一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法及试剂技术

技术编号:10326195 阅读:267 留言:0更新日期:2014-08-14 12:41
本发明专利技术公开了一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法及试剂,选取了与目的RNA cDNA大小相近的质粒作为竞争模板对基因拷贝数进行量化。选取不同的模板分别对fRNA和trRNA进行检测,具有通用性强、灵敏度高、特异性强、重复性好等优点,适于不同人群HBV RNA的检测,有望对HBV病毒各阶段的动力学进行更加全面的了解,完善传统检测项目。

【技术实现步骤摘要】
—种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法及试剂
本专利技术属于人乙型肝炎病毒检测
,涉及一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法及试剂。
技术介绍
乙型肝炎病毒(HBV)是一种基因组长度约为3200碱基的DNA病毒,由外膜和核衣壳组成。外膜为由HBsAg组成的病毒包膜 。传统诊断HBV感染的方法主要为从血清中用免疫学方法检测HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBCAg、HBcAb,用免疫组化方法原位检测HBV基因产物及HBV DNA的检测。但是,这些方法不能直观反应肝组织中HBV基因表达的实时状态,蛋白的检测也往往具有滞后性。即使HBV DNA的检测,对大部分处于低复制期或无复制期(肝癌晚期和新生儿期)的隐匿性感染也无法诊断。1999年以来,科学家确立了 HBV血清学标志物fRNA和trRNA,提出新的从血清中检测HBV核酸的方法。
技术实现思路
本专利技术解决的问题在于提供一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法及试剂,该方法适于不同人群HBV fRNA和trRNA的定量检测,具有灵敏度高、特异性强的特点。本专利技术是通过以下技术方案来实现:一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法,包括以下操作:I)第一轮扩增构建fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系:14.Ομ I Η20,10.Ομ I来自待检测对象的核酸提取物,Ι.Ομ I竞争模板19L27,1.5μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1434+,Ομ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1806a, 3.Ομ I 浓度为IOOng/ μ I的引物1808a,5.0 μ I浓度为IOmM的dNTP,2.5 μ I浓度为IOOmM的DTT溶液,10.0 μ 15 X RT/PCR buffer, 1.0μ I RNA 聚合酶;所述的引物1434+ 为:TCTCATCTGCCGGACCGTGT ;所述的引物1806a为:⑴15AGCTC ;所述的引物1808a 为:(T) 15GAAGC ;构建trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系:17.0μ I H20,10.0μ I来自待检测对象的核酸提取物,Ι.Ομ I竞争模板J166 (16),1.5μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1445+,Ομ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1683a, 5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,2.5μ I 浓度为 IOOmM 的 DTT 溶液,10.0 μ 15 X RT/PCR buffer, 1.0μ IRNA聚合酶;所述的引物1445+ 为:GGACCGTGGCACTTCGCTT ;所述的引物1683a 为:(T) 15CGTGG ;将构建的fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系、trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增:50 °C 孵育 20min ;93 °C 变性 lmin40sec ;DNA 扩增为 90 °C 40sec, 53 °C 50sec,70°C 40sec, 35 个循环;70°C 15min 后冷却至 4°C ;2)第二轮扩增构建fRNA第二轮反应体系:31.Ομ I Η20。5.0μ1 第一轮 fRNA 扩增产物,0.75μ1 浓度为 lOOng/μΙ 的引物 1464+,0.75 μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1806a-O,0.75 μ I 浓度为 lOOng/μ I 的引物1808a-, 5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,1.5 μ I 浓度为 50mM 的MgCl2 溶液,5.0 μ I PCR buffer,0.25 μ I Taq DNA 聚合酶;构建trRNA第二轮反应体系:31.75 μ I Η20,5.0μ1 第一轮 trRNA扩增产物,0.75μ1 浓度为 IOOng/μ I 的引物1464+,0.75 μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1683a,5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,l.5μ I 浓度为 50mM 的 MgCl2 溶液,5.0 μ I PCR buffer, 0.25 μ I Taq DNA 聚合酶;所述的引物1464+ 为:TCACCTCTGCACGTCGCATG ;所述的引物1683a为:⑴15CGTGG ;将构建的fRNA第二轮反应体系、trRNA第二轮反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增: 93?变性 lmin40sec ;DNA 扩增为 9(TC 40sec, 53°C 50sec, 70°C 40sec, 35 个循环;70 °C 15min 后冷却至 4°C ;3)琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物在第二轮扩增完成之后,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分离,同时添加一定浓度的竞争模板作为对照;比较扩增产物与竞争模板条带的信号值,如果两者信号值相当则表明待测对象中fRNA、trRNA的浓度与竞争模板的浓度相当;如果两者的信号值不相当,则增加或稀释琼脂糖凝胶电泳时竞争模板的浓度,直到两者信号值相当为至。