一种大量样本同时分型的方法技术

技术编号:10960214 阅读:182 留言:0更新日期:2015-01-28 12:28
本发明专利技术提供一种大量样本同时分型的方法,能够通用于多种测序平台的SNP筛查和分型。本发明专利技术选用II B型限制性内切酶对提取的基因组DNA进行酶切,并在酶切片段的两端加上接头,且其中一个接头从5'至3'端包括有测序平台的通用测序引物和用于连接的简并序列;另一个接头从5'至3'端包括有测序平台的另一端通用测序引物、用于区分目标样本的Barcode序列和用于连接的简并序列。本发明专利技术能够实现一次建库就能达到多种高通量测序平台兼容的目的,同时利用双Barcode序列的策略可以达到单测序泳道对多达576个样本同时测序分型。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种大量样本同时分型的方法,其特征在于,所述的方法包括有如下的步骤:1)首先提取要进行分析的不同目标样本的基因组DNA;2)选用II B型限制性内切酶对提取的基因组DNA进行酶切,并在酶切片段的两端加上接头,其中一个接头从5'至3'端依次包括有测序平台的通用测序引物和用于连接的简并序列;另一个接头从5'至3'端依次包括有测序平台的另一端通用测序引物、用于区分目标样本的Barcode序列和用于连接的简并序列;3)PCR扩增及目的片段的回收:将步骤2)连接好接头的酶切片段进行PCR扩增,所用的引物与接头的5'的序列结合;4)以步骤3)扩增的目的片段作为底物进行再次扩增,PCR扩增的正向引物为与测序平台的正向测序引物序列相匹配的引物,反向引物为含有样本区分所需Barcode2序列的测序平台的反向向测序引物序列相匹配的引物;5)将步骤4)的扩增产物使用Illumina HiSeq2000进行高通量测序。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:王师焦文倩包振民吕佳付晓腾张玲玲胡晓丽
申请(专利权)人:中国海洋大学
类型:发明
国别省市:山东;37

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