【技术实现步骤摘要】
高通量测序文库及其构建方法
本专利技术涉及高通量测序领域,具体而言,涉及一种高通量测序文库及其构建方法。
技术介绍
基因突变的方式有多种,包括SNP、插入、缺失、融合等情况。其中SNP、插入和缺失突变类型往往从DNA水平上就可以检测得到,而发生融合突变通常需要在RNA水平上才能检测到。目前,针对DNA水平(SNP、插入、缺失)的基因突变检测方法主要有ARMS(突变扩增阻滞系统)和Sanger测序法。ARMS:利用PCR引物的3’端末位碱基必须与其模板DNA互补才能有效扩增的原理,设计等位基因特异性PCR扩增引物,在严格的条件下,只有在引物3’碱基与模板碱基互补配对时才能出现目的PCR扩增带,从而检测出突变。该法检测样本有限,易受污染,且假阳性率高。Sanger测序法:依据双脱氧末端终止法,反应体系中合成以共同引物为5’端,以双脱氧碱基为3’端的一系列长度不等的核酸片段。根据片段3’端的双脱氧碱基,便可依次阅读合成片段的碱基排列顺序。该法灵敏度较低,且实验操作较为复杂、实验周期较长、易受污染,并且检测样本数据有限。针对RNA水平(融合)的基因突变的检测方法主要有RT-PCR法和FISH(荧光原位杂交技术)。RT-PCR法:RT-PCR法一般分为两步:先将待检测标本的mRNA逆转录为cDNA,再结合特异性引物对目标片段进行荧光PCR扩增,根据扩增片段的大小来检测是否存在融合。该法操作复杂,易受污染,检测样本有限,只能检测已知突变类型。FISH:是利用荧光标记的特异核酸探针与细胞内相应的靶分子杂交,通过在荧光显微镜或共聚焦激光扫描仪下观察荧光信号,来确定与特异探 ...
【技术保护点】
一种高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:S1,利用引物混合物对多个目标区域进行多重PCR,得到多个目标片段;S2,对多个所述目标片段进行接头连接,得到多个带接头的目标片段;以及S3,对多个所述带接头的目标片段进行乳液PCR,得到所述高通量测序文库;其中,所述引物混合物为cDNA引物混合物和/或DNA引物混合物;当所述混合引物为cDNA引物混合物时,所述cDNA引物混合物包括SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的第1对引物以及SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的第2对引物;当所述混合引物为DNA引物混合物时,所述DNA引物混合物包括SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示的第3对引物以及SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示的第4对引物。
【技术特征摘要】
1.一种高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:S1,利用引物混合物对多个目标区域进行多重PCR,得到多个目标片段;S2,对多个所述目标片段进行接头连接,得到多个带接头的目标片段;以及S3,对多个所述带接头的目标片段进行乳液PCR,得到所述高通量测序文库;其中,所述引物混合物为cDNA引物混合物,或者所述引物混合物为cDNA引物混合物和DNA引物混合物;当所述引物混合物为cDNA引物混合物时,所述cDNA引物混合物包括SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示的第1对引物以及SEQIDNO:3和SEQIDNO:4所示的第2对引物;当所述引物混合物为DNA引物混合物时,所述DNA引物混合物包括SEQIDNO:5和SEQIDNO:6所示的第3对引物以及SEQIDNO:7和SEQIDNO:8所示的第4对引物。2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,当所述引物混合物为DNA引物混合物时,所述DNA引物混合物还包括SEQIDNO:9和SEQIDNO:10所示的第5对引物、SEQIDNO:11和SEQIDNO:12所示的第6对引物以及SEQIDNO:13和SEQIDNO:14所示的第7对引物。3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,当所述引物混合物为DNA引物混合物时,所述DNA引物混合物还包括SEQIDNO:15和SEQIDNO:16所示的第8对引物、SEQIDNO:17和SEQIDNO:18所示的第9对引物、SEQIDNO:19和SEQIDNO:20所示的第10对引物、SEQIDNO:21和SEQIDNO:22所示的第11对引物、SEQIDNO:23和SEQIDNO:24所示的第12对引物、SEQIDNO:25和SEQIDNO:26所示的第13对引物以及SEQIDNO:27和SEQIDNO:28所示的第14对引物。4.根据权利要求1至3中任一项所述的构建方法,其特征在于,当所述引物混合物为DNA引物混合物时,所述DNA引物混合物还包括SEQIDNO:29和SEQIDNO:30所示的第15对引物、SEQIDNO:31和SEQIDNO:32所示的第16对引物、SEQIDNO:33和SEQIDNO:34所示的第17对引物、SEQIDNO:35和SEQIDNO:36所示的第18对引物、SEQIDNO:37和SEQIDNO:38所示的第19对引物、SEQIDNO:39和SEQIDNO:40所示的第20对引物以及SEQIDNO:41和SEQIDNO:42所示的第21对引物。5.根据权利要求4所述的构建方法,其特征在于,当所述引物混合物为DNA引物混合物时,所述DNA引物混合物还包括SEQID...
【专利技术属性】
技术研发人员:曹志生,李宗文,张宝亮,张兰英,丁雪,宋超,孟雪红,魏龙刚,尹静妮,刘聪,
申请(专利权)人:天津诺禾致源生物信息科技有限公司,
类型:发明
国别省市:天津;12
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