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互花米草种群的SNP标记的分型方法技术

技术编号:8797614 阅读:234 留言:0更新日期:2013-06-13 03:44
本发明专利技术涉及一种互花米草种群的SNP标记的分型方法,本方法根据高通量转录组测序筛选得到目标基因,通过PCR反应、PCR产物测序得到多个SNP位点。再由所有有效的SNP位点组成单倍体型用于分子标记以达到遗传分型。本发明专利技术在一次实验中,即可得到丰富的多态性信息。SNP标记遗传稳定、操作简便,适合用物种溯源。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物
,涉及一种基于SNP标记的互花米草分子标记筛选技术。
技术介绍
互花米草(Spartina alterniflora)是一种原产北美大西洋沿岸的多年生草本植物。因其促淤造陆和消浪护堤作用显著而被许多国家引种。1979年,南京大学从美国东南部的北卡罗莱纳、乔治亚和佛罗里达引种了 3种不同生态型互花米草至福建罗源湾,随后扩大分布至我国海岸潮间带辽宁丹东以南的广大区域,并取得了一定的生态和经济效益。但作为外来物种,其强大的繁殖能力和高大密集的种群特征,对我国沿海滩涂地区的生态系统、生物多样性和水产养殖产生了较大的负面影响,2003年被环保总局列入我国第一批16种外来入侵物种名单。如今中国已成为全球遭受外来物种入侵危害最严重的国家之一,已发现外来入侵物种488种,其中50余种位列世界自然保护联盟公布的全球100种最具威胁外来物种,每年造成的直接经济损失达1200亿元,治理投入更是难以估算。近年来入侵我国的外来生物更是呈现出传入数量增多、传入频率加快、蔓延范围扩大、发生危害加剧、经济损失加重等趋势。因此,生物入侵问题越来越受到世人的关注,包括其成因、危害及控制技术等本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种互花米草种群的SNP标记的分型方法,其特征在于,步骤如下:1)种群调查及取样;2)DNA提取;3)测序;4)筛选种群的目标基因R71;5)根据目标基因R71设计引物,正向引物如序列表中SEQ?ID?NO:1所示;反向引物如序列表中SEQ?IDNO:2所示;6)PCR扩增;7)测序;8)序列拼接、比对,鉴定记录单核苷酸多态性位点。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:陈建群丁静王强许颖吴娟子
申请(专利权)人:南京大学
类型:发明
国别省市:

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