所述竞争模板克隆的HBVcDNA位点为:19L27:4-1808+ (T) 151,4J166(16):1445-1656+71bpl, 5。一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测试剂盒,包括以下反应体系:fRNA 第一轮 50ul RT/PCR 反应体系:14.Ομ I H20,10.Ομ I来自待检测对象的核酸提取物,Ι.Ομ I竞争模板19L27,1.5μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1434+,Ομ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1806a, 3.0μ I 浓度为IOOng/ μ I的引物1808a,5.0 μ I浓度为IOmM的dNTP,2.5 μ I浓度为IOOmM的DTT溶液,10.0 μ 15 X RT/PCR buffer, 1.0μ I RNA 聚合酶;所述的引物1434+ 为:TCTCATCTGCCGGACCGTGT ;所述的引物1806a为:⑴15AGCTC ;所述的引物1808a为:⑴15GAAGC ;trRNA 第一轮 50ulRT/PCR 反应体系:17.0μ I H20,10.0μ I来自待检测对象的核酸提取物,Ι.Ομ I竞争模板J166 (16),1.5μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1445+,0μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1683a, 5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,2.5μ I 浓度为 IOOmM 的 DTT 溶液,10.0 μ 15 X RT/PCR buffer, 1.0μ IRNA聚合酶;所述的引物1445+ 为:GGACCGTGGCACTTCGCTT ;所述的引物1683a为:⑴15CGTGG ;fRNA第二轮反应体系:31.Ομ I Η20。5.0μ1 第一轮 fRNA 扩增产物,0.75μ1 浓度为 lOOng/μΙ 的引物 1464+,0.75 μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1806a-O,0.75 μ I 浓度为 lOOng/μ I 的引物1808a-, 5.0 μ I 浓度为 本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法,其特征在于,包括以下操作:1)第一轮扩增构建fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系:14.0μl H2O,10.0μl来自待检测对象的核酸提取物,1.0μl竞争模板19L27,1.5μl浓度为100ng/μl的引物1434+,3.0μl浓度为100ng/μl的引物1806a,3.0μl浓度为100ng/μl的引物1808a,5.0μl浓度为10mM的dNTP,2.5μl浓度为100mM的DTT溶液,10.0μl5×RT/PCR buffer,1.0μl RNA聚合酶;所述的引物1434+为:TCTCATCTGCCGGACCGTGT;所述的引物1806a为:(T)15AGCTC;所述的引物1808a为:(T)15GAAGC;构建trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系:17.0μl H2O,10.0μl来自待检测对象的核酸提取物,1.0μl竞争模板J166(16),1.5μl浓度为100ng/μl的引物1445+,3.0μl浓度为100ng/μl的引物1683a,5.0μl浓度为10mM的dNTP,2.5μl浓度为100mM的DTT溶液,10.0μl5×RT/PCR buffer,1.0μl RNA聚合酶;所述的引物1445+为:GGACCGTGGCACTTCGCTT;所述的引物1683a为:(T)15CGTGG;将构建的fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系、trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增:50℃孵育20min;93℃变性1min40sec;DNA扩增为90℃40sec,53℃50sec,70℃40sec,35个循环;70℃15min后冷却至4℃;2)第二轮扩增构建fRNA第二轮反应体系:31.0μl H2O;5.0μl第一轮fRNA扩增产物,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1464+,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1806a‑(),0.75μl浓度为100ng/μl的引物1808a‑,5.0μl浓度为10mM的dNTP,1.5μl浓度为50mM的MgCl2溶液,5.0μl PCR buffer,0.25μl Taq DNA聚合酶;构建trRNA第二轮反应体系:31.75μl H2O,5.0μl第一轮trRNA扩增产物,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1464+,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1683a,5.0μl浓度为10mM的dNTP,1.5μl浓度为50mM的MgCl2溶液,5.0μl PCR buffer,0.25μl Taq DNA聚合酶;所述的引物1464+为:TCACCTCTGCACGTCGCATG;所述的引物1683a为:(T)15CGTGG;将构建的fRNA第二轮反应体系、trRNA第二轮反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增:93℃变性1min40sec;DNA扩增为90℃40sec,53℃50sec,70℃40sec,35个循环;70℃15min后冷却至4℃;3)琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物在第二轮扩增完成之后,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分离,同时添加一定浓度的竞争模板作为对照;比较扩增产物与竞争模板条带的信号值,如果两者信号值相当则表明待测对象中fRNA、trRNA的浓度与竞争模板的浓度相当;如果两者的信号值不相当,则增加或稀释琼脂糖凝胶电泳时竞争模板的浓度,直到两者信号值相当为至。...

