一种病毒基因组引物及用该引物检测病毒基因组的方法技术

技术编号:13505710 阅读:164 留言:0更新日期:2016-08-10 13:15
本发明专利技术涉及一种引物,尤其是涉及一种病毒基因组引物及运用其检测病毒基因组的方法。一种病毒基因组引物,包括如SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:8所示的八条核苷酸序列。采用了本发明专利技术所述的病毒基因组的引物,克服了现有技术中采用传统随机引物RP检测灵敏度低的缺点,通过分析NCBI病毒库中所有参考病毒基因组序列,筛选出能够广泛识别参考病毒基因组的寡核苷酸序列,并在该序列的基础上建立了一种病毒基因组检测技术,既满足广泛识别病毒基因组的最基本的需要,又达到提高检测病毒基因组的灵敏度的更高目标。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种引物,尤其是涉及一种病毒基因组引物及运用其检测病毒基因组的方法。
技术介绍
2009年,Victoria,J.G等人在国外著名杂志Journal of Virology上发表了一篇关于新型肠道病毒发现的文章(Metagenomic analyses of viruses in stool samplesfrom children with acute flaccid paralysis.J Virol,2009.83(9):p.4642-51),公开了一种能够非特异识别和扩增未知病毒基因组的方法,该方法利用随机引物RP能够识别所有病毒的核苷酸序列的特点,对不明病因的病例标本进行检测,从而对不明疾病的病因进行诊断,但是利用随机引物RP的未知病毒检测方法的灵敏度普遍偏低,只能检测到至少含有105个病毒颗粒的临床样本,这就极大地限制了该方法直接在临床诊断中的应用,究其原因,主要是由于随机引物RP中二聚体的广泛大量存在,大大降低了随机引物RP中有效引物的浓度。有鉴于此,特提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术提供一种可以广谱的识别和扩增病毒基因组的引物以及包含该引物的试剂本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种病毒基因组引物,其特征在于,包括如SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:8所示的八条核苷酸序列。

【技术特征摘要】
1.一种病毒基因组引物,其特征在于,包括如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:8所示的八条核苷酸序列。2.权利要求1所述的病毒基因组引物在检测病毒基因组方面的应用。3.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的病毒基因组引物。4.权利要求3所述的试剂盒在检测病毒基因组方面的应用。5.用权利要求1所述的病毒基因组引物检测病毒基因组的方法,其特征在于,包括如下步骤:1)合成如权利要求1所述的病毒基因组引物;2)对样本前处理和消化;用离心机离心5分钟,取上清液用0.22μm的滤器过滤,将得到的样本采用70U的DNase I,8U的TURBO DNase和50μg的RNase A在37℃温度下消化90分钟;3)第一链的合成;提取样本中包含的DNA病毒/RNA病毒的核酸成分,溶解到20μL无核酶的去离子水中,生成核酸提取液;同时将提取到的核酸提取液,用权利要求1所述的病毒基因组引...

【专利技术属性】
技术研发人员:李仁清黄芳吴疆庞星火贺雄邓瑛马彦刘秀颖龚成陈萌邹清华
申请(专利权)人:北京市疾病预防控制中心
类型:发明
国别省市:北京;11

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