bir, CD10、CD151、CD24、CD41、CD44、CD46、CD59 (MEM-43)、CD63、CD63、CD66eCEA、CD81、CD81、CD9、CD9、CDA, CDADCU CRMP-2、CRP,CXCLl2、CXCR3、CYFRA21-1、DDX-U DLL4、DLL4、EGFR、Epcam、EphA2、ErbB2、ERG、EZH2、FASL、FLNA、FRT、GAL3、GATA2、GM-CSF, Gro- a、HAP、HER3 (ErbB3)、HSP70、HSPB1、hVEGFR2、iC3b、IL-1B、IL6R、IL6Unc、IL7Ra/CD127、IL8、INSIG-2、整联蛋白、KLK2、LAMN、乳腺珠蛋白、M-CSF、MFG-E8、MIF、MISRI1、MMP7、MMP9、MUC1、MucU MUC17、MUC2、Ncam、NDUFB7、NGAL, NK-2R (C-21)、NT5E (CD73)、p53、PBP、PCSA, PCSA, PDGFRB, PIMl、PRL, PSA、PSA、PSMA,PSMA, RAGE、RANK、ReglV、RUNX2、S100-A4、s印rase/FAP、SERPINB3、SIM2 (C-15)、SPARC、SPC、SPDEF、SPPU STEAP、STEAP4, TFF3、TGM2、--ΜΡ-1、TMEM211、Trai 1-R2, Trail_R4、TrKB(poly)、Trop2、TsglOl、TWEAK、UNC93A、VEGFA、wnt-5a(C-16)及其组合的蛋白质。3.权利要求2的方法，其中所述一种或多种生物标志物进一步包括选自⑶9、⑶63、CD81、PCSA、MUC2、MFG-E8及其组合的蛋白质。4.权利要求1的方法,其中所述一种或多种生物标志物选自miR-148a、miR-329、miR-9、miR-378*、miR-25、miR`-614、miR-518c*、miR-378、miR-765、let-7f-2*、miR-574_3p、miR-497、miR-32、miR-379、miR_520g、miR-542_5p、miR-342_3p、miR-1206、miR-663、miR-222及其组合。5.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物选自hsa-miR-877*、hsa-miR-593、hsa-miR-595、hsa-miR-300、hsa-miR-324_5p、hsa-miR-548a_5p、hsa-miR-329、 hsa-miR-550、 hsa-miR-886_5p、 hsa-miR-603、 hsa-miR-490_3p、hsa-miR-938、hsa-miR-149、hsa-miR-150、hsa-miR-1296、hsa-miR-384、hsa_miR-487a、hsa-miRPlus-C1089、hsa-miR-485_3p、hsa-miR-525_5p 及其组合。6.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物选自miR-588、miR-1258、miR-16-2*、miR-938、miR-526b、miR-92b*、let-7d、miR-378*、miR-124、miR-376c、miR-26b、miR-1204、miR-574_3p、miR-195、miR-499_3p、miR-2110、miR-888 及其组合。7.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括选自A33、ADAMlO、AMACR、ASPH(A-1O)、AURKB, B7H3、CA125、CA-19-9, C-Bir, CD24、CD3、CD41、CD63、CD66e CEA,CD81、CD9、CDADCl、CSA、CXCLl2、DCRN、EGFR、EphA2、ERG、FLNA、FRT、GAL3、GM-CSF、Gro- a、HER3 (ErbB3)、hVEGFR2、IL6Unc、整联蛋白、乳腺珠蛋白、MFG-E8、MMP9、MUC1、MUC17、MUC2、NGAL, NK-2R(C-21)、NY-ESO-U PBP、PCSA、PIMl、PRL, PSA、PSIP1/LEDGF、PSMA, RANK、S100-A4、s印rase/FAP、SIM2(C-15)、SPDEF、SSX2、STEAP、TGM2、--ΜΡ-1、Trai1-R4,TsglOl、TWEAK、UNC93A、VCAN、XAGE-1 及其组合的蛋白质。8.权利要求7的方法，其中所述一种或多种生物标志物进一步包括选自EpCAM、⑶81、PCSA、MUC2、MFG-E8及其组合的蛋白质。9.