【技术特征摘要】
1.一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法,其特征在于,包括以下操作: .1)第一轮扩增 构建fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系: .14.0 μ I H20,10.0 μ I来自待检测对象的核酸提取物,1.0 μ I竞争模板19L27,1.5μ I浓度为IOOng/μ I的引物1434+,3.0μ I浓度为IOOng/μ I的引物1806a,3.0μ I浓度为 IOOng/μ I 的引物 1808a,5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,2.5μ I 浓度为 IOOmM 的 DTT 溶液,10.0 μ 15 X RT/PCR buffer, 1.0 μ I RNA 聚合酶; 所述的引物 1434+ 为:TCTCATCTGCCGGACCGTGT ; 所述的引物1806a为:(T) 15AGCTC ; 所述的引物1808a为:(T) 15GAAGC ; 构建trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系: .17.0μ I H20,10.0μ I来自待检测对象的核酸提取物,1.0μ I竞争模板J166(16),.1.5μ I 浓度为 lOOng/μ I 的引物 1445+,0μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1683a,5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,2.5μ I 浓度为 IOOmM 的 DTT 溶液,10.0 μ 15 X RT/PCR buffer, .1.0μ IRNA聚合酶;所述的引物 1445+ 为:GGACCGTGGCACTTCGCTT ; 所述的引物1683a为:(T) 15CGTGG ; 将构建的fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系、trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增: . 5(TC孵育 20min ;93°C变性 lmin40sec ;DNA扩增为 9(TC 40sec, 53°C 50sec, 70°C .40sec,.35个循环;70°C 15min后冷却至4°C ; .2)第二轮扩增 构建fRNA第二轮反应体系: .31.Ομ I H2O ; 5.Ομ I 第一轮 fRNA 扩增产物,0.75 μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1464+,.0.75 μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1806a-0,0.75 μ I 浓度为 lOOng/μ I 的引物 .1808a-,.5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,l.5μ I 浓度为 50mM 的 MgCl2 溶液,5.0 μ I PCR buffer, 0.25 μ ITaq DNA聚合酶; 构建trRNA第二轮反应体系: .31.75 μ I Η20,5.0μ I 第一轮 trRNA 扩增产物,0.75 μ I 浓度为 lOOng/μ I 的引物.1464+,0.75 μ I 浓度为 IOOng/μ I 的引物 1683a,5.0 μ I 浓度为 IOmM 的 dNTP,l.5μ .1 浓度为 50mM 的 MgCl2 溶液,5.0 μ I PCR buffer, 0.25 μ I Taq DNA 聚合酶; 所述的引物 1464+ 为:TCACCTCTGCACGTCGCATG ; 所述的引物1683a为:(T) 15CGTGG ; 将构建的fRNA第二轮反应体系、trRNA第二轮反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增: . 93 O 变性 lmin40sec ;DNA 扩增为 90 °C 40sec,53 °C 50sec,70 °C 40sec,35 个循环;.70 °C 15min 后冷却至 4°C ; .3)琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物 在第二轮扩增完成之后,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分离,同时添加一定浓度的竞争模板作为对照;比较扩增产物与竞争模板条带的信号值,如果两者信号值相当则表明待测对象中fRNA、trRNA的浓度与竞争模板的浓度相当;如果两者的信号值不相当,则增加或稀释琼脂糖凝胶电泳时竞争...

【专利技术属性】
技术研发人员:张伟李艳红张佳瑞巩丽朱少君韩秀娟姚丽王姝妹
申请(专利权)人:中国人民解放军第四军医大学
类型:发明
国别省市:陕西;61

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