扩增子文库的构建方法技术

技术编号:11399404 阅读:201 留言:0更新日期:2015-05-03 12:49
本发明专利技术公开了一种扩增子文库的构建方法。该构建方法包括以下步骤:S1,对目的片段进行扩增,得到富集目的片段;以及S2,对富集的目的片段进行片段化文库构建,得到扩增子文库;其中,步骤S1包括以下步骤:S11,对目的片段的扩增模板进行定量;S12,对目的片段的扩增引物的退火温度进行固定;以及S13,利用扩增引物在退火温度下对目的片段进行扩增,得到富集目的片段。上述构建方法通过对来自于不同环境的核酸样本进行准确定量扩增体系中的模板量,使得不同样本间目的片段的扩增效率相当,进而降低测序数据的波动性;通过对所用引物的退火温度进行优化,降低扩增子文库中的非特异扩增子的比例,提高了扩增子文库的合格率。

【技术实现步骤摘要】
扩增子文库的构建方法
本专利技术涉及高通量测序领域,具体而言,涉及一种扩增子文库的构建方法。
技术介绍
生命体遗传信息的快速获得对于生命科学的研究有着十分重要的意义。第一代测序仪对电泳分离技术的依赖,使其难以进一步提高分析的速度和并行化程度,也难以通过微型化降低测序成本。经过不断的技术开发和改进,21世纪初,以Roche454技术、illumina公司的GenomeAnalyzer技术和ABI公司的Solid技术为标记的第二代测序技术诞生了。第二代技术大大降低了测序成本,还大幅度提高了测序速度并保持了高准确性。其中,illumina公司的第一台测序仪于2006年问世,之后开发出来一系列的测序仪,如Hiseq2000、Hiseq2500、Miseq、HiseqX等,在准确性、通量、成本和速度方面表现更优秀,而使其成为全球使用量最大的第二代测序仪。在第二代测序平台不断完善的同时,以对单分子DNA进行非PCR测序为主要特征的第三代测序技术也初显端倪。但由于其关键技术问题尚待解决,目前还未得到广泛应用。环境中微生物的群落结构和多样性是微生物生态学的研究热点。微生物多样性的研究涉及农业、土壤、本文档来自技高网...
扩增子文库的构建方法

【技术保护点】
一种扩增子文库的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:S1,对目的片段进行扩增,得到富集的目的片段;以及S2,对所述富集的目的片段进行片段化文库构建,得到所述扩增子文库;其特征在于,所述步骤S1包括以下步骤:S11,对所述目的片段的扩增模板进行定量;S12,对所述目的片段的扩增引物的退火温度进行固定;以及S13,利用所述扩增引物在所述退火温度下对所述目的片段进行扩增,得到所述富集目的片段。

【技术特征摘要】
1.一种扩增子文库的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:S1,对目的片段进行扩增,得到富集的目的片段;以及S2,对所述富集的目的片段进行片段化文库构建,得到所述扩增子文库;其特征在于,所述步骤S1包括以下步骤:S11,对所述目的片段的扩增模板进行定量;S12,对所述目的片段的扩增引物的退火温度进行固定;以及S13,利用所述扩增引物在所述退火温度下对所述目的片段进行扩增,得到所述富集目的片段;所述目的片段为16SV4或ITS2,所述16SV4的所述扩增引物为SEQIDNO:1所示的正向引物:GTGCCAGCMGMWGCGGTAA;以及SEQIDNO:2所示的反向引物:GGACTACH...

【专利技术属性】
技术研发人员:王大伟刘运超蒋智李明渊朱海浩胡政
申请(专利权)人:北京诺禾致源生物信息科技有限公司
类型:发明
国别省市:北京;11

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