一种棉花黄萎病功能基因的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种棉花黄萎病功能基因标记及其应用,属于农作物分子遗传育种学领域。本发明专利技术通过BAC测序，获得了一个无完整阅读框的表面受体蛋白基因，利用该基因与其他已知有黄萎病抗性作用基因序列有差异的位置设计了9条基因特异引物，用于扩增黄萎病抗感材料的DNA。其中只有一对引物Gbvds1549在所有感病材料中扩增出长度为1549bp的片段，核苷酸序列如SEQIDNO.1所示，但是在抗病材料中没有扩增产物。同时在此基础上开发了功能分子标记的方法。通过检测该功能分子标记，可以准确检测不同棉花品种或材料的黄萎病抗性，可应用于筛选棉花杂交转育后代植株，提高选育效率，显著节约育种筛选成本，获得黄萎病抗性较好的材料。

【技术实现步骤摘要】
一种棉花黄萎病功能基因的分子标记及其应用一、
本专利技术提供了一种棉花黄萎病功能基因的分子标记及其应用,属于农作物分子遗传育种学领域。可以准确检测黄萎病抗感材料，可应用于筛选棉花杂交转育后代植株,属于生物
二、
技术介绍
棉花黄萎病为土传病害，可造成蕾、铃的大量脱落，发病严重时脱落成光杆，甚至死亡，使棉花减产20-60％，是中国棉花生产最主要病害。到目前为止，尚无有效的防治药剂，只能依靠种植抗病品种为主的综合防治措施(简桂良,邹亚飞,马存.棉花黄萎病连年流行的原因及对策.中国棉花,2003,30:13-14；张保龙,承鸿良,杨郁文.棉花抗黄萎病研究进展.2012,中国农业科学技术出版社)。但由于黄萎病致病机理复杂且棉花主要抗性资源主要存在亚洲棉和海岛棉等野生种质资源中，给抗病性鉴定与品种选育造成极大的障碍。容易导致后代材料选择不准确，育成品种抗性不稳定，产量、纤维等优良性状难以聚合，选育效率低下等问题。因此，发掘与黄萎病抗性紧密连锁的分子标记，利用有效可靠分子标记辅助育种可以加快育种进程，提高选择效率。随着棉花分子标记技术的发展，棉花高密度遗传连锁图谱的构建，获得了一些与抗黄萎病连锁的可用于分子标记辅助育种的选择标记。目前利用陆地棉的杂交群体，以及陆地棉和海岛棉种间杂交群体，已经获得了100多个黄萎病抗性相关的QTL，除了第6、10、12和18条染色体外，这些QTL分布于其余所有的染色体上(BolekY,El-ZikKM,PepperAE,BellAA,MagillCW,etal.Mappingofverticilliumwiltresistancegenesincotton.PlantSci,2005,168:1581–1590；DuWS,DuXM,MaZY(2004)StudiesonSSRmarkersofresistancegeneofVerticilliumwiltincotton.JNorthwestSciTechUnivAgriandFor,2004,3:20–24；GaoYQ,NieYC,ZhangXL.QTLmappingofgenesresistanttoVerticilliumwiltincotton.CottonSci,2003,2:73–78；FangH,ZhouHP,SanogoS,FlynnR,PercyRG,etal.QuantitativetraitlocusmappingforVerticilliumwiltresistanceinabackcrossinbredlinepopulationofcotton(Gossypiumhirsutum×Gossypiumbarbadense)basedonRGA-AFLPanalysis.Euphytica,2013,194:79–91；WangHM,LinZX,ZhangXL,ChenW,GuoXP,etal.MappingandquantitativetraitlocianalysisofVerticilliumwiltresistancegenesincotton.JIntegrPlantBiol,2008,2:174–182；YangC,GuoWZ,LiGY,GaoF,LinSS,etal.QTLsmappingforVerticilliumwiltresistanceatseedlingandmaturitystagesinGossypiumbarbadenseL.PlantSci,2008,174:290–298；ZhenR,WangXF,MaZY,ZhangGY,WangX.ASSRmarkerlinkedwiththegeneofVerticilliumwiltresistanceinGossypiumbarbadense.CottonSci,2006,5:269–272；JiangF,ZhaoJ,ZhuoL,GuoWZ,ZhangTZ.MolecularmappingofVerticilliumwiltresistanceQTLclusteredonchromosomesD7andD9inuplandcotton.SciChinaSerC(lifeSci),2009,9:872–884；NingZY,ZhaoR,ChenH,AiNJ,ZhangX,etal.Moleculartaggingofamajorquantitativetraitlocusforbroad-spectrumresistancetoVerticilliumwiltinuplandcottoncultivarPrema.CropSci,2013,53:2304–2312；WangFR,LiuRZ,WangLM,ZhangCY,LiuGD,etal.MolecularmarkerofVerticilliumresistanceinuplandcotton(GossypiumhirsutumL.)cultivarandtheireffectsonassistedphenotypicselection.CottonSci,2007,6:424–430；YangC,GuoWZ,ZhangTZ.QTLmappingforresistancetoVerticilliumwilt,fiberqualityandyieldtraitsinuplandcotton(GossypiumhirsutumL).MolPlantBreed,2007,5(6):797–805)。这些研究结果表明棉花黄萎病抗性位点定位与黄萎病菌菌系和棉花生长时期相关(Wangetal.,2008；Yangetal.,2008；Yangetal.,2007)。分子标记辅助育种技术在棉花抗黄萎病育种方面的应用较少，主要原因是棉花抗黄萎病机理复杂，多倍体杂交导致后代性状难以稳定，抗病性状鉴定稳定性和重复性一般，导致选育过程中容易出现材料当选或淘汰盲目性较大，以及育种亲本和杂交后代材料鉴定结果不准确。功能标记是根据功能基因内部引起表型性状变异的多态性基序开发出来的一种新型分子标记。由于这类标记来自基因内的功能性基序，因此这类标记不需要进一步验证就可以在不同的遗传背景下确定目标等位基因的有无。与传统遗传标记相比在应用上具有更大的优势。首先，标记来源于目标基因，与其共分离，所以能够避免由于重组交换而产生的选择误差，在群体的目标基因检测时更加有效；另外，由于功能基因标记是直接来自基因位点上决定功能的多态性基序，因此一旦功能标记被开发出来，不需要通过进一步验证就可以在多种不同的遗传背景下应用；对人工育种群体和自然群体均有效；其次，由于是来源于基因内部，直接反映目标性状表现，因此利用回交转育进行优良性状的转移时，功能标记的应用可以更好的避免连锁累赘，减少供体不益基因向受体的导入(AndersenJR,LübberstedtT.Functionalmarkersinplants.TrendsPlantSci,2003,8:554-560)。根据小麦粒重关键基因细胞壁结合的转化酶TaCwi-A1开发的功能标记能够较好地区分小麦千粒重的大小，可用于粒重的分子标记辅助选择(相吉山，穆培本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种棉花黄萎病功能基因的分子标记，其特征在于：该分子标记的引物Gbvds1549：左端引物序列为: TTGAGCAATTGACAAGAATAGAGCT右端引物序列为: TAGTAATATTGGTCATTATTTGC。

【技术特征摘要】
1.一种棉花黄萎病功能基因的分子标记的应用，其特征在于：用分子标记引物Gbvds1549：左端引物序列为:TTGAGCAATTGACAAGAATAGAGCT右端引物序列为:TAGTAATATTGGTCATT...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨郁文，张保龙，陈天子，凌溪铁，刘廷利，王金彦，
申请(专利权)人：江苏省农业科学院，
类型：发明
国别省市：江苏;32