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物选自let-7d、miR-148a、miR-195、miR-25、miR_26b、miR-329、miR_376c、miR-574_3p、miR-888、miR-9、miR1204、miR-16-2*、miR-497、miR-588、miR_614、miR-765、miR92b*、miR_938、let_7f-2*、miR-300、miR-523、miR-525_5p、miR-l 182、miR_l244、miR-520d_3p、miR-379、let-7b、miR-125a_3p、miR-1296、miR-134、miR-149、miR-150、miR-187、miR-32、miR-324_3p、miR-324_5p、miR-342_3p、miR-378、miR-378*、miR-384、miR-451、miR-455_3p、miR-485_3p、miR_487a、miR-490_3p、miR-502_5p、miR-548a_5p、miR-550、miR-562、miR-593、miR-593*、miR-595、miR-602、miR-603、miR-654_5p、miR-877*、miR-886_5p、miR-125a_5p、miR-140_3p、miR-192、miR_196a、miR-2110、miR-212、miR-222、miR-224*、miR_30b*、miR-499_3p、miR-505*及其组合。10.权利要求1的方法,其中所述一种或多种生物标志物包括选自A33、ADAM10、ALIX、AMACR、ASCA、ASPH(A-1O)、AURKB, B7H3、BCNP, CA125、CA-19-9, C-Bir (鞭毛蛋白)、CD24、CD3、CD41、CD63、CD66e CEA、CD81、CD9、CDADCl、CRP、CSA、CXCLl2, CYFRA21-1、DCRN、EGFR、EpCAM、EphA2、ERG、FLNA, GAL3、GATA2、GM-CSF, Gro a、HER3 (ErbB3)、HSP70、hVEGFR2、iC3b、IL-1B、IL6Unc、IL8、整联蛋白、KLK2、乳腺珠蛋白、MFG-E8、MMP7、MMP9、MS4A1、MUC1、MUC17、MUC2、NGAL, NK_2R(C_21)、NY-ESO-U p53、PBP、PCSA、PIMU PRL, PSA、PSMA, RANK、RUNX2,S100-A4,seprase/FAP,SERPINB3,SIM2(C-15)、SPC、SPDEF、SSX2、SSX4、STEAP、TGM2、TIMP-U TRAIL R2、Trail_R4、IsglO1、TWEAK、VCAN、VEGF A、XAGE 及其组合的蛋白质。11.权利要求10的方法，其中所述一种或多种生物标志物进一步包括选自EpCAM、CD81、PCSA、MUC2、MFG-`E8及其组合的蛋白质。12.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物选自hsa-miR-451、hsa-miR-223、 hsa-miR-593*、 hsa-miR-1974、 hsa-miR-486_5p、 hsa_miR-19b、hsa_miR-320b、hsa_miR-92a、hsa-miR-21、hsa-miR-675*、hsa-miR-16、hsa-miR-876_5p、hsa-miR-144、hsa-miR-126、hsa-miR-137、hsa-miR-1913、hsa-miR-29b_l木、hsa_miR-15a、hsa-miR-93、hsa-miR-1266 及其组合。13.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括一种或多种选自CD9、CD63、CD81、MMP7、EpCAM及其组合的蛋白质。14.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括选自STAT3、EZH2、p53、MACCl、SPDEF、RUNX2、YB-1、AURKA、AURKB 及其组合的蛋白质。15.权利要求1的方法,其中所述一种或多种生物标志物包括选自PCSA、Muc2、AdamlO及其组合的蛋白质。16.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括选自碱性磷酸酶(AP)、⑶63、1^001、神经元特异性烯醇化酶、獻?18、0册&86、抑制素、^451?0、热休克蛋白27、胶原蛋白I1、层粘连蛋白Bl/bl、Gail、CDw75、bcl-XL、层粘连蛋白-S、铁蛋白、CD21、ADP-核糖基化因子(ARF-6)及其组合的蛋白质。17.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括选自⑶56/NCAM-1、热休克蛋白 27/hsp27、CD45R0、MAP IB, MyoDl、CD45/T200/LCA、CD3 ζ、层粘连蛋白 _s、bcl-XL、Radl8、Gail、胸苷酸合成酶、碱性磷酸酶(AP)、CD63、MMP-16/MT3-MMP、细胞周期蛋白C、神经元特异性烯醇化酶、SIRP al、层粘连蛋白Bl/bl、淀粉样蛋白β (APP)、SODD(死亡结构域的沉默子)工0037、6&13-142?-2、^6、肥大细胞糜蛋白酶、￥谷氨酰半胱氨酸合成酶(GCS)及其组合的蛋白质。18.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括选自碱性磷酸酶(AP)、⑶56 (NCAM)、⑶-3 ζ、MapIb、14.3.3pan、细丝蛋白、血小板反应蛋白及其组合的蛋白质。19.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括Ago2。20.权利要求19的方法，其中所述一种或多种生物标志物进一步包括一种或多种微RNA。