用于调节基因表达的组合物和方法技术

技术编号:11379691 阅读:88 留言:0更新日期:2015-05-01 00:11
本发明专利技术的方面提供了选择用于激活靶基因的表达的候选寡核苷酸的方法。本发明专利技术的另外的方面提供选择一组寡核苷酸的方法,该组寡核苷酸中富集了激活靶基因的表达的寡核苷酸。另外的方面提供调节基因表达的单链寡核苷酸以及包含这些单链寡核苷酸的组合物和试剂盒。还提供了用于使用这些单链寡核苷酸调节基因表达的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

【技术保护点】
一种选择用于激活靶基因的表达的候选寡核苷酸的方法,该方法包括:在第一核苷酸序列内选择PRC2相关区,其中该第一核苷酸序列定位至第一染色体中该靶基因的5’端上游的50千碱基与该靶基因的3’端下游的50千碱基之间的位置;确定与该PRC2相关区的至少8个连续核苷酸互补的第二核苷酸序列;并且将包含该第二核苷酸序列的单链寡核苷酸选择为该候选寡核苷酸,其中该寡核苷酸具有以下特征中的至少一种:a)序列:5’‑X‑Y‑Z,其中X为任何核苷酸,Y为非为人微小RNA的种子序列的、长度为6个核苷酸的核苷酸序列,并且Z为长度为1至23个核苷酸的核苷酸序列,其中X锚定在该寡核苷酸的5’端上;b)不包含三个或更多个连续鸟苷核苷酸的序列;c)与长度等于该第二核苷酸序列的每个核苷酸序列具有阈值水平以下的序列一致性的序列,这些核苷酸序列处在脱靶基因的5’端上游的50千碱基与该脱靶基因的3’端下游的50千碱基之间;d)与编码RNA的PRC2相关区互补的序列,该RNA形成包含至少两个单链环的二级结构;或e)具有60%以上G‑C含量的序列。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:阿瑟·M·克里格罗梅什·苏布拉马尼安詹姆斯·麦克斯维根珍妮·T·李
申请(专利权)人:RANA医疗有限公司麻省总医院
类型:发明
国别省市:美国;US

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