一种利用26个Y‑STR基因座对男性个体进行Y‑STR分型的方法和系统技术方案

技术编号:15515930 阅读:108 留言:0更新日期:2017-06-04 07:08
本发明专利技术提供一种利用26个Y‑STR基因座对男性个体进行Y‑STR分型的方法和系统,该方法包括获得所述男性个体的DNA,获得所述DNA 26个Y‑STR基因座的基因型,所述26个Y‑STR基因座为DYS19、DYS385a/b、DYS389I/II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、GATA H4、DYS438、DYS439、DYS460、DYS447、DYS527a/b、DYS617、DYS522、DYS444、DYS508及DYS533;根据所述男性个体26个基因座的基因型获得该个体的Y‑STR分型结果。利用该分型结果可对该男性个体进行家系排查、父权亲权鉴定、男女混合样本中男性成分的检测及多个男性混合样本中男性成分的检测等。

【技术实现步骤摘要】
一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的方法和系统
本专利技术涉及一种分型方法和系统,尤其涉及一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的方法和系统。
技术介绍
串联重复序列(shorttandemrepeat,STR)是广泛存在于人类染色体DNA中的一类多态性遗传标记系统,因其存在范围广(平均16kb中即有一个STR基因座),核心序列小(2-7bp)且扩增产物长度均小于500bp,等位基因位点的数字即代表序列重复的次数。STR基因座的等位基因片断长度集中,故可对多个STR基因座进行复合扩增。复合扩增多个STR基因座,累计鉴别能力可以接近或达到DNA指纹水平。Y染色体为男性特有的染色体,同一父系所有的男性个体都具有相同的Y-STR单倍型。Y-STR检验作为常染色体检验的一种补充手段,对家系排查、父权亲权鉴定、男女混合成分中男性成分的检测及多个男性混合成分的判定具有重要的应用价值,而且因为涉案犯罪行为人90%以上为男性,Y-STR检验在DNA检验中扮演着越来越重要的角色。现在法医DNA技术的作用更多的体现在被动比对方面,把Y-STR检验法引进到侦查学领域破获案件,创立了“Y-STR家系排查法”,可以缩小命案侦查范围,为侦查提出指向性的线索。家系排查指将犯罪现场提取到的Y-STR数据,与一定范围内的家系进行比对,一旦比中,便可以指向犯罪行为人所在家系。目前河南、山东等正在以县(市)为单位建库,以行政村为单元绘制家系图谱,在家系图谱的基础上采集生物样本,开展Y-STR数据库建设工作。通过Y数据库自动化比对,可快速指向犯罪嫌疑人所在家系,缩小侦查范围;快速指向无名尸体所在家系,指明侦查方向;可以排除女性DNA的干扰,获得明确的男性信息,入库自动比对。河南Y库采取“边打边建,以打促建”的方针,已经利用该库成功破获数百起命案积案,颇有成效。专利CN103866019中公开了一种用于法医Y-STR检测的Y-STR荧光复合扩增检验试剂,具体公开了21个Y-STR基因座及扩增引物。然而,其引物的设计使得一些Y-STR基因座的扩增产物排列过于紧密甚至前一个基因座的扩增产物跨到下一个基因座的范围内,造成分型无法判读,另外基因座排布紧密还可能造成等位基因分型标准物在分析时出现串扰、错位从而导致整个结果无法正确分析判读。如何提供一种可解决上述问题的对男性个体进行Y-STR分型的方法和系统成为有待解决的问题。
技术实现思路
本专利技术提供了一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的方法,通过采用特定Y-STR基因座组合以及针对这些基因座设计的特定引物,使得在分型过程中不会出现分型无法判读、分型串扰、错位的问题,能准确地获得男性个体26个Y-STR基因座的基因型,从而为实现对该男性个体进行家系排查、父权亲权鉴定、男女混合成分中男性成分的检测及多个男性混合成分的判定等提供数据支持。本专利技术还提供一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的系统,通过该系统可以实现对男性个体针对上述26个基因座的准确分型。本专利技术还提供了一种复合检测体系,所述检测体系能准确获得男性个体26个Y-STR基因座的基因型。本专利技术还提供了一种检测试剂盒,包括所述的复合检测体系。