21.权利要求1的方法,其中所述一种或多种生物标志物包括MMP7。22.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括选自ADAM-10、BCNP、⑶9、EGFR、EpCam, IL1B、KLK2、MMP7、p53、PBP、PCSA、SERPINB3、SPDEF、SSX2、SSX4 及其组合的蛋白质。23.权利要求1的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括选自EGFR、EpCAM、KLK2、PBP、SPDEF、SSX2、SSX4及其组合的蛋白质。24.—种方法,其包括: (a)将生物样品接触一种或多种试剂，其中所述生物样品包含一种或多种微囊泡，并且进一步其中所述一种或多种试剂包括特异性结合表5中的一种或多种生物标志物的第一试剂和第二试剂； (b)基于所述生物样品与所述第一和第二试剂的接触检测所述一种或多种微囊泡的存在或水平； (C)鉴定包括所述生物样品中检测的所述一种或多种微囊泡的存在或水平的生物印记。25.权利要求24的方法，其中所述第一试剂包括捕获剂和所述第二试剂包括检测剂，其选自表38、40-44、50、51、55-67和72-74任一个中的一个或多个捕获剂和检测剂对。26.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括乳腺珠蛋白-MFG-E8、SIM2-MFG-E8 和 NK-2R-MFG-E8 的结合剂对。27.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括整联蛋白-MFG-E8、NK-2R-MFG-E8 和 Gal3_MFG_E8 的结合剂对。28.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括AURKB、A33、CD63、Gro-a和整联蛋白的捕获剂；以及MUC2、PCSA和CD81的检测剂。29.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括AURKB、⑶63、FLNA、A33、Gro-a、整联蛋白、CD24、SSX2 和 SM2 的捕获剂；以及 MUC2、PCSA、CD81、MFG_E8和EpCam的检测剂。30.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括EpCam-MMP7、PCSA-MMP7 和 EpCam-BCNP 的结合剂对。31.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括EpCam-MMP7、PCSA-MMP7、EpCam-BCNP, PCSA-ADAM10 和 PCSA-KLK2 的结合剂对。32.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括EpCam-MMP7、PCSA-MMP7、EpCam-BCNP, PCSA-ADAM10、PCSA-KLK2、PCSA-SPDEF、CD81-MMP7、PCSA-EpCam,MFGE8-MMP7 和 PCSA-1L-8 的结合剂对。33.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括EpCam-MMP7、PCSA-MMP7、EpCam-BCNP, PCSA-ADAM10 和 CD81-MMP7 的结合剂对。34.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括ADAM-10、BCNP,CD9、EGFR、EpCam、IL1B、KLK2、MMP7、p53、PBP、PCSA、SERPINB3、SPDEF、SSX2 和 SSX4 中一个或多个的捕获剂以及EpCam或PCSA的检测剂。35.权利要求25的方法，其中所述一个或多个捕获剂和检测剂对包括选自以下的结合剂对:EpCAM-EpCAM、EpCAM_KLK2、EpCAM-PBP、EpCAM-SPDEF、EpCAM_SSX2、EpCAM_SSX4、EpCAM-ADAM-10、EpCAM_SERPINB3、EpCAM-PCSA、EpCAM_p53、EpCAM_MMP7、EpCAM-1LlB、EpCAM-EGFR、EpCAM_CD9、EpCAM-BCNP、KLK2_EpCAM、KLK2-KLK2、KLK2-PBP、KLK2-SPDEF、KLK2-SSX2、KLK2-SSX4、KLK2-ADAM-10、KLK2-SERPINB3、KLK2-PCSA、KLK2_p53、KLK2-MMP7、KLK2-1L1B、KLK2-EGFR、KLK2-CD9、KLK2-BCNP、PBP-EpCAM、PBP-KLK2、PBP-PBP, PBP-SPDEF、PBP-SSX2、PBP-SSX4、PBP-ADAM-10, PBP-SERPINB3、PBP-PCSA、PBP-p53、PBP-MMP7、PBP-1L1B、PBP-...
【专利技术属性】
技术研发人员：K·布朗，T·波洛斯基，D·斯佩特茨勒，
申请(专利权)人：卡里斯生命科学卢森堡控股有限责任公司，
类型：发明
国别省市：
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