本专利技术提供的一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的方法,该方法包括:1)获得男性个体的DNA;2)获得所述DNA26个Y-STR基因座的基因型,所述26个Y-STR基因座为DYS19、DYS385a/b、DYS389I/II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、GATAH4、DYS438、DYS439、DYS460、DYS447、DYS527a/b、DYS617、DYS522、DYS444、DYS508及DYS533,包括采用与所述基因座对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤;其中基因座DYS460的扩增引物对应于SEQIDNo.1至SEQIDNo.2的核苷酸序列;基因座DYS389I/II的扩增引物相同,为SEQIDNo.3至SEQIDNo.4的核苷酸序列;基因座DYS390,DYS392,DYS458,DYS437的扩增引物分别对应于SEQIDNo.5至SEQIDNo.12的核苷酸序列;基因座DYS385a/b的扩增引物相同,为SEQIDNo.13至SEQIDNo.14的核苷酸序列;基因座GATA-H4,DYS522,DYS456,DYS391,DYS447,DYS438,DYS448,DYS393,DYS635,DYS439,DYS19,DYS444的扩增引物分别对应于SEQIDNo.15至SEQIDNo.38的核苷酸序列;基因座DYS527a/b的扩增引物相同,为SEQIDNo.39至SEQIDNo.40的核苷酸序列;基因座DYS617,DYS508,DYS533的扩增引物分别对应于SEQIDNo.41至SEQIDNo.46的核苷酸序列;3)根据所述男性个体26个基因座的基因型获得该个体的Y-STR分型结果。在本专利技术的方案中,所述26个基因座是申请人通过对大量男性个体的生存环境、种族起源等进行综合分析获得的。针对上述基因座的引物也是申请人通过大量实验获得的,成功解决了在对男性个体的Y-STR分型过程存在的分型无法判读、分型串扰、错位的问题,同时这些特定Y染色体基因座的组合还能实现对男性个体进行家系排查、父权亲权鉴定、男女混合样本中男性成分来源推断,和/或男男混合样本中男性成分来源推断。进一步的,在本申请的方案中,“获得男性个体的DNA”指的是提取该个体的例如血液、组织等样本中的DNA,或者直接获得含有所述个体DNA的血卡。“所述男性个体的Y-STR分型结果”指的是能用于对该男性个体进行家系排查、父权亲权鉴定、男女混合样本中男性成分来源推断,和/或男男混合样本中男性成分来源推断的Y-STR分型结果。其中男男混合样本中男性成分来源推断指对来自非同一父系家族的男性个体的区分。在本专利技术的一个具体实施方式中,所述引物为荧光标记引物。在本专利技术的另一个具体实施方式中,其中2)还包括在获得扩增产物后,使用遗传分析仪分析该扩增产物,以获得所述27个基因座的基因型的步骤。在本专利技术的方案中,所述遗传分析仪可以是本领域技术人员常规使用的遗传分析仪,例如ABI3130或ABI3500型遗传分析仪,通过ID-X软件或其他GeneMapper软件等分析该PCR扩增产物中所述26个基因座的基因型。本专利技术提供的一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的系统,所述系统包括DNA获取体系,复合检测体系、推断体系;所述DNA获取体系用于获得所述男性个体的DNA;所述复合检测体系用于获得所述DNA26个Y-STR基因座的基因型,并根据该基因型获得该个体的Y-STR分型结果,所述26个Y-STR基因座为DYS19、DYS385a/b、DYS389I/II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、GATAH4、DYS438、DYS439、本文档来自技高网
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一种<a href="http://www.xjishu.com/zhuanli/27/201611082622.html" title="一种利用26个Y‑STR基因座对男性个体进行Y‑STR分型的方法和系统原文来自X技术">利用26个Y‑STR基因座对男性个体进行Y‑STR分型的方法和系统</a>

【技术保护点】
一种利用26个Y‑STR基因座对男性个体进行Y‑STR分型的方法,其特征在于,该方法包括:1)获得所述男性个体的DNA;2)获得所述DNA 26个Y‑STR基因座的基因型,所述26个Y‑STR基因座为DYS19、DYS385a/b、DYS389I/II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、GATA H4、DYS438、DYS439、DYS460、DYS447、DYS527a/b、DYS617、DYS522、DYS444、DYS508及DYS533,包括采用与所述基因座对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤;其中基因座DYS460的扩增引物对应于SEQ ID No.1至SEQ ID No.2的核苷酸序列;基因座DYS389I/II的扩增引物相同,为SEQ ID No.3至SEQ ID No.4的核苷酸序列;基因座DYS390,DYS392,DYS458,DYS437的扩增引物分别对应于SEQ ID No.5至SEQ ID No.12的核苷酸序列;基因座DYS385a/b的扩增引物相同,为SEQ ID No.13至SEQ ID No.14的核苷酸序列;基因座GATA‑H4,DYS522,DYS456,DYS391,DYS447,DYS438,DYS448,DYS393,DYS635,DYS439,DYS19,DYS444的扩增引物分别对应于SEQ ID No.15至SEQ ID No.38的核苷酸序列;基因座DYS527a/b的扩增引物相同,为SEQ ID No.39至SEQ ID No.40的核苷酸序列;基因座DYS617,DYS508,DYS533的扩增引物分别对应于SEQ ID No.41至SEQ ID No.46的核苷酸序列;3)根据所述男性个体26个基因座的基因型获得所述男性个体的Y‑STR分型结果。...

【技术特征摘要】
1.一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的方法,其特征在于,该方法包括:1)获得所述男性个体的DNA;2)获得所述DNA26个Y-STR基因座的基因型,所述26个Y-STR基因座为DYS19、DYS385a/b、DYS389I/II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、GATAH4、DYS438、DYS439、DYS460、DYS447、DYS527a/b、DYS617、DYS522、DYS444、DYS508及DYS533,包括采用与所述基因座对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤;其中基因座DYS460的扩增引物对应于SEQIDNo.1至SEQIDNo.2的核苷酸序列;基因座DYS389I/II的扩增引物相同,为SEQIDNo.3至SEQIDNo.4的核苷酸序列;基因座DYS390,DYS392,DYS458,DYS437的扩增引物分别对应于SEQIDNo.5至SEQIDNo.12的核苷酸序列;基因座DYS385a/b的扩增引物相同,为SEQIDNo.13至SEQIDNo.14的核苷酸序列;基因座GATA-H4,DYS522,DYS456,DYS391,DYS447,DYS438,DYS448,DYS393,DYS635,DYS439,DYS19,DYS444的扩增引物分别对应于SEQIDNo.15至SEQIDNo.38的核苷酸序列;基因座DYS527a/b的扩增引物相同,为SEQIDNo.39至SEQIDNo.40的核苷酸序列;基因座DYS617,DYS508,DYS533的扩增引物分别对应于SEQIDNo.41至SEQIDNo.46的核苷酸序列;3)根据所述男性个体26个基因座的基因型获得所述男性个体的Y-STR分型结果。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述引物为荧光标记引物。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,其中2)还包括在获得扩增产物后,使用遗传分析仪分析该扩增产物,以获得所述26个基因座的基因型的步骤。4.一种利用26个Y-STR基因座对男性个体进行Y-STR分型的系统,其特征在于,所述系统包括DNA获取体系,复合检测体系、推断体系;所述DNA获取体系用于获得所述男性个体的DNA;所述复合检测体系用于获得所述DNA26个Y-STR基因座的基因型,并根据该基因型获得该个体的Y-STR分型结果,所述26个Y-STR基因座为DYS19、DYS385a/b、DYS389I/II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、GATAH4、DYS438、DYS439、DYS460、DYS447、DYS527a/b、DYS617、DYS522、DYS444、DYS508及DYS533,获得所述26个基因座的基因型的过程包括采用与所述基因座对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤;其中基因座DYS460的扩增引物对应于SEQIDNo.1至SEQIDNo.2的核苷酸序列;基因座DYS389I/II的扩增引物相同,为SEQIDNo.3至SEQIDNo.4的核苷酸序...

【专利技术属性】
技术研发人员:莫晓婷白雪张建孙辉姚伊人李万水赵兴春
申请(专利权)人:公安部物证鉴定中心
类型:发明
国别省市:北